SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"19660439"
 

Sökning: onr:"19660439" > Characterizing Asso...

  • Lindstrom, Sara (författare)

Characterizing Associations and SNP-Environment Interactions for GWAS-Identified Prostate Cancer Risk Markers-Results from BPC3

  • E-artikel/E-kapitelEngelska2011

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2011

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:19660439
  • http://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:umu:diva-104497uri
  • urn:nbn:se:umu:diva-104497urn
  • 10.1371/journal.pone.0017142doi

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Anmärkningar

  • Published
  • gratis
  • Genome-wide association studies (GWAS) have identified multiple single nucleotide polymorphisms (SNPs) associated with prostate cancer risk. However, whether these associations can be consistently replicated, vary with disease aggressiveness (tumor stage and grade) and/or interact with non-genetic potential risk factors or other SNPs is unknown. We therefore genotyped 39 SNPs from regions identified by several prostate cancer GWAS in 10,501 prostate cancer cases and 10,831 controls from the NCI Breast and Prostate Cancer Cohort Consortium (BPC3). We replicated 36 out of 39 SNPs (P-values ranging from 0.01 to 10(-28)). Two SNPs located near KLK3 associated with PSA levels showed differential association with Gleason grade (rs2735839, P = 0.0001 and rs266849, P = 0.0004; case-only test), where the alleles associated with decreasing PSA levels were inversely associated with low-grade (as defined by Gleason grade,8) tumors but positively associated with high-grade tumors. No other SNP showed differential associations according to disease stage or grade. We observed no effect modification by SNP for association with age at diagnosis, family history of prostate cancer, diabetes, BMI, height, smoking or alcohol intake. Moreover, we found no evidence of pair-wise SNP-SNP interactions. While these SNPs represent new independent risk factors for prostate cancer, we saw little evidence for effect modification by other SNPs or by the environmental factors examined.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Schumacher, Fredrick (författare)
  • Siddiq, Afshan (författare)
  • Travis, Ruth C. (författare)
  • Campa, Daniele (författare)
  • Berndt, Sonja I. (författare)
  • Diver, W. Ryan (författare)
  • Severi, Gianluca (författare)
  • Allen, Naomi (författare)
  • Andriole, Gerald (författare)
  • Bueno-de-Mesquita, Bas (författare)
  • Chanock, Stephen J. (författare)
  • Crawford, David (författare)
  • Gaziano, J. Michael (författare)
  • Giles, Graham G. (författare)
  • Giovannucci, Edward (författare)
  • Guo, Carolyn (författare)
  • Haiman, Christopher A. (författare)
  • Hayes, Richard B. (författare)
  • Halkjaer, Jytte (författare)
  • Hunter, David J. (författare)
  • Johansson, Mattias (författare)
  • Kaaks, Rudolf (författare)
  • Kolonel, Laurence N. (författare)
  • Navarro, Carmen (författare)
  • Riboli, Elio (författare)
  • Sacerdote, Carlotta (författare)
  • Stampfer, Meir (författare)
  • Stram, Daniel O. (författare)
  • Thun, Michael J. (författare)
  • Trichopoulos, Dimitrios (författare)
  • Virtamo, Jarmo (författare)
  • Weinstein, Stephanie J. (författare)
  • Yeager, Meredith (författare)
  • Henderson, Brian (författare)
  • Ma, Jing (författare)
  • Le Marchand, Loic (författare)
  • Albanes, Demetrius (författare)
  • Kraft, Peter (författare)
  • Umeå universitetMedicinska fakulteten268483 (utgivare)

Sammanhörande titlar

  • Del av/supplement till:channel record
  • Ingår i:VärdpublikationPLoS ONE6 21932-6203

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • PLoS ONE (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy