SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-158320"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:kth-158320" > Interpreting the hu...

Interpreting the human transcriptome

Werne Solnestam, Beata, 1983- (författare)
KTH, Genteknologi, Joakim Lundeberg
KTH Skolan för bioteknologi (BIO). Genteknologi. (creator_code:org_t)
ISBN 978-91-7595-413-4
Stockholm : KTH Royal Institute of Technology, 2015
Engelska 52 s.
Serie: TRITA-BIO-Report, 1654-2312 ; 2015:1
Läs hela texten (fulltext)
  • Doktorsavhandling (övrigt vetenskapligt)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Människokroppen är uppbyggd av miljarder celler och nästan alla innehåller samma arvsmassa. Trots detta finns det många olika celler med olika funktioner vilket är en följd av vilken del av arvsmassan som cellerna använder, dvs vilka RNA-molekyler som finns i varje cell. Den snabba utvecklingen av sekvenseringstekniker har gjort det möjligt att studera när, var och hur varje RNA-molekyl är uttryckt och att få en djupare förståelse för hur människans celler fungerar.Arbetet som presenteras i denna avhandling fokuserar på analys av RNA-molekyler i människans celler. I artikel I beskriver vi en automatiserad metod för att förbereda cellprov för RNA-sekvensering. Det automatiserade protokollet jämfördes med det manuella protokollet, och vi visade att det automatiserade protokollet överträffade det manuella när det gällde provkapacitet samtidigt som en höga reproducerbarheten behölls. I artikel II undersökte vi effekterna som RNA-molekyler från en del av cellen (cellkärnan) har på den totala mängden uttryckta RNA-molekyler. Vi jämförde RNA från hela cellen och från en del av cellen (cytoplasman) och visade att RNA-molekyler med långa och strukturerade 3'- och 5'-otranslaterade regioner och RNA-molekyler med långa proteinkodande sekvenser tenderade att hållas kvar i cellkärnan till en högre grad. Detta resulterade i en ökad komplexitet av RNA-molekylerna i hela cellen, medan vi i cytoplasma-fraktionen lättare kunde hitta de korta och svagt uttryckta RNA-molekyler. I Artikel III och IV studerar vi RNA-molekyler i människans skelettmuskler. I artikel III visar vi att andelen RNA-molekyler uttryckta i skelettmuskler är väldigt lika mellan muskler och mellan olika personer, men att ett stort antal RNA-molekyler var uttryckta i olika nivåer hos kvinnor och män. Artikel IV beskriver RNA-nivåer som svar på upprepade perioder av uthållighetsträning. Artikel V beskriver en metod för att studera ett fåtal utvalda RNA-molekyler. Vi valde RNA-molekyler vars uttryck är viktigt vid analys av bröstcancerceller, och optimerade metoden för analys av enskilda celler. Vi analyserade cancerceller från blodprov och använde metoden för att titta på RNA-nivåer i enskilda celler från en grupp av celler och visade på skillnader i RNA-nivåer inom gruppen.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)

Nyckelord

Transcriptome
RNA sequencing
high-throughput sequencing
gene expression profiling
multiplex amplification
Bioteknologi
Biotechnology

Publikations- och innehållstyp

dok (ämneskategori)
vet (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Werne Solnestam, ...
Om ämnet
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Medicinska grund ...
och Cell och molekyl ...
Delar i serien
TRITA-BIO-Report ...
Av lärosätet
Kungliga Tekniska Högskolan

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy