Probing 23S ribosomal RNA cleavage sites in coccoid Helicobater pylori.

↓ Direkt till sidans innehåll
↓ Direkt till sidans sekundära innehåll (sidomenyn)

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:liu-25978" > Probing 23S ribosom...

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Monstein, Hans-Jurg,1946-Linköpings universitet,Hälsouniversitetet,Institutionen för hälsa och miljö (författare)

Probing 23S ribosomal RNA cleavage sites in coccoid Helicobater pylori.

Artikel/kapitelEngelska2001

Förlag, utgivningsår, omfång ...

Wiley,2001
printrdacarrier

Nummerbeteckningar

LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:liu-25978
https://urn.kb.se/resolve?urn=urn:nbn:se:liu:diva-25978URI
https://doi.org/10.1046/j.1523-5378.2001.00015.xDOI

Kompletterande språkuppgifter

Språk:engelska
Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

SwePubSwePub

Klassifikation

Ämneskategori:ref swepub-contenttype
Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

Background. Previous studies have revealed that extensive nonrandom fragmentation of ribosomal RNA occurs during conversion of Helicobacter pylori to the coccoid form. The 16S rRNA fragmentation has been characterised in some detail. The aim of the present study was to define corresponding cleavage-sites in the 3'-half of the 23S rRNA molecule. Materials and Methods. Northern blot analysis using 23S rRNA specific antisense riboprobes and a 5'-end- labelled oligonucleotide probe was used to analyse the 23S rRNA fragmentation pattern in coccoid H. pylori type strain CCUG 17874T and H. pylori 26695, for which the genome has been sequenced. A double- stranded cDNA-dependent (ds-cDNA) primer- extension analysis technique using 23S rRNA ds-cDNA and a primer targeting the vicinity of the peptidyl-transferase centre was used to determine cleavage sites at the nucleotide level. Results. We report here the mapping of putative cleavage sites within domains IV and V, enclosing the peptidyl transferase centre, in the 3'-half of the 23S rRNA molecule. Three cleavage sites were located in domain IV. Two other cleavage sites were located in the peptidyl transferase centre, and one presumptive multiple-break site between helices 77 and 78 in domain V. The DNA motifs were different from the postulated A + U rich single-strand cleavage sites recognised by RNase E, which has been implicated in rRNA degradation in Escherichia coli. Conclusions. The present analysis suggests that a hitherto unknown mechanism is responsible for the nonrandom fragmentation of rRNA in coccoid H. pylori, which may have important consequences for the growth, and survival of the bacterium.

Ämnesord och genrebeteckningar

23S rRNA cleavage sites
Coccoid Helicobacter pylori
Ds-cDNA primer extension
MEDICINE
MEDICIN

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

de la Cour, CD (författare)
Jonasson, Jon,1942-Östergötlands Läns Landsting,Linköpings universitet,Hälsouniversitetet,Institutionen för hälsa och miljö,Klinisk mikrobiologi(Swepub:liu)jonjo59 (författare)
Linköpings universitetHälsouniversitetet (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

Ingår i:Helicobacter: Wiley6:2, s. 100-1091083-43891523-5378

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Helicobacter (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

1 av 1
Föregående post
Nästa post
Till träfflistan

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...: Monstein, Hans-J ...; de la Cour, CD; Jonasson, Jon, 1 ...

Artiklar i publikationen: Helicobacter

Av lärosätet: Linköpings universitet

Sök utanför SwePub

Sök vidare i:: Google; Google Book Search; Google Scholar

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

LIBRIS.kb.se