SwePub
Tyck till om SwePub Sök här!
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:oru-12632"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:oru-12632" > Working mechanism f...

Working mechanism for a redox switchable molecular machine based on cyclodextrin : a free energy profiles approach

Zhang, Qiong (författare)
KTH,Teoretisk kemi
Tu, Yaoquan (författare)
Örebro universitet,Akademin för naturvetenskap och teknik
Tian, He (författare)
Adv Mat Lab, E China Univ Sci & Technol, Shanghai, Peoples R China; Inst Fine Chem, E China Univ Sci & Technol, Shanghai, Peoples R China
visa fler...
Zhao, Yanli (författare)
Dept Chem, Northwestern Univ, Evanston IL, USA
Stoddart, Fraser J. (författare)
Dept Chem, Northwestern Univ, Evanston IL, USA
Ågren, Hans (författare)
KTH,Teoretisk kemi
Zhao, Yan-Li (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2010-04-15
2010
Engelska.
Ingår i: Journal of Physical Chemistry B. - Washington DC, USA : American Chemical Society (ACS). - 1520-6106 .- 1520-5207. ; 114:19, s. 6561-6566
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • This paper reports the working mechanism for a redox-responsive bistable [2]rotaxane incorporating an alpha-cyclodextrin (alpha-CD) ring (J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 11294-11296), based on free energy profiles obtained from all-atom molecular dynamics simulations. Employing an umbrella sampling technique, the free energy profiles (potential of mean force, PMF) were calculated for the shuttling motion of the alpha-CD ring between a tetrathiafulvalene (TTF) recognition site and a triazole (TZ) unit on the dumbbell of the rotaxane for three oxidation states (0, +1, +2) of the TTF unit. These calculated free energy profiles verified the experimentally observed binding preference for each state. Analysis of the free energy components reveals that, for these alpha-CD-based rotaxanes with charged TTF units, the real driving force for the shuttling in the oxidized states is actually the interactions between water and the rotaxane components, which overwhelms the attractive interactions between the alpha-CD ring and the charged dumbbell. In this work, we put forward a feasible approach to correctly describe the complexation behavior of CD with charged species, that is, free energy profiles obtained from all-atom molecular dynamics simulation.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Kemi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Chemical Sciences (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Kemi -- Fysikalisk kemi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Chemical Sciences -- Physical Chemistry (hsv//eng)

Nyckelord

Chemistry
Kemi
Chemistry
Kemi
Physical chemistry

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy