SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-137595"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-137595" > Fourth Generation o...

Fourth Generation of Next-Generation Sequencing Technologies : Promise and Consequences

Ke, Rongqin (författare)
Mignardi, Marco (författare)
Uppsala universitet,Avdelningen för visuell information och interaktion,Bildanalys och människa-datorinteraktion
Hauling, Thomas (författare)
Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)
visa fler...
Nilsson, Mats (författare)
Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2016
2016
Engelska.
Ingår i: Human Mutation. - 1059-7794 .- 1098-1004. ; 37:12, s. 1363-1367
  • Forskningsöversikt (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • In this review, we discuss the emergence of the fourth-generation sequencing technologies that preserve the spatial coordinates of RNA and DNA sequences with up to subcellular resolution, thus enabling back mapping of sequencing reads to the original histological context. This information is used, for example, in two current large-scale projects that aim to unravel the function of the brain. Also in cancer research, fourth-generation sequencing has the potential to revolutionize the field. Cancer Research UK has named Mapping the molecular and cellular tumor microenvironment in order to define new targets for therapy and prognosis one of the grand challenges in tumor biology. We discuss the advantages of sequencing nucleic acids directly in fixed cells over traditional next-generation sequencing (NGS) methods, the limitations and challenges that these new methods have to face to become broadly applicable, and the impact that the information generated by the combination of in situ sequencing and NGS methods will have in research and diagnostics.

Ämnesord

NATURAL SCIENCES  -- Computer and Information Sciences -- Bioinformatics (Computational Biology) (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Data- och informationsvetenskap -- Bioinformatik (beräkningsbiologi) (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Bioinformatics and Systems Biology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologiska vetenskaper -- Bioinformatik och systembiologi (hsv//swe)
NATURVETENSKAP  -- Data- och informationsvetenskap (Datateknik) (hsv//swe)
NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Computer and Information Sciences (hsv//eng)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine (hsv//eng)

Nyckelord

next-generation sequencing
in situ sequencing
single cell sequencing
spatial gene expression
multiplex in situ RNA detection
Datoriserad bildbehandling
Computerized Image Processing

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
for (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy