SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-147018"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-147018" > Genome-wide identif...

Genome-wide identification of Grainy head targets in Drosophila reveals regulatory interactions with the POU domain transcription factor Vvl

Yao, Liqun (författare)
Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut
Wang, Shenqiu (författare)
Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut,Sloan-Kettering Institute, USA
Westholm, Jakub O. (författare)
visa fler...
Dai, Qi (författare)
Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut,Sloan-Kettering Institute, USA
Matsuda, Ryo (författare)
Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut
Hosono, Chie (författare)
Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut
Bray, Sarah (författare)
Lai, Eric C. (författare)
Samakovlis, Christos (författare)
Stockholms universitet,Institutionen för molekylär biovetenskap, Wenner-Grens institut,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),UGMLC, Germany
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2017-01-01
2017
Engelska.
Ingår i: Development. - : The Company of Biologists. - 0950-1991 .- 1477-9129. ; 144:17, s. 3145-3155
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Grainy head (Grh) is a conserved transcription factor (TF) controlling epithelial differentiation and regeneration. To elucidate Grh functions we identified embryonic Grh targets by ChIP-seq and gene expression analysis. We show that Grh controls hundreds of target genes. Repression or activation correlates with the distance of Grh-binding sites to the transcription start sites of its targets. Analysis of 54 Grh-responsive enhancers during development and upon wounding suggests cooperation with distinct TFs in different contexts. In the airways, Grh-repressed genes encode key TFs involved in branching and cell differentiation. Reduction of the POU domain TF Ventral veins lacking (Vvl) largely ameliorates the airway morphogenesis defects of grh mutants. Vvl and Grh proteins additionally interact with each other and regulate a set of common enhancers during epithelial morphogenesis. We conclude that Grh and Vvl participate in a regulatory network controlling epithelial maturation.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)

Nyckelord

Drosophila
Airway
Chip-seq
Epithelial maturation
Grainy head
Microarray

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy