SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-96106"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:su-96106" > Multiplex detection...

Multiplex detection of antibiotic resistance genes using padlock probes

Barisic, Ivan (författare)
Schoenthaler, Silvia (författare)
Ke, Rongqin (författare)
Uppsala universitet,Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Institutionen för immunologi, genetik och patologi,Rudbeck Laboratory
visa fler...
Nilsson, Mats (författare)
Uppsala universitet,Stockholms universitet,Institutionen för biokemi och biofysik,Science for Life Laboratory (SciLifeLab),Molekylära verktyg,Rudbeck Laboratory
Noehammer, Christa (författare)
Wiesinger-Mayr, Herbert (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2013
2013
Engelska.
Ingår i: Diagnostic microbiology and infectious disease. - 0732-8893 .- 1879-0070. ; 77:2, s. 118-125
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The elucidation of resistance mechanisms is of central importance to providing and maintaining efficient medical treatment. However, molecular detection methods covering the complete set of resistance genes with a single test are still missing. Here, we present a novel 100-plex assay based on padlock probes in combination with a microarray that allows the simultaneous large-scale identification of highly diverse beta-lactamases. The specificity of the assay was performed using 70 clinical bacterial isolates, recovering 98% of the beta-lactamase nucleotide sequences present. Additionally, the sensitivity was evaluated with PCR products and genomic bacterial DNA, revealing a detection limit of 10(4) DNA copies per reaction when using PCR products as the template. Pre-amplification of genomic DNA in a 25-multiplex PCR further facilitated the detection of beta-lactamase genes in dilutions of 10(7) cells/mL. In summary, we present an efficient, highly specific, and highly sensitive multiplex detection method for any gene.

Ämnesord

NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Microbiology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologiska vetenskaper -- Mikrobiologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Infectious Medicine (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Infektionsmedicin (hsv//swe)
NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)

Nyckelord

Multiplex detection
beta-lactamases
Microarray
Padlock probes

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy