SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-112272"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-112272" > Whole-genome sequen...

Whole-genome sequencing identifies EN1 as a determinant of bone density and fracture

Zheng, Hou-Feng (författare)
Forgetta, Vincenzo (författare)
Hsu, Yi-Hsiang (författare)
visa fler...
Estrada, Karol (författare)
Rosello-Diez, Alberto (författare)
Leo, Paul J. (författare)
Dahia, Chitra L. (författare)
Park-Min, Kyung Hyun (författare)
Tobias, Jonathan H. (författare)
Kooperberg, Charles (författare)
Kleinman, Aaron (författare)
Styrkarsdottir, Unnur (författare)
Liu, Ching-Ti (författare)
Uggla, Charlotta (författare)
Evans, Daniel S. (författare)
Nielson, Carrie M. (författare)
Walter, Klaudia (författare)
Pettersson-Kymmer, Ulrika, (författare)
Umeå universitet, Näringsforskning, Umeå universitet, Farmakologi
McCarthy, Shane (författare)
Eriksson, Joel (författare)
Kwan, Tony (författare)
Jhamai, Mila (författare)
Trajanoska, Katerina (författare)
Memari, Yasin (författare)
Min, Josine (författare)
Huang, Jie (författare)
Danecek, Petr (författare)
Wilmot, Beth (författare)
Li, Rui (författare)
Chou, Wen-Chi (författare)
Mokry, Lauren E. (författare)
Moayyeri, Alireza (författare)
Claussnitzer, Melina (författare)
Cheng, Chia-Ho (författare)
Cheung, Warren (författare)
Medina-Gomez, Carolina (författare)
Ge, Bing (författare)
Chen, Shu-Huang (författare)
Choi, Kwangbom (författare)
Oei, Ling (författare)
Fraser, James (författare)
Kraaij, Robert (författare)
Hibbs, Matthew A. (författare)
Gregson, Celia L. (författare)
Paquette, Denis (författare)
Hofman, Albert (författare)
Wibom, Carl, (författare)
Umeå universitet, Institutionen för strålningsvetenskaper
Tranah, Gregory J. (författare)
Marshall, Mhairi (författare)
Gardiner, Brooke B. (författare)
Cremin, Katie (författare)
Auer, Paul (författare)
Hsu, Li (författare)
Ring, Sue (författare)
Tung, Joyce Y. (författare)
Thorleifsson, Gudmar (författare)
Enneman, Anke W. (författare)
van Schoor, Natasja M. (författare)
de Groot, Lisette C. P. G. M. (författare)
van der Velde, Nathalie (författare)
Melin, Beatrice, (författare)
Umeå universitet, Institutionen för strålningsvetenskaper
Kemp, John P. (författare)
Christiansen, Claus (författare)
Sayers, Adrian (författare)
Zhou, Yanhua (författare)
Calderari, Sophie (författare)
van Rooij, Jeroen (författare)
Carlson, Chris (författare)
Peters, Ulrike (författare)
Berlivet, Soizik (författare)
Dostie, Josee (författare)
Uitterlinden, Andre G. (författare)
Williams, Stephen R. (författare)
Farber, Charles (författare)
Grinberg, Daniel (författare)
LaCroix, Andrea Z. (författare)
Haessler, Jeff (författare)
Chasman, Daniel I. (författare)
Giulianini, Franco (författare)
Rose, Lynda M. (författare)
Ridker, Paul M. (författare)
Eisman, John A. (författare)
Nguyen, Tuan V. (författare)
Center, Jacqueline R. (författare)
Nogues, Xavier (författare)
Garcia-Giralt, Natalia (författare)
Launer, Lenore L. (författare)
Gudnason, Vilmunder (författare)
Mellstrom, Dan (författare)
Vandenput, Liesbeth (författare)
Amin, Najaf (författare)
van Duijn, Cornelia M. (författare)
Karlsson, Magnus K. (författare)
Ljunggren, Osten (författare)
Svensson, Olle, (författare)
Umeå universitet, Institutionen för kirurgisk och perioperativ vetenskap
Hallmans, Göran, (författare)
Umeå universitet, Näringsforskning, Umeå universitet, Enheten för biobanksforskning
Rousseau, Francois (författare)
Giroux, Sylvie (författare)
Bussiere, Johanne (författare)
Arp, Pascal P. (författare)
Koromani, Fjorda (författare)
Prince, Richard L. (författare)
Lewis, Joshua R. (författare)
Langdahl, Bente L. (författare)
Hermann, A. Pernille (författare)
Jensen, Jens-Erik B. (författare)
Kaptoge, Stephen (författare)
Khaw, Kay-Tee (författare)
Reeve, Jonathan (författare)
Formosa, Melissa M. (författare)
Xuereb-Anastasi, Angela (författare)
Akesson, Kristina (författare)
McGuigan, Fiona E. (författare)
Garg, Gaurav (författare)
Olmos, Jose M. (författare)
Zarrabeitia, Maria T. (författare)
Riancho, Jose A. (författare)
Ralston, Stuart H. (författare)
Alonso, Nerea (författare)
Jiang, Xi (författare)
Goltzman, David (författare)
Pastinen, Tomi (författare)
Grundberg, Elin (författare)
Gauguier, Dominique (författare)
Orwoll, Eric S. (författare)
Karasik, David (författare)
Davey-Smith, George (författare)
Smith, Albert V. (författare)
Siggeirsdottir, Kristin (författare)
Harris, Tamara B. (författare)
Zillikens, M. Carola (författare)
van Meurs, Joyce B. J. (författare)
Thorsteinsdottir, Unnur (författare)
Maurano, Matthew T. (författare)
Timpson, Nicholas J. (författare)
Soranzo, Nicole (författare)
Durbin, Richard (författare)
Wilson, ScottG. (författare)
Ntzani, Evangelia E. (författare)
Brown, Matthew A. (författare)
Stefansson, Kari (författare)
Hinds, David A. (författare)
Spector, Tim (författare)
Cupples, L. Adrienne (författare)
Ohlsson, Claes (författare)
Greenwood, Celia M. T. (författare)
Jackson, Rebecca D. (författare)
Rowe, David W. (författare)
Loomis, Cynthia A. (författare)
Evans, David M. (författare)
Ackert-Bicknell, Cheryl L. (författare)
Joyner, Alexandra L. (författare)
Duncan, Emma L. (författare)
Kiel, Douglas P. (författare)
Rivadeneira, Fernando (författare)
Richards, J. Brent (författare)
visa färre...
2015
Engelska.
Ingår i: Nature. - 0028-0836 .- 1476-4687. ; 526:7571, s. 112-
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • <p>The extent to which low-frequency (minor allele frequency (MAF) between 1-5%) and rare (MAF &lt;= 1%) variants contribute to complex traits and disease in the general population is mainly unknown. Bone mineral density (BMD) is highly heritable, a major predictor of osteoporotic fractures, and has been previously associated with common genetic variants(1-8), as well as rare, population specific, coding variants(9). Here we identify novel non-coding genetic variants with large effects on BMD (n(total) = 53,236) and fracture (n(total) = 508,253) in individuals of European ancestry from the general population. Associations for BMD were derived from whole-genome sequencing (n = 2,882 from UK10K (ref. 10); a population-based genome sequencing consortium), whole-exome sequencing (n = 3,549), deep imputation of genotyped samples using a combined UK10K/1000 Genomes reference panel (n = 26,534), and de novo replication genotyping (n = 20,271). We identified a low-frequency non-coding variant near a novel locus, EN1, with an effect size fourfold larger than the mean of previously reported common variants for lumbar spine BMD8 (rs11692564(T), MAF51.6%, replication effect size510.20 s.d., P-meta = 2 x 10(-14)), which was also associated with a decreased risk of fracture (odds ratio = 0.85; P = 2 x 10(-11); ncases = 98,742 and ncontrols = 409,511). Using an En1cre/flox mouse model, we observed that conditional loss of En1 results in low bone mass, probably as a consequence of high bone turnover. We also identified a novel low frequency non-coding variant with large effects on BMD near WNT16 (rs148771817(T), MAF = 1.2%, replication effect size +10.41 s.d., P-meta = 1 x 10(-11)). In general, there was an excess of association signals arising from deleterious coding and conserved non-coding variants. These findings provide evidence that low-frequency non-coding variants have large effects on BMD and fracture, thereby providing rationale for whole-genome sequencing and improved imputation reference panels to study the genetic architecture of complex traits and disease in the general population.</p>

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Hälsovetenskaper -- Folkhälsovetenskap, global hälsa, socialmedicin och epidemiologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Health Sciences -- Public Health, Global Health, Social Medicine and Epidemiology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • Nature (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Zheng, Hou-Feng
Forgetta, Vincen ...
Hsu, Yi-Hsiang
Estrada, Karol
Rosello-Diez, Al ...
Leo, Paul J.
visa fler...
Dahia, Chitra L.
Park-Min, Kyung ...
Tobias, Jonathan ...
Kooperberg, Char ...
Kleinman, Aaron
Styrkarsdottir, ...
Liu, Ching-Ti
Uggla, Charlotta
Evans, Daniel S.
Nielson, Carrie ...
Walter, Klaudia
Pettersson-Kymme ...
McCarthy, Shane
Eriksson, Joel
Kwan, Tony
Jhamai, Mila
Trajanoska, Kate ...
Memari, Yasin
Min, Josine
Huang, Jie
Danecek, Petr
Wilmot, Beth
Li, Rui
Chou, Wen-Chi
Mokry, Lauren E.
Moayyeri, Alirez ...
Claussnitzer, Me ...
Cheng, Chia-Ho
Cheung, Warren
Medina-Gomez, Ca ...
Ge, Bing
Chen, Shu-Huang
Choi, Kwangbom
Oei, Ling
Fraser, James
Kraaij, Robert
Hibbs, Matthew A ...
Gregson, Celia L ...
Paquette, Denis
Hofman, Albert
Wibom, Carl
Tranah, Gregory ...
Marshall, Mhairi
Gardiner, Brooke ...
Cremin, Katie
Auer, Paul
Hsu, Li
Ring, Sue
Tung, Joyce Y.
Thorleifsson, Gu ...
Enneman, Anke W.
van Schoor, Nata ...
de Groot, Lisett ...
van der Velde, N ...
Melin, Beatrice
Kemp, John P.
Christiansen, Cl ...
Sayers, Adrian
Zhou, Yanhua
Calderari, Sophi ...
van Rooij, Jeroe ...
Carlson, Chris
Peters, Ulrike
Berlivet, Soizik
Dostie, Josee
Uitterlinden, An ...
Williams, Stephe ...
Farber, Charles
Grinberg, Daniel
LaCroix, Andrea ...
Haessler, Jeff
Chasman, Daniel ...
Giulianini, Fran ...
Rose, Lynda M.
Ridker, Paul M.
Eisman, John A.
Nguyen, Tuan V.
Center, Jacqueli ...
Nogues, Xavier
Garcia-Giralt, N ...
Launer, Lenore L ...
Gudnason, Vilmun ...
Mellstrom, Dan
Vandenput, Liesb ...
Amin, Najaf
van Duijn, Corne ...
Karlsson, Magnus ...
Ljunggren, Osten
Svensson, Olle
Hallmans, Göran
Rousseau, Franco ...
Giroux, Sylvie
Bussiere, Johann ...
Arp, Pascal P.
Koromani, Fjorda
Prince, Richard ...
Lewis, Joshua R.
Langdahl, Bente ...
Hermann, A. Pern ...
Jensen, Jens-Eri ...
Kaptoge, Stephen
Khaw, Kay-Tee
Reeve, Jonathan
Formosa, Melissa ...
Xuereb-Anastasi, ...
Akesson, Kristin ...
McGuigan, Fiona ...
Garg, Gaurav
Olmos, Jose M.
Zarrabeitia, Mar ...
Riancho, Jose A.
Ralston, Stuart ...
Alonso, Nerea
Jiang, Xi
Goltzman, David
Pastinen, Tomi
Grundberg, Elin
Gauguier, Domini ...
Orwoll, Eric S.
Karasik, David
Davey-Smith, Geo ...
Smith, Albert V.
Siggeirsdottir, ...
Harris, Tamara B ...
Zillikens, M. Ca ...
van Meurs, Joyce ...
Thorsteinsdottir ...
Maurano, Matthew ...
Timpson, Nichola ...
Soranzo, Nicole
Durbin, Richard
Wilson, ScottG.
Ntzani, Evangeli ...
Brown, Matthew A ...
Stefansson, Kari
Hinds, David A.
Spector, Tim
Cupples, L. Adri ...
Ohlsson, Claes
Greenwood, Celia ...
Jackson, Rebecca ...
Rowe, David W.
Loomis, Cynthia ...
Evans, David M.
Ackert-Bicknell, ...
Joyner, Alexandr ...
Duncan, Emma L.
Kiel, Douglas P.
Rivadeneira, Fer ...
Richards, J. Bre ...
visa färre...
Om ämnet
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Hälsovetenskaper
och Folkhälsovetensk ...
Artiklar i publikationen
Nature
Av lärosätet
Umeå universitet

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy