SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-158571"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-158571" > Transcriptome-Wide ...

Transcriptome-Wide Association Study Identifies New Candidate Susceptibility Genes for Glioma

Atkins, Isabelle (författare)
Kinnersley, Ben (författare)
Ostrom, Quinn T. (författare)
visa fler...
Labreche, Karim (författare)
Il'yasova, Dora (författare)
Armstrong, Georgina N. (författare)
Eckel-Passow, Jeanette E. (författare)
Schoemaker, Minouk J. (författare)
Nothen, Markus M. (författare)
Barnholtz-Sloan, Jill S. (författare)
Swerdlow, Anthony J. (författare)
Simon, Matthias (författare)
Rajaraman, Preetha (författare)
Chanock, Stephen J. (författare)
Shildkraut, Joellen (författare)
Bernstein, Jonine L. (författare)
Hoffman, Per (författare)
Jockel, Karl-Heinz (författare)
Lai, Rose K. (författare)
Claus, Elizabeth B. (författare)
Olson, Sara H. (författare)
Johansen, Christoffer (författare)
Wrensch, Margaret R. (författare)
Melin, Beatrice S. (författare)
Umeå universitet,Institutionen för strålningsvetenskaper
Jenkins, Robert B. (författare)
Sanson, Marc (författare)
Bondy, Melissa L. (författare)
Houlston, Richard S. (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
American Association for Cancer Research, 2019
2019
Engelska.
Ingår i: Cancer Research. - : American Association for Cancer Research. - 0008-5472 .- 1538-7445. ; 79:8, s. 2065-2071
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Genome-wide association studies (GWAS) have so far identified 25 loci associated with glioma risk, with most showing specificity for either glioblastoma (GBM) or non-GBM tumors. The majority of these GWAS susceptibility variants reside in noncoding regions and the causal genes underlying the associations are largely unknown. Here we performed a transcriptome-wide association study to search for novel risk loci and candidate causal genes at known GWAS loci using Genotype-Tissue Expression Project (GTEx) data to predict cis-predicted gene expression in relation to GBM and non-GBM risk in conjunction with GWAS summary statistics on 12,488 glioma cases (6,183 GBM and 5,820 non-GBM) and 18,169 controls. Imposing a Bonferroni-corrected significance level of P < 5.69 x 10(-6), candidate novel risk locus for GBM (mean Z = 4.43; P = 5.68 x 10(-6)). GALNT6 resides at least 55 Mb away from any previously identified glioma risk variant, while all other 30 significantly associated genes were located within 1 Mb of known GWAS-identified loci and were not significant after conditioning on the known GWAS-identified variants. These data identify a novel locus (GALNT6 at 12q13.33) and 30 genes at 12 known glioma risk loci associated with glioma risk, providing further insights into glioma tumorigenesis.Significance: This study identifies new genes associated with glioma risk, increasing understanding of how these tumors develop.

Ämnesord

MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine (hsv//eng)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy