Umeå universitet,Avdelningen för medicin,Department of Nutrition, T. H. Chan School of Public Health, Harvard University, Boston, Massachusetts; Department of Clinical Sciences, Genetic and Molecular Epidemiology Unit, Lund University Diabetes Centre, Skåne University Hospital, Malmö, Sweden; Oxford Centre for Diabetes, Endocrinology and Metabolism, Radcliffe Department of Medicine, Medical Sciences Division, University of Oxford, Oxford, United Kingdom
Freedman, Barry I.(författare)
Froguel, Philippe(författare)
Gasparini, Paolo(författare)
Gieger, Christian(författare)
Horta, Bernardo L.(författare)
Kamatani, Yoichiro(författare)
Kato, Norihiro(författare)
Kooner, Jaspal S.(författare)
Laakso, Markku(författare)
Leander, Karin(författare)
Lehtimaki, Terho(författare)
Magnusson, Patrik K. E.(författare)
Penninx, Brenda(författare)
Pereira, Alexandre C.(författare)
Rauramaa, Rainer(författare)
Samani, Nilesh J.(författare)
Scott, James(författare)
Shu, Xiao-Ou(författare)
van der Harst, Pim(författare)
Wagenknecht, Lynne E.(författare)
Wang, Ya Xing(författare)
Wareham, Nicholas J.(författare)
Watkins, Hugh(författare)
Weir, David R.(författare)
Wickremasinghe, Ananda R.(författare)
Zheng, Wei(författare)
Elliott, Paul(författare)
North, Kari E.(författare)
Bouchard, Claude(författare)
Evans, Michele K.(författare)
Gudnason, Vilmundur(författare)
Liu, Ching-Ti(författare)
Liu, Yongmei(författare)
Psaty, Bruce M.(författare)
Ridker, Paul M.(författare)
van Dam, Rob M.(författare)
Kardia, Sharon L. R.(författare)
Zhu, Xiaofeng(författare)
Rotimi, Charles N.(författare)
Mook-Kanamori, Dennis O.(författare)
Fornage, Myriam(författare)
Kelly, Tanika N.(författare)
Fox, Ervin R.(författare)
Hayward, Caroline(författare)
van Duijn, Cornelia M.(författare)
Tai, E. Shyong(författare)
Wong, Tien Yin(författare)
Liu, Jingmin(författare)
Rotter, Jerome I.(författare)
Gauderman, W. James(författare)
Province, Michael A.(författare)
Munroe, Patricia B.(författare)
Rice, Kenneth(författare)
Chasman, Daniel I.(författare)
Cupples, L. Adrienne(författare)
Rao, Dabeeru C.(författare)
Morrison, Alanna C.(författare)
Franks, Paul (författare)
Umeå University,Lund University,Lunds universitet,Genetisk och molekylär epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genetic and Molecular Epidemiology,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital,University of Oxford,Harvard University
de Vries, Paul S (författare)
University of Texas
V. Varga, Tibor (författare)
Lund University,Lunds universitet,Genetisk och molekylär epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genetic and Molecular Epidemiology,Lund University Research Groups,Skåne University Hospital
A person's lipid profile is influenced by genetic variants and alcohol consumption, but the contribution of interactions between these exposures has not been studied. We therefore incorporated gene-alcohol interactions into a multiancestry genome-wide association study of levels of high-density lipoprotein cholesterol, low-density lipoprotein cholesterol, and triglycerides. We included 45 studies in stage 1 (genome-wide discovery) and 66 studies in stage 2 (focused follow-up), for a total of 394,584 individuals from 5 ancestry groups. Analyses covered the period July 2014-November 2017. Genetic main effects and interaction effects were jointly assessed by means of a 2-degrees-of-freedom (df) test, and a 1-df test was used to assess the interaction effects alone. Variants at 495 loci were at least suggestively associated (P < 1 x 10(-6)) with lipid levels in stage 1 and were evaluated in stage 2, followed by combined analyses of stage 1 and stage 2. In the combined analysis of stages 1 and 2, a total of 147 independent loci were associated with lipid levels at P < 5 x 10(-8) using 2-df tests, of which 18 were novel. No genome-wide-significant associations were found testing the interaction effect alone. The novel loci included several genes (proprotein convertase subtilisin/kexin type 5 (PCSK5), vascular endothelial growth factor B (VEGFB), and apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide 1 (APOBEC1) complementation factor (A1CF)) that have a putative role in lipid metabolism on the basis of existing evidence from cellular and experimental models.
Ämnesord
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Hälsovetenskap -- Folkhälsovetenskap, global hälsa, socialmedicin och epidemiologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Health Sciences -- Public Health, Global Health, Social Medicine and Epidemiology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Hälsovetenskaper (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Health Sciences (hsv//eng)