SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-174908"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-174908" > Transethnic Genome-...

Transethnic Genome-Wide Association Study Provides Insights in the Genetic Architecture and Heritability of Long QT Syndrome

Lahrouchi, Najim (författare)
Academic Medical Center of University of Amsterdam (AMC),University of Amsterdam
Tadros, Rafik (författare)
Crotti, Lia (författare)
visa fler...
Mizusawa, Yuka (författare)
Postema, Pieter G. (författare)
Beekman, Leander (författare)
Walsh, Roddy (författare)
Hasegawa, Kanae (författare)
Barc, Julien (författare)
Ernsting, Marko (författare)
Turkowski, Kari L. (författare)
Mazzanti, Andrea (författare)
Beckmann, Britt M. (författare)
Shimamoto, Keiko (författare)
Diamant, Ulla-Britt (författare)
Umeå universitet,Pediatrik,European Reference Network for Rare, Low Prevalence, and Complex Diseases of the Heart - ERN GUARD-Heart
Wijeyeratne, Yanushi D. (författare)
Kucho, Yu (författare)
Robyns, Tomas (författare)
Ishikawa, Taisuke (författare)
Arbelo, Elena (författare)
Christiansen, Michael (författare)
Winbo, Annika (författare)
Jabbari, Reza (författare)
Lubitz, Steven A. (författare)
Steinfurt, Johannes (författare)
Rudic, Boris (författare)
Loeys, Bart (författare)
Shoemaker, M. Ben (författare)
Weeke, Peter E. (författare)
Pfeiffer, Ryan (författare)
Davies, Brianna (författare)
Andorin, Antoine (författare)
Hofman, Nynke (författare)
Dagradi, Federica (författare)
Pedrazzini, Matteo (författare)
Tester, David J. (författare)
Bos, J. Martijn (författare)
Sarquella-Brugada, Georgia (författare)
Campuzano, Oscar (författare)
Platonov, Pyotr G. (författare)
Stallmeyer, Birgit (författare)
Zumhagen, Sven (författare)
Nannenberg, Eline A. (författare)
Veldink, Jan H. (författare)
van den Berg, Leonard H. (författare)
Al-Chalabi, Ammar (författare)
Shaw, Christopher E. (författare)
Shaw, Pamela J. (författare)
Morrison, Karen E. (författare)
Andersen, Peter M., 1962- (författare)
Umeå universitet,Institutionen för farmakologi och klinisk neurovetenskap,Department of Neurology, Ulm University, Germany (P.M.A.)
Mueller-Nurasyid, Martina (författare)
Cusi, Daniele (författare)
Barlassina, Cristina (författare)
Galan, Pilar (författare)
Lathrop, Mark (författare)
Munter, Markus (författare)
Werge, Thomas (författare)
Ribases, Marta (författare)
Aung, Tin (författare)
Khor, Chiea C. (författare)
Ozaki, Mineo (författare)
Lichtner, Peter (författare)
Meitinger, Thomas (författare)
van Tintelen, J. Peter (författare)
Hoedemaekers, Yvonne (författare)
Denjoy, Isabelle (författare)
Leenhardt, Antoine (författare)
Napolitano, Carlo (författare)
Shimizu, Wataru (författare)
Schott, Jean-Jacques (författare)
Gourraud, Jean-Baptiste (författare)
Makiyama, Takeru (författare)
Ohno, Seiko (författare)
Itoh, Hideki (författare)
Krahn, Andrew D. (författare)
Antzelevitch, Charles (författare)
Roden, Dan M. (författare)
Saenen, Johan (författare)
Borggrefe, Martin (författare)
Odening, Katja E. (författare)
Ellinor, Patrick T. (författare)
Tfelt-Hansen, Jacob (författare)
Skinner, Jonathan R. (författare)
van den Berg, Maarten P. (författare)
Olesen, Morten Salling (författare)
Brugada, Josep (författare)
Brugada, Ramon (författare)
Makita, Naomasa (författare)
Breckpot, Jeroen (författare)
Yoshinaga, Masao (författare)
Behr, Elijah R. (författare)
Rydberg, Annika (författare)
Umeå universitet,Pediatrik,European Reference Network for Rare, Low Prevalence, and Complex Diseases of the Heart - ERN GUARD-Heart
Aiba, Takeshi (författare)
Kaeaeb, Stefan (författare)
Priori, Silvia G. (författare)
Guicheney, Pascale (författare)
Tan, Hanno L. (författare)
Newton-Cheh, Christopher (författare)
Ackerman, Michael J. (författare)
Schwartz, Peter J. (författare)
Schulze-Bahr, Eric (författare)
Probst, Vincent (författare)
Horie, Minoru (författare)
Wilde, Arthur A. (författare)
Tanck, Michael W. T. (författare)
Bezzina, Connie R. (författare)
Academic Medical Center of University of Amsterdam (AMC)
Platonov, Pyotr (författare)
Lund University,Lunds universitet,Electrocardiology Research Group - CIEL,Forskargrupper vid Lunds universitet,Lund University Research Groups
visa färre...
 (creator_code:org_t)
et al 
Lippincott Williams & Wilkins, 2020
2020
Engelska.
Ingår i: Circulation. - : Lippincott Williams & Wilkins. - 0009-7322 .- 1524-4539. ; 142:4, s. 324-338
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Background: Long QT syndrome (LQTS) is a rare genetic disorder and a major preventable cause of sudden cardiac death in the young. A causal rare genetic variant with large effect size is identified in up to 80% of probands (genotype positive) and cascade family screening shows incomplete penetrance of genetic variants. Furthermore, a proportion of cases meeting diagnostic criteria for LQTS remain genetically elusive despite genetic testing of established genes (genotype negative). These observations raise the possibility that common genetic variants with small effect size contribute to the clinical picture of LQTS. This study aimed to characterize and quantify the contribution of common genetic variation to LQTS disease susceptibility. Methods: We conducted genome-wide association studies followed by transethnic meta-analysis in 1656 unrelated patients with LQTS of European or Japanese ancestry and 9890 controls to identify susceptibility single nucleotide polymorphisms. We estimated the common variant heritability of LQTS and tested the genetic correlation between LQTS susceptibility and other cardiac traits. Furthermore, we tested the aggregate effect of the 68 single nucleotide polymorphisms previously associated with the QT-interval in the general population using a polygenic risk score. Results: Genome-wide association analysis identified 3 loci associated with LQTS at genome-wide statistical significance (P<5x10(-8)) nearNOS1AP,KCNQ1, andKLF12, and 1 missense variant inKCNE1(p.Asp85Asn) at the suggestive threshold (P<10(-6)). Heritability analyses showed that approximate to 15% of variance in overall LQTS susceptibility was attributable to common genetic variation (h2SNP0.148; standard error 0.019). LQTS susceptibility showed a strong genome-wide genetic correlation with the QT-interval in the general population (r(g)=0.40;P=3.2x10(-3)). The polygenic risk score comprising common variants previously associated with the QT-interval in the general population was greater in LQTS cases compared with controls (P<10-13), and it is notable that, among patients with LQTS, this polygenic risk score was greater in patients who were genotype negative compared with those who were genotype positive (P<0.005). Conclusions: This work establishes an important role for common genetic variation in susceptibility to LQTS. We demonstrate overlap between genetic control of the QT-interval in the general population and genetic factors contributing to LQTS susceptibility. Using polygenic risk score analyses aggregating common genetic variants that modulate the QT-interval in the general population, we provide evidence for a polygenic architecture in genotype negative LQTS.

Ämnesord

MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cardiac and Cardiovascular Systems (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Kardiologi (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine (hsv//eng)

Nyckelord

genome-wide association study
inheritance patterns
long QT syndrome
genome-wide association study

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Lahrouchi, Najim
Tadros, Rafik
Crotti, Lia
Mizusawa, Yuka
Postema, Pieter ...
Beekman, Leander
visa fler...
Walsh, Roddy
Hasegawa, Kanae
Barc, Julien
Ernsting, Marko
Turkowski, Kari ...
Mazzanti, Andrea
Beckmann, Britt ...
Shimamoto, Keiko
Diamant, Ulla-Br ...
Wijeyeratne, Yan ...
Kucho, Yu
Robyns, Tomas
Ishikawa, Taisuk ...
Arbelo, Elena
Christiansen, Mi ...
Winbo, Annika
Jabbari, Reza
Lubitz, Steven A ...
Steinfurt, Johan ...
Rudic, Boris
Loeys, Bart
Shoemaker, M. Be ...
Weeke, Peter E.
Pfeiffer, Ryan
Davies, Brianna
Andorin, Antoine
Hofman, Nynke
Dagradi, Federic ...
Pedrazzini, Matt ...
Tester, David J.
Bos, J. Martijn
Sarquella-Brugad ...
Campuzano, Oscar
Platonov, Pyotr ...
Stallmeyer, Birg ...
Zumhagen, Sven
Nannenberg, Elin ...
Veldink, Jan H.
van den Berg, Le ...
Al-Chalabi, Amma ...
Shaw, Christophe ...
Shaw, Pamela J.
Morrison, Karen ...
Andersen, Peter ...
Mueller-Nurasyid ...
Cusi, Daniele
Barlassina, Cris ...
Galan, Pilar
Lathrop, Mark
Munter, Markus
Werge, Thomas
Ribases, Marta
Aung, Tin
Khor, Chiea C.
Ozaki, Mineo
Lichtner, Peter
Meitinger, Thoma ...
van Tintelen, J. ...
Hoedemaekers, Yv ...
Denjoy, Isabelle
Leenhardt, Antoi ...
Napolitano, Carl ...
Shimizu, Wataru
Schott, Jean-Jac ...
Gourraud, Jean-B ...
Makiyama, Takeru
Ohno, Seiko
Itoh, Hideki
Krahn, Andrew D.
Antzelevitch, Ch ...
Roden, Dan M.
Saenen, Johan
Borggrefe, Marti ...
Odening, Katja E ...
Ellinor, Patrick ...
Tfelt-Hansen, Ja ...
Skinner, Jonatha ...
van den Berg, Ma ...
Olesen, Morten S ...
Brugada, Josep
Brugada, Ramon
Makita, Naomasa
Breckpot, Jeroen
Yoshinaga, Masao
Behr, Elijah R.
Rydberg, Annika
Aiba, Takeshi
Kaeaeb, Stefan
Priori, Silvia G ...
Guicheney, Pasca ...
Tan, Hanno L.
Newton-Cheh, Chr ...
Ackerman, Michae ...
Schwartz, Peter ...
Schulze-Bahr, Er ...
Probst, Vincent
Horie, Minoru
Wilde, Arthur A.
Tanck, Michael W ...
Bezzina, Connie ...
Platonov, Pyotr
visa färre...
Om ämnet
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Klinisk medicin
och Kardiologi
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Klinisk medicin
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Medicinska och f ...
och Medicinsk geneti ...
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Medicinska och f ...
Artiklar i publikationen
Circulation
Av lärosätet
Umeå universitet
Lunds universitet

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy