SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-179656"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-179656" > A Transcriptome-Wid...

A Transcriptome-Wide Association Study Identifies Novel Candidate Susceptibility Genes for Pancreatic Cancer

Zhong, Jun (författare)
Jermusyk, Ashley (författare)
Wu, Lang (författare)
visa fler...
Hoskins, Jason W. (författare)
Collins, Irene (författare)
Mocci, Evelina (författare)
Zhang, Mingfeng (författare)
Song, Lei (författare)
Chung, Charles C. (författare)
Zhang, Tongwu (författare)
Xiao, Wenming (författare)
Albanes, Demetrius (författare)
Andreotti, Gabriella (författare)
Arslan, Alan A. (författare)
Babic, Ana (författare)
Bamlet, William R. (författare)
Beane-Freeman, Laura (författare)
Berndt, Sonja (författare)
Borgida, Ayelet (författare)
Bracci, Paige M. (författare)
Brais, Lauren (författare)
Brennan, Paul (författare)
Bueno-de-Mesquita, Bas (författare)
Buring, Julie (författare)
Canzian, Federico (författare)
Childs, Erica J. (författare)
Cotterchio, Michelle (författare)
Du, Mengmeng (författare)
Duell, Eric J. (författare)
Fuchs, Charles (författare)
Gallinger, Steven (författare)
Gaziano, J. Michael (författare)
Giles, Graham G. (författare)
Giovannucci, Edward (författare)
Goggins, Michael (författare)
Goodman, Gary E. (författare)
Goodman, Phyllis J. (författare)
Haiman, Christopher (författare)
Hartge, Patricia (författare)
Hasan, Manal (författare)
Helzlsouer, Kathy J. (författare)
Holly, Elizabeth A. (författare)
Klein, Eric A. (författare)
Kogevinas, Manolis (författare)
Kurtz, Robert J. (författare)
LeMarchand, Loic (författare)
Malats, Nuria (författare)
Mannisto, Satu (författare)
Milne, Roger (författare)
Neale, Rachel E. (författare)
Ng, Kimmie (författare)
Obazee, Ofure (författare)
Oberg, Ann L. (författare)
Orlow, Irene (författare)
Patel, Alpa, V (författare)
Peters, Ulrike (författare)
Porta, Miquel (författare)
Rothman, Nathaniel (författare)
Scelo, Ghislaine (författare)
Sesso, Howard D. (författare)
Severi, Gianluca (författare)
Sieri, Sabina (författare)
Silverman, Debra (författare)
Sund, Malin (författare)
Umeå universitet,Kirurgi
Tjonneland, Anne (författare)
Thornquist, Mark D. (författare)
Tobias, Geoffrey S. (författare)
Trichopoulou, Antonia (författare)
Van den Eeden, Stephen K. (författare)
Visvanathan, Kala (författare)
Wactawski-Wende, Jean (författare)
Wentzensen, Nicolas (författare)
White, Emily (författare)
Yu, Herbert (författare)
Yuan, Chen (författare)
Zeleniuch-Jacquotte, Anne (författare)
Hoover, Robert (författare)
Brown, Kevin (författare)
Kooperberg, Charles (författare)
Risch, Harvey A. (författare)
Jacobs, Eric J. (författare)
Li, Donghui (författare)
Yu, Kai (författare)
Shu, Xiao-Ou (författare)
Chanock, Stephen J. (författare)
Wolpin, Brian M. (författare)
Stolzenberg-Solomon, Rachael Z. (författare)
Chatterjee, Nilanjan (författare)
Klein, Alison P. (författare)
Smith, Jill P. (författare)
Kraft, Peter (författare)
Shi, Jianxin (författare)
Petersen, Gloria M. (författare)
Zheng, Wei (författare)
Amundadottir, Laufey T. (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Oxford University Press, 2020
2020
Engelska.
Ingår i: Journal of the National Cancer Institute. - : Oxford University Press. - 0027-8874 .- 1460-2105. ; 112:10
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Background: Although 20 pancreatic cancer susceptibility loci have been identified through genome-wide association studies in individuals of European ancestry, much of its heritability remains unexplained and the genes responsible largely unknown. Methods: To discover novel pancreatic cancer risk loci and possible causal genes, we performed a pancreatic cancer transcriptome-wide association study in Europeans using three approaches: FUSION, MetaXcan, and Summary-MulTiXcan. We integrated genome-wide association studies summary statistics from 9040 pancreatic cancer cases and 12 496 controls, with gene expression prediction models built using transcriptome data from histologically normal pancreatic tissue samples (NCI Laboratory of Translational Genomics [n = 95] and Genotype-Tissue Expression v7 [n = 174] datasets) and data from 48 different tissues (Genotype-Tissue Expression v7, n = 74-421 samples). Results: We identified 25 genes whose genetically predicted expression was statistically significantly associated with pancreatic cancer risk (false discovery rate < .05), including 14 candidate genes at 11 novel loci (1p36.12: CELA3B; 9q31.1: SMC2, SMC2-AS1; 10q23.31: RP11-80H5.9; 12q13.13: SMUG1; 14q32.33: BTBD6; 15q23: HEXA; 15q26.1: RCCD1; 17q12: PNMT, CDK12, PGAP3; 17q22: SUPT4H1; 18q11.22: RP11-888D10.3; and 19p13.11: PGPEPI) and 11 at six known risk loci (5p15.33: TERT, CLPTMIL, ZDHHCIIB; 7p14.1: INHBA; 9q34.2: ABO; 13q12.2: PDX1; 13q22.1: KLF5; and 16q23.1: WDR59, CFDP1, BCAR1, TMEM170A). The association for 12 of these genes (CELA3B, SMC2, and PNMT at novel risk loci and TERT, CLPTMIL, INHBA, ABO, PDX1, KLF5, WDR59, CFDP1, and BCAR1 at known loci) remained statistically significant after Bonferroni correction. Conclusions: By integrating gene expression and genotype data, we identified novel pancreatic cancer risk loci and candidate functional genes that warrant further investigation.

Ämnesord

MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Zhong, Jun
Jermusyk, Ashley
Wu, Lang
Hoskins, Jason W ...
Collins, Irene
Mocci, Evelina
visa fler...
Zhang, Mingfeng
Song, Lei
Chung, Charles C ...
Zhang, Tongwu
Xiao, Wenming
Albanes, Demetri ...
Andreotti, Gabri ...
Arslan, Alan A.
Babic, Ana
Bamlet, William ...
Beane-Freeman, L ...
Berndt, Sonja
Borgida, Ayelet
Bracci, Paige M.
Brais, Lauren
Brennan, Paul
Bueno-de-Mesquit ...
Buring, Julie
Canzian, Federic ...
Childs, Erica J.
Cotterchio, Mich ...
Du, Mengmeng
Duell, Eric J.
Fuchs, Charles
Gallinger, Steve ...
Gaziano, J. Mich ...
Giles, Graham G.
Giovannucci, Edw ...
Goggins, Michael
Goodman, Gary E.
Goodman, Phyllis ...
Haiman, Christop ...
Hartge, Patricia
Hasan, Manal
Helzlsouer, Kath ...
Holly, Elizabeth ...
Klein, Eric A.
Kogevinas, Manol ...
Kurtz, Robert J.
LeMarchand, Loic
Malats, Nuria
Mannisto, Satu
Milne, Roger
Neale, Rachel E.
Ng, Kimmie
Obazee, Ofure
Oberg, Ann L.
Orlow, Irene
Patel, Alpa, V
Peters, Ulrike
Porta, Miquel
Rothman, Nathani ...
Scelo, Ghislaine
Sesso, Howard D.
Severi, Gianluca
Sieri, Sabina
Silverman, Debra
Sund, Malin
Tjonneland, Anne
Thornquist, Mark ...
Tobias, Geoffrey ...
Trichopoulou, An ...
Van den Eeden, S ...
Visvanathan, Kal ...
Wactawski-Wende, ...
Wentzensen, Nico ...
White, Emily
Yu, Herbert
Yuan, Chen
Zeleniuch-Jacquo ...
Hoover, Robert
Brown, Kevin
Kooperberg, Char ...
Risch, Harvey A.
Jacobs, Eric J.
Li, Donghui
Yu, Kai
Shu, Xiao-Ou
Chanock, Stephen ...
Wolpin, Brian M.
Stolzenberg-Solo ...
Chatterjee, Nila ...
Klein, Alison P.
Smith, Jill P.
Kraft, Peter
Shi, Jianxin
Petersen, Gloria ...
Zheng, Wei
Amundadottir, La ...
visa färre...
Om ämnet
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Klinisk medicin
och Cancer och onkol ...
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Klinisk medicin
Artiklar i publikationen
Journal of the N ...
Av lärosätet
Umeå universitet

Sök utanför SwePub

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy