SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-35260"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-35260" > The MicroArray Qual...

The MicroArray Quality Control (MAQC)-II study of common practices for the development and validation of microarray-based predictive models

Shi, Leming (författare)
Campbell, Gregory (författare)
Jones, Wendell D (författare)
visa fler...
Campagne, Fabien (författare)
Wen, Zhining (författare)
Walker, Stephen J (författare)
Su, Zhenqiang (författare)
Chu, Tzu-Ming (författare)
Goodsaid, Federico M (författare)
Pusztai, Lajos (författare)
Shaughnessy, John D (författare)
Oberthuer, André (författare)
Thomas, Russell S (författare)
Paules, Richard S (författare)
Fielden, Mark (författare)
Barlogie, Bart (författare)
Chen, Weijie (författare)
Du, Pan (författare)
Fischer, Matthias (författare)
Furlanello, Cesare (författare)
Gallas, Brandon D (författare)
Ge, Xijin (författare)
Megherbi, Dalila B (författare)
Symmans, W Fraser (författare)
Wang, May D (författare)
Zhang, John (författare)
Bitter, Hans (författare)
Brors, Benedikt (författare)
Bushel, Pierre R (författare)
Bylesjö, Max, (författare)
Umeå universitet, Kemiska institutionen, 4Computational Life Science Cluster (CLiC)
Chen, Minjun (författare)
Cheng, Jie (författare)
Cheng, Jing (författare)
Chou, Jeff (författare)
Davison, Timothy S (författare)
Delorenzi, Mauro (författare)
Deng, Youping (författare)
Devanarayan, Viswanath (författare)
Dix, David J (författare)
Dopazo, Joaquin (författare)
Dorff, Kevin C (författare)
Elloumi, Fathi (författare)
Fan, Jianqing (författare)
Fan, Shicai (författare)
Fan, Xiaohui (författare)
Fang, Hong (författare)
Gonzaludo, Nina (författare)
Hess, Kenneth R (författare)
Hong, Huixiao (författare)
Huan, Jun (författare)
Irizarry, Rafael A (författare)
Judson, Richard (författare)
Juraeva, Dilafruz (författare)
Lababidi, Samir (författare)
Lambert, Christophe G (författare)
Li, Li (författare)
Li, Yanen (författare)
Li, Zhen (författare)
Lin, Simon M (författare)
Liu, Guozhen (författare)
Lobenhofer, Edward K (författare)
Luo, Jun (författare)
Luo, Wen (författare)
McCall, Matthew N (författare)
Nikolsky, Yuri (författare)
Pennello, Gene A (författare)
Perkins, Roger G (författare)
Philip, Reena (författare)
Popovici, Vlad (författare)
Price, Nathan D (författare)
Qian, Feng (författare)
Scherer, Andreas (författare)
Shi, Tieliu (författare)
Shi, Weiwei (författare)
Sung, Jaeyun (författare)
Thierry-Mieg, Danielle (författare)
Thierry-Mieg, Jean (författare)
Thodima, Venkata (författare)
Trygg, Johan, (författare)
Umeå universitet, Kemiska institutionen, Computational Life Science Cluster (CLiC)
Vishnuvajjala, Lakshmi (författare)
Wang, Sue Jane (författare)
Wu, Jianping (författare)
Wu, Yichao (författare)
Xie, Qian (författare)
Yousef, Waleed A (författare)
Zhang, Liang (författare)
Zhang, Xuegong (författare)
Zhong, Sheng (författare)
Zhou, Yiming (författare)
Zhu, Sheng (författare)
Arasappan, Dhivya (författare)
Bao, Wenjun (författare)
Lucas, Anne Bergstrom (författare)
Berthold, Frank (författare)
Brennan, Richard J (författare)
Buness, Andreas (författare)
Catalano, Jennifer G (författare)
Chang, Chang (författare)
Chen, Rong (författare)
Cheng, Yiyu (författare)
Cui, Jian (författare)
Czika, Wendy (författare)
Demichelis, Francesca (författare)
Deng, Xutao (författare)
Dosymbekov, Damir (författare)
Eils, Roland (författare)
Feng, Yang (författare)
Fostel, Jennifer (författare)
Fulmer-Smentek, Stephanie (författare)
Fuscoe, James C (författare)
Gatto, Laurent (författare)
Ge, Weigong (författare)
Goldstein, Darlene R (författare)
Guo, Li (författare)
Halbert, Donald N (författare)
Han, Jing (författare)
Harris, Stephen C (författare)
Hatzis, Christos (författare)
Herman, Damir (författare)
Huang, Jianping (författare)
Jensen, Roderick V (författare)
Jiang, Rui (författare)
Johnson, Charles D (författare)
Jurman, Giuseppe (författare)
Kahlert, Yvonne (författare)
Khuder, Sadik A (författare)
Kohl, Matthias (författare)
Li, Jianying (författare)
Li, Li (författare)
Li, Menglong (författare)
Li, Quan-Zhen (författare)
Li, Shao (författare)
Li, Zhiguang (författare)
Liu, Jie (författare)
Liu, Ying (författare)
Liu, Zhichao (författare)
Meng, Lu (författare)
Madera, Manuel (författare)
Martinez-Murillo, Francisco (författare)
Medina, Ignacio (författare)
Meehan, Joseph (författare)
Miclaus, Kelci (författare)
Moffitt, Richard A (författare)
Montaner, David (författare)
Mukherjee, Piali (författare)
Mulligan, George J (författare)
Neville, Padraic (författare)
Nikolskaya, Tatiana (författare)
Ning, Baitang (författare)
Page, Grier P (författare)
Parker, Joel (författare)
Parry, R Mitchell (författare)
Peng, Xuejun (författare)
Peterson, Ron L (författare)
Phan, John H (författare)
Quanz, Brian (författare)
Ren, Yi (författare)
Riccadonna, Samantha (författare)
Roter, Alan H (författare)
Samuelson, Frank W (författare)
Schumacher, Martin M (författare)
Shambaugh, Joseph D (författare)
Shi, Qiang (författare)
Shippy, Richard (författare)
Si, Shengzhu (författare)
Smalter, Aaron (författare)
Sotiriou, Christos (författare)
Soukup, Mat (författare)
Staedtler, Frank (författare)
Steiner, Guido (författare)
Stokes, Todd H (författare)
Sun, Qinglan (författare)
Tan, Pei-Yi (författare)
Tang, Rong (författare)
Tezak, Zivana (författare)
Thorn, Brett (författare)
Tsyganova, Marina (författare)
Turpaz, Yaron (författare)
Vega, Silvia C (författare)
Visintainer, Roberto (författare)
von Frese, Juergen (författare)
Wang, Charles (författare)
Wang, Eric (författare)
Wang, Junwei (författare)
Wang, Wei (författare)
Westermann, Frank (författare)
Willey, James C (författare)
Woods, Matthew (författare)
Wu, Shujian (författare)
Xiao, Nianqing (författare)
Xu, Joshua (författare)
Xu, Lei (författare)
Yang, Lun (författare)
Zeng, Xiao (författare)
Zhang, Jialu (författare)
Zhang, Li (författare)
Zhang, Min (författare)
Zhao, Chen (författare)
Puri, Raj K (författare)
Scherf, Uwe (författare)
Tong, Weida (författare)
Wolfinger, Russell D (författare)
visa färre...
Umeå universitet Teknisk-naturvetenskapliga fakulteten. Kemiska institutionen. (creator_code:org_t)
2010
Engelska.
Ingår i: Nature Biotechnology. - Nature Publishing Group. - 1087-0156. ; 28:8, s. 827-838
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Gene expression data from microarrays are being applied to predict preclinical and clinical endpoints, but the reliability of these predictions has not been established. In the MAQC-II project, 36 independent teams analyzed six microarray data sets to generate predictive models for classifying a sample with respect to one of 13 endpoints indicative of lung or liver toxicity in rodents, or of breast cancer, multiple myeloma or neuroblastoma in humans. In total, >30,000 models were built using many combinations of analytical methods. The teams generated predictive models without knowing the biological meaning of some of the endpoints and, to mimic clinical reality, tested the models on data that had not been used for training. We found that model performance depended largely on the endpoint and team proficiency and that different approaches generated models of similar performance. The conclusions and recommendations from MAQC-II should be useful for regulatory agencies, study committees and independent investigators that evaluate methods for global gene expression analysis.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologiska vetenskaper (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Shi, Leming
Campbell, Gregor ...
Jones, Wendell D
Campagne, Fabien
Wen, Zhining
Walker, Stephen ...
visa fler...
Su, Zhenqiang
Chu, Tzu-Ming
Goodsaid, Federi ...
Pusztai, Lajos
Shaughnessy, Joh ...
Oberthuer, André
Thomas, Russell ...
Paules, Richard ...
Fielden, Mark
Barlogie, Bart
Chen, Weijie
Du, Pan
Fischer, Matthia ...
Furlanello, Cesa ...
Gallas, Brandon ...
Ge, Xijin
Megherbi, Dalila ...
Symmans, W Frase ...
Wang, May D
Zhang, John
Bitter, Hans
Brors, Benedikt
Bushel, Pierre R
Bylesjö, Max
Chen, Minjun
Cheng, Jie
Cheng, Jing
Chou, Jeff
Davison, Timothy ...
Delorenzi, Mauro
Deng, Youping
Devanarayan, Vis ...
Dix, David J
Dopazo, Joaquin
Dorff, Kevin C
Elloumi, Fathi
Fan, Jianqing
Fan, Shicai
Fan, Xiaohui
Fang, Hong
Gonzaludo, Nina
Hess, Kenneth R
Hong, Huixiao
Huan, Jun
Irizarry, Rafael ...
Judson, Richard
Juraeva, Dilafru ...
Lababidi, Samir
Lambert, Christo ...
Li, Li
Li, Yanen
Li, Zhen
Lin, Simon M
Liu, Guozhen
Lobenhofer, Edwa ...
Luo, Jun
Luo, Wen
McCall, Matthew ...
Nikolsky, Yuri
Pennello, Gene A
Perkins, Roger G
Philip, Reena
Popovici, Vlad
Price, Nathan D
Qian, Feng
Scherer, Andreas
Shi, Tieliu
Shi, Weiwei
Sung, Jaeyun
Thierry-Mieg, Da ...
Thierry-Mieg, Je ...
Thodima, Venkata
Trygg, Johan
Vishnuvajjala, L ...
Wang, Sue Jane
Wu, Jianping
Wu, Yichao
Xie, Qian
Yousef, Waleed A
Zhang, Liang
Zhang, Xuegong
Zhong, Sheng
Zhou, Yiming
Zhu, Sheng
Arasappan, Dhivy ...
Bao, Wenjun
Lucas, Anne Berg ...
Berthold, Frank
Brennan, Richard ...
Buness, Andreas
Catalano, Jennif ...
Chang, Chang
Chen, Rong
Cheng, Yiyu
Cui, Jian
Czika, Wendy
Demichelis, Fran ...
Deng, Xutao
Dosymbekov, Dami ...
Eils, Roland
Feng, Yang
Fostel, Jennifer
Fulmer-Smentek, ...
Fuscoe, James C
Gatto, Laurent
Ge, Weigong
Goldstein, Darle ...
Guo, Li
Halbert, Donald ...
Han, Jing
Harris, Stephen ...
Hatzis, Christos
Herman, Damir
Huang, Jianping
Jensen, Roderick ...
Jiang, Rui
Johnson, Charles ...
Jurman, Giuseppe
Kahlert, Yvonne
Khuder, Sadik A
Kohl, Matthias
Li, Jianying
Li, Menglong
Li, Quan-Zhen
Li, Shao
Li, Zhiguang
Liu, Jie
Liu, Ying
Liu, Zhichao
Meng, Lu
Madera, Manuel
Martinez-Murillo ...
Medina, Ignacio
Meehan, Joseph
Miclaus, Kelci
Moffitt, Richard ...
Montaner, David
Mukherjee, Piali
Mulligan, George ...
Neville, Padraic
Nikolskaya, Tati ...
Ning, Baitang
Page, Grier P
Parker, Joel
Parry, R Mitchel ...
Peng, Xuejun
Peterson, Ron L
Phan, John H
Quanz, Brian
Ren, Yi
Riccadonna, Sama ...
Roter, Alan H
Samuelson, Frank ...
Schumacher, Mart ...
Shambaugh, Josep ...
Shi, Qiang
Shippy, Richard
Si, Shengzhu
Smalter, Aaron
Sotiriou, Christ ...
Soukup, Mat
Staedtler, Frank
Steiner, Guido
Stokes, Todd H
Sun, Qinglan
Tan, Pei-Yi
Tang, Rong
Tezak, Zivana
Thorn, Brett
Tsyganova, Marin ...
Turpaz, Yaron
Vega, Silvia C
Visintainer, Rob ...
von Frese, Juerg ...
Wang, Charles
Wang, Eric
Wang, Junwei
Wang, Wei
Westermann, Fran ...
Willey, James C
Woods, Matthew
Wu, Shujian
Xiao, Nianqing
Xu, Joshua
Xu, Lei
Yang, Lun
Zeng, Xiao
Zhang, Jialu
Zhang, Li
Zhang, Min
Zhao, Chen
Puri, Raj K
Scherf, Uwe
Tong, Weida
Wolfinger, Russe ...
visa färre...
Om ämnet
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologiska veten ...
Artiklar i publikationen
Nature Biotechno ...
Av lärosätet
Umeå universitet

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy