SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-87401"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:umu-87401" > Association analysi...

Association analysis of 9,560 prostate cancer cases from the International Consortium of Prostate Cancer Genetics confirms the role of reported prostate cancer associated SNPs for familial disease

Teerlink, Craig C. (författare)
Thibodeau, Stephen N. (författare)
McDonnell, Shannon K. (författare)
visa fler...
Schaid, Daniel J. (författare)
Rinckleb, Antje (författare)
Maier, Christiane (författare)
Vogel, Walther (författare)
Cancel-Tassin, Geraldine (författare)
Egrot, Christophe (författare)
Cussenot, Olivier (författare)
Foulkes, William D. (författare)
Giles, Graham G. (författare)
Hopper, John L. (författare)
Severi, Gianluca (författare)
Eeles, Ros (författare)
Easton, Douglas (författare)
Kote-Jarai, Zsofia (författare)
Guy, Michelle (författare)
Cooney, Kathleen A. (författare)
Ray, Anna M. (författare)
Zuhlke, Kimberly A. (författare)
Lange, Ethan M. (författare)
FitzGerald, Liesel M. (författare)
Stanford, Janet L. (författare)
Ostrander, Elaine A. (författare)
Wiley, Kathleen E. (författare)
Isaacs, Sarah D. (författare)
Walsh, Patrick C. (författare)
Isaacs, William B. (författare)
Wahlfors, Tiina (författare)
Tammela, Teuvo (författare)
Schleutker, Johanna (författare)
Wiklund, Fredrik, (författare)
Department of Medical Epidemiology and Biostatistics, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden, University of Umeå ICPCG Group
Grönberg, Henrik, (författare)
Department of Medical Epidemiology and Biostatistics, Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden, University of Umeå ICPCG Group
Emanuelsson, Monica, (författare)
Umeå universitet, Onkologi, University of Umeå ICPCG Group
Carpten, John (författare)
Bailey-Wilson, Joan (författare)
Whittemore, Alice S. (författare)
Oakley-Girvan, Ingrid (författare)
Hsieh, Chih-Lin (författare)
Catalona, William J. (författare)
Zheng, S. Lilly (författare)
Jin, Guangfu (författare)
Lu, Lingyi (författare)
Xu, Jianfeng (författare)
Camp, Nicola J. (författare)
Cannon-Albright, Lisa A. (författare)
Gronberg, H, (författare)
Karolinska Institutet
visa färre...
Umeå universitet Medicinska fakulteten. Institutionen för strålningsvetenskaper. Onkologi. (creator_code:org_t)
2014
Engelska.
Ingår i: Human Genetics. - Springer. - 0340-6717. ; 133:3, s. 347-356
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Previous GWAS studies have reported significant associations between various common SNPs and prostate cancer risk using cases unselected for family history. How these variants influence risk in familial prostate cancer is not well studied. Here, we analyzed 25 previously reported SNPs across 14 loci from prior prostate cancer GWAS. The International Consortium for Prostate Cancer Genetics (ICPCG) previously validated some of these using a family-based association method (FBAT). However, this approach suffered reduced power due to the conditional statistics implemented in FBAT. Here, we use a case-control design with an empirical analysis strategy to analyze the ICPCG resource for association between these 25 SNPs and familial prostate cancer risk. Fourteen sites contributed 12,506 samples (9,560 prostate cancer cases, 3,368 with aggressive disease, and 2,946 controls from 2,283 pedigrees). We performed association analysis with Genie software which accounts for relationships. We analyzed all familial prostate cancer cases and the subset of aggressive cases. For the familial prostate cancer phenotype, 20 of the 25 SNPs were at least nominally associated with prostate cancer and 16 remained significant after multiple testing correction (p a parts per thousand currency sign 1E (-3)) occurring on chromosomal bands 6q25, 7p15, 8q24, 10q11, 11q13, 17q12, 17q24, and Xp11. For aggressive disease, 16 of the SNPs had at least nominal evidence and 8 were statistically significant including 2p15. The results indicate that the majority of common, low-risk alleles identified in GWAS studies for all prostate cancer also contribute risk for familial prostate cancer, and that some may contribute risk to aggressive disease.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy