SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-102847"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-102847" > Ancestry informativ...

Ancestry informative marker sets for determining continental origin and admixture proportions in common populations in America

Kosoy, Roman (författare)
Nassir, Rami (författare)
Tian, Chao (författare)
visa fler...
White, Phoebe A. (författare)
Butler, Lesley M. (författare)
Silva, Gabriel (författare)
Kittles, Rick (författare)
Alarcon-Riquelme, Marta E. (författare)
Uppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi
Gregersen, Peter K. (författare)
Belmont, John W. (författare)
De La Vega, Francisco M. (författare)
Seldin, Michael F. (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2009
2009
Engelska.
Ingår i: Human Mutation. - 1059-7794 .- 1098-1004. ; 30:1, s. 69-78
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • To provide a resource for assessing continental ancestry in a wide variety of genetic studies, we identified, validated, and characterized a set of 128 ancestry informative markers (AIMs). The markers were chosen for informativeness, genome-wide distribution, and genotype reproducibility on two platforms (TaqMan assays and Illumina arrays). We analyzed genotyping data from 825 subjects with diverse ancestry, including European, East Asian, Amerindian, African, South Asian, Mexican, and Puerto Rican. A comprehensive set of 128 AIMs and subsets as small as 24 AIMs are shown to be useful tools for ascertaining the origin of subjects from particular continents, and to correct for population stratification in admixed population sample sets. Our findings provide general guidelines for the application of specific AIM subsets as a resource for wide application. We conclude that investigators can use TaqMan assays for the selected AIMs as a simple and cost efficient tool to control for differences in continental ancestry when conducting association studies in ethnically diverse populations.

Nyckelord

population structure. continental ancestry
population stratification
ancestry informative markers
MEDICINE
MEDICIN

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy