SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-103503"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-103503" > Investigation of th...

Investigation of the fine structure of European populations with applications to disease association studies

Heath, Simon C. (författare)
Gut, Ivo G. (författare)
Brennan, Paul (författare)
visa fler...
McKay, James D. (författare)
Bencko, Vladimir (författare)
Fabianova, Eleonora (författare)
Foretova, Lenka (författare)
Georges, Michael (författare)
Janout, Vladimir (författare)
Kabesch, Michael (författare)
Krokan, Hans E. (författare)
Elvestad, Maiken B. (författare)
Lissowska, Jolanta (författare)
Mates, Dana (författare)
Rudnai, Peter (författare)
Skorpen, Frank (författare)
Schreiber, Stefan (författare)
Soria, José M. (författare)
Syvänen, Ann-Christine, (författare)
Uppsala universitet, Molekylär medicin
Meneton, Pierre (författare)
Herçberg, Serge (författare)
Galan, Pilar (författare)
Szeszenia-Dabrowska, Neonilia (författare)
Zaridze, David (författare)
Génin, Emmanuel (författare)
Cardon, Lon R. (författare)
Lathrop, Mark (författare)
visa färre...
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet. Medicinska fakulteten. Institutionen för medicinska vetenskaper. Molekylär medicin. (creator_code:org_t)
2008
Engelska.
Ingår i: European Journal of Human Genetics. - 1018-4813 .- 1476-5438. ; 16:12, s. 1413-1429
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • An investigation into fine-scale European population structure was carried out using high-density genetic variation on nearly 6000 individuals originating from across Europe. The individuals were collected as control samples and were genotyped with more than 300 000 SNPs in genome-wide association studies using the Illumina Infinium platform. A major East-West gradient from Russian (Moscow) samples to Spanish samples was identified as the first principal component (PC) of the genetic diversity. The second PC identified a North-South gradient from Norway and Sweden to Romania and Spain. Variation of frequencies at markers in three separate genomic regions, surrounding LCT, HLA and HERC2, were strongly associated with this gradient. The next 18 PCs also accounted for a significant proportion of genetic diversity observed in the sample. We present a method to predict the ethnic origin of samples by comparing the sample genotypes with those from a reference set of samples of known origin. These predictions can be performed using just summary information on the known samples, and individual genotype data are not required. We discuss issues raised by these data and analyses for association studies including the matching of case-only cohorts to appropriate pre-collected control samples for genome-wide association studies.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  (hsv//eng)

Nyckelord

PCA
GWAS
European
population
association
structure
MEDICINE
MEDICIN

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy