SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-120571"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-120571" > DNA methylation for...

DNA methylation for subtype classification and prediction of treatment outcome in patients with childhood acute lymphoblastic leukemia

Milani, Lili, (författare)
Uppsala universitet, Molekylär medicin
Lundmark, Anders, (författare)
Uppsala universitet, Molekylär medicin
Kiialainen, Anna, (författare)
Uppsala universitet, Molekylär medicin
visa fler...
Nordlund, Jessica, (författare)
Uppsala universitet, Molekylär medicin
Flaegstad, Trond (författare)
Forestier, Erik (författare)
Heyman, Mats (författare)
Jonmundsson, Gudmundur (författare)
Kanerva, Jukka (författare)
Schmiegelow, Kjeld (författare)
Söderhäll, Stefan (författare)
Gustafsson, Mats G., (författare)
Uppsala universitet, Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin, Cancer pharmacology and informatics
Lönnerholm, Gudmar, (författare)
Uppsala universitet, Pediatrik
Syvänen, Ann-Christine, (författare)
Uppsala universitet, Molekylär medicin
Soderhall, S, (författare)
Karolinska Institutet
Lonnerholm, G (författare)
Syvanen, AC (författare)
visa färre...
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet. Medicinska fakulteten. Institutionen för medicinska vetenskaper. Molekylär medicin. (creator_code:org_t)
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet. Medicinska fakulteten. Institutionen för medicinska vetenskaper. Cancerfarmakologi och beräkningsmedicin. (creator_code:org_t)
visa fler...
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet. Medicinska fakulteten. Institutionen för kvinnors och barns hälsa. Pediatrik. (creator_code:org_t)
Umeå universitet Medicinska fakulteten. Institutionen för klinisk vetenskap. Pediatrik. (creator_code:org_t)
visa färre...
2010
Engelska.
Ingår i: Blood. - 0006-4971 .- 1528-0020. ; 115:6, s. 1214-1225
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Despite improvements in the prognosis of childhood acute lymphoblastic leukemia (ALL), subgroups of patients would benefit from alternative treatment approaches. Our aim was to identify genes with DNA methylation profiles that could identify such groups. We determined the methylation levels of 1320 CpG sites in regulatory regions of 416 genes in cells from 401 children diagnosed with ALL. Hierarchical clustering of 300 CpG sites distinguished between T-lineage ALL and B-cell precursor (BCP) ALL and between the main cytogenetic subtypes of BCP ALL. It also stratified patients with high hyperdiploidy and t(12;21) ALL into 2 subgroups with different probability of relapse. By using supervised learning, we constructed multivariate classifiers by external cross-validation procedures. We identified 40 genes that consistently contributed to accurate discrimination between the main subtypes of BCP ALL and gene sets that discriminated between subtypes of ALL and between ALL and controls in pairwise classification analyses. We also identified 20 individual genes with DNA methylation levels that predicted relapse of leukemia. Thus, methylation analysis should be explored as a method to improve stratification of ALL patients. The genes highlighted in our study are not enriched to specific pathways, but the gene expression levels are inversely correlated to the methylation levels.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Pediatrik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Pediatrics (hsv//eng)

Nyckelord

MEDICINE
MEDICIN
DNAmethylation
treatment
childhood
lymphoblastic
leukemia

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • Blood (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy