SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-155945"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-155945" > Genetic architectur...

  • Demirkan, Ayse (författare)

Genetic architecture of circulating lipid levels

  • Artikel/kapitelEngelska2011

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2011
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-155945
  • urn:nbn:se:uu:diva-155945urn
  • https://doi.org/10.1038/ejhg.2011.21DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:122773347URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • Serum concentrations of low-density lipoprotein cholesterol (LDL-C), high-density lipoprotein cholesterol (HDL-C), triglycerides (TGs) and total cholesterol (TC) are important heritable risk factors for cardiovascular disease. Although genome-wide association studies (GWASs) of circulating lipid levels have identified numerous loci, a substantial portion of the heritability of these traits remains unexplained. Evidence of unexplained genetic variance can be detected by combining multiple independent markers into additive genetic risk scores. Such polygenic scores, constructed using results from the ENGAGE Consortium GWAS on serum lipids, were applied to predict lipid levels in an independent population-based study, the Rotterdam Study-II (RS-II). We additionally tested for evidence of a shared genetic basis for different lipid phenotypes. Finally, the polygenic score approach was used to identify an alternative genome-wide significance threshold before pathway analysis and those results were compared with those based on the classical genome-wide significance threshold. Our study provides evidence suggesting that many loci influencing circulating lipid levels remain undiscovered. Cross-prediction models suggested a small overlap between the polygenic backgrounds involved in determining LDL-C, HDL-C and TG levels. Pathway analysis utilizing the best polygenic score for TC uncovered extra information compared with using only genome-wide significant loci. These results suggest that the genetic architecture of circulating lipids involves a number of undiscovered variants with very small effects, and that increasing GWAS sample sizes will enable the identification of novel variants that regulate lipid levels.

Ämnesord och genrebeteckningar

  • serum lipids
  • polygenic
  • genome-wide association
  • polygenic score
  • pathway analysis
  • MEDICINE
  • MEDICIN

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Amin, Najaf (författare)
  • Isaacs, Aaron (författare)
  • Jarvelin, Marjo-Riitta (författare)
  • Whitfield, John B. (författare)
  • Wichmann, Heinz-Erich (författare)
  • Kyvik, Kirsten Ohm (författare)
  • Rudan, Igor (författare)
  • Gieger, Christian (författare)
  • Hicks, Andrew A. (författare)
  • Johansson, ÅsaUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi(Swepub:uu)asjoh108 (författare)
  • Hottenga, Jouke-Jan (författare)
  • Smith, Johannes J. (författare)
  • Wild, Sarah H. (författare)
  • Pedersen, Nancy L. (författare)
  • Willemsen, Gonneke (författare)
  • Mangino, Massimo (författare)
  • Hayward, Caroline (författare)
  • Uitterlinden, Andre G. (författare)
  • Hofman, Albert (författare)
  • Witteman, Jacqueline (författare)
  • Montgomery, Grant W. (författare)
  • Pietilainen, Kirsi H. (författare)
  • Rantanen, Taina (författare)
  • Kaprio, Jaakko (författare)
  • Doering, Angela (författare)
  • Pramstaller, Peter P. (författare)
  • Gyllensten, UlfUppsala universitet,Institutionen för genetik och patologi (författare)
  • de Geus, Eco J. C. (författare)
  • Penninx, Brenda W. (författare)
  • Wilson, James F. (författare)
  • Rivadeneria, Fernando (författare)
  • Magnusson, Patrik K. E. (författare)
  • Boomsma, Dorret I. (författare)
  • Spector, Tim (författare)
  • Campbell, Harry (författare)
  • Hoehne, Birgit (författare)
  • Martin, Nicholas G. (författare)
  • Oostra, Ben A. (författare)
  • McCarthy, Mark (författare)
  • Peltonen-Palotie, Leena (författare)
  • Aulchenko, Yurii (författare)
  • Visscher, Peter M. (författare)
  • Ripatti, Samuli (författare)
  • Janssens, A. Cecile J. W. (författare)
  • van Duijn, Cornelia M. (författare)
  • Wild, SH (författare)
  • Campbell, H (författare)
  • Penninx, BW (författare)
  • Demirkan, A (författare)
  • Rudan, I (författare)
  • Gieger, C (författare)
  • Spector, T (författare)
  • Rantanen, T (författare)
  • Mangino, M (författare)
  • Boomsma, DI (författare)
  • Oostra, BA (författare)
  • Aulchenko, Y (författare)
  • Hottenga, JJ (författare)
  • de Geus, EJC (författare)
  • Wilson, JF (författare)
  • Janssens, ACJW (författare)
  • Uitterlinden, AG (författare)
  • Jarvelin, MR (författare)
  • Johansson, A (författare)
  • Doring, A (författare)
  • Hofman, A (författare)
  • Whitfield, JB (författare)
  • Isaacs, A (författare)
  • Amin, N (författare)
  • Hayward, C (författare)
  • Willemsen, G (författare)
  • Rivadeneria, F (författare)
  • Hoehne, B (författare)
  • Kyvik, KO (författare)
  • Montgomery, GW (författare)
  • Kaprio, J (författare)
  • Martin, NG (författare)
  • Pramstaller, PP (författare)
  • McCarthy, M (författare)
  • Gyllensten, U (författare)
  • Pietilainen, KH (författare)
  • Witteman, J (författare)
  • Smith, JJ (författare)
  • van Duijn, CM (författare)
  • Visscher, PM (författare)
  • Magnusson, PKEKarolinska Institutet(Swepub:ki)1ff4af340d7777f0327d5da0241e23cf (författare)
  • Peltonen-Palotie, L (författare)
  • Hicks, AA (författare)
  • Ripatti, S (författare)
  • Wichmann, HE (författare)
  • Pedersen, NLKarolinska Institutet(Swepub:ki)bff332d224642a6990fd8af41144bb54 (författare)
  • Uppsala universitetInstitutionen för genetik och patologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:European Journal of Human Genetics19:7, s. 813-8191018-48131476-5438

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Demirkan, Ayse
Amin, Najaf
Isaacs, Aaron
Jarvelin, Marjo- ...
Whitfield, John ...
Wichmann, Heinz- ...
visa fler...
Kyvik, Kirsten O ...
Rudan, Igor
Gieger, Christia ...
Hicks, Andrew A.
Johansson, Åsa
Hottenga, Jouke- ...
Smith, Johannes ...
Wild, Sarah H.
Pedersen, Nancy ...
Willemsen, Gonne ...
Mangino, Massimo
Hayward, Carolin ...
Uitterlinden, An ...
Hofman, Albert
Witteman, Jacque ...
Montgomery, Gran ...
Pietilainen, Kir ...
Rantanen, Taina
Kaprio, Jaakko
Doering, Angela
Pramstaller, Pet ...
Gyllensten, Ulf
de Geus, Eco J. ...
Penninx, Brenda ...
Wilson, James F.
Rivadeneria, Fer ...
Magnusson, Patri ...
Boomsma, Dorret ...
Spector, Tim
Campbell, Harry
Hoehne, Birgit
Martin, Nicholas ...
Oostra, Ben A.
McCarthy, Mark
Peltonen-Palotie ...
Aulchenko, Yurii
Visscher, Peter ...
Ripatti, Samuli
Janssens, A. Cec ...
van Duijn, Corne ...
Wild, SH
Campbell, H
Penninx, BW
Demirkan, A
Rudan, I
Gieger, C
Spector, T
Rantanen, T
Mangino, M
Boomsma, DI
Oostra, BA
Aulchenko, Y
Hottenga, JJ
de Geus, EJC
Wilson, JF
Janssens, ACJW
Uitterlinden, AG
Jarvelin, MR
Johansson, A
Doring, A
Hofman, A
Whitfield, JB
Isaacs, A
Amin, N
Hayward, C
Willemsen, G
Rivadeneria, F
Hoehne, B
Kyvik, KO
Montgomery, GW
Kaprio, J
Martin, NG
Pramstaller, PP
McCarthy, M
Gyllensten, U
Pietilainen, KH
Witteman, J
Smith, JJ
van Duijn, CM
Visscher, PM
Magnusson, PKE
Peltonen-Palotie ...
Hicks, AA
Ripatti, S
Wichmann, HE
Pedersen, NL
visa färre...
Artiklar i publikationen
European Journal ...
Av lärosätet
Uppsala universitet
Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy