SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-191199"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-191199" > Genome-Wide Joint M...

Genome-Wide Joint Meta-Analysis of SNP and SNP-by-Smoking Interaction Identifies Novel Loci for Pulmonary Function

Hancock, Dana B (författare)
Artigas, María Soler (författare)
Gharib, Sina A (författare)
visa fler...
Henry, Amanda (författare)
Manichaikul, Ani (författare)
Ramasamy, Adaikalavan (författare)
Loth, Daan W (författare)
Imboden, Medea (författare)
Koch, Beate (författare)
McArdle, Wendy L (författare)
Smith, Albert V (författare)
Smolonska, Joanna (författare)
Sood, Akshay (författare)
Tang, Wenbo (författare)
Wilk, Jemma B (författare)
Zhai, Guangju (författare)
Zhao, Jing Hua (författare)
Aschard, Hugues (författare)
Burkart, Kristin M (författare)
Curjuric, Ivan (författare)
Eijgelsheim, Mark (författare)
Elliott, Paul (författare)
Gu, Xiangjun (författare)
Harris, Tamara B (författare)
Janson, Christer (författare)
Uppsala universitet,Lungmedicin och allergologi,Lung och allergifoskning
Homuth, Georg (författare)
Hysi, Pirro G (författare)
Liu, Jason Z (författare)
Loehr, Laura R (författare)
Lohman, Kurt (författare)
Loos, Ruth J F (författare)
Manning, Alisa K (författare)
Marciante, Kristin D (författare)
Obeidat, Ma'en (författare)
Postma, Dirkje S (författare)
Aldrich, Melinda C (författare)
Brusselle, Guy G (författare)
Chen, Ting-Hsu (författare)
Eiriksdottir, Gudny (författare)
Franceschini, Nora (författare)
Heinrich, Joachim (författare)
Rotter, Jerome I (författare)
Wijmenga, Cisca (författare)
Williams, O Dale (författare)
Bentley, Amy R (författare)
Hofman, Albert (författare)
Laurie, Cathy C (författare)
Lumley, Thomas (författare)
Morrison, Alanna C (författare)
Joubert, Bonnie R (författare)
Rivadeneira, Fernando (författare)
Couper, David J (författare)
Kritchevsky, Stephen B (författare)
Liu, Yongmei (författare)
Wjst, Matthias (författare)
Wain, Louise V (författare)
Vonk, Judith M (författare)
Uitterlinden, André G (författare)
Rochat, Thierry (författare)
Rich, Stephen S (författare)
Psaty, Bruce M (författare)
O'Connor, George T (författare)
North, Kari E (författare)
Mirel, Daniel B (författare)
Meibohm, Bernd (författare)
Launer, Lenore J (författare)
Khaw, Kay-Tee (författare)
Hartikainen, Anna-Liisa (författare)
Hammond, Christopher J (författare)
Gläser, Sven (författare)
Marchini, Jonathan (författare)
Kraft, Peter (författare)
Wareham, Nicholas J (författare)
Völzke, Henry (författare)
Stricker, Bruno H C (författare)
Spector, Timothy D (författare)
Probst-Hensch, Nicole M (författare)
Jarvis, Deborah (författare)
Jarvelin, Marjo-Riitta (författare)
Heckbert, Susan R (författare)
Gudnason, Vilmundur (författare)
Boezen, H Marike (författare)
Barr, R Graham (författare)
Cassano, Patricia A (författare)
Strachan, David P (författare)
Fornage, Myriam (författare)
Hall, Ian P (författare)
Dupuis, Josée (författare)
Tobin, Martin D (författare)
London, Stephanie J (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2012
2012
Engelska.
Ingår i: PLoS genetics. - 1553-7404. ; 8:12, s. e1003098-
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Genome-wide association studies have identified numerous genetic loci for spirometic measures of pulmonary function, forced expiratory volume in one second (FEV1), and its ratio to forced vital capacity (FEV1/FVC). Given that cigarette smoking adversely affects pulmonary function, we conducted genome-wide joint meta-analyses (JMA) of single nucleotide polymorphism (SNP) and SNP-by-smoking (ever-smoking or pack-years) associations on FEV1 and FEV1/FVC across 19 studies (total N = 50,047). We identified three novel loci not previously associated with pulmonary function. SNPs in or near DNER (smallest PJMA = 5.00×10−11), HLA-DQB1 and HLA-DQA2 (smallest PJMA = 4.35×10−9), and KCNJ2 and SOX9 (smallest PJMA = 1.28×10−8) were associated with FEV1/FVC or FEV1 in meta-analysis models including SNP main effects, smoking main effects, and SNP-by-smoking (ever-smoking or pack-years) interaction. The HLA region has been widely implicated for autoimmune and lung phenotypes, unlike the other novel loci, which have not been widely implicated. We evaluated DNER, KCNJ2, and SOX9 and found them to be expressed in human lung tissue. DNER and SOX9 further showed evidence of differential expression in human airway epithelium in smokers compared to non-smokers. Our findings demonstrated that joint testing of SNP and SNP-by-environment interaction identified novel loci associated with complex traits that are missed when considering only the genetic main effects.

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Hancock, Dana B
Artigas, María S ...
Gharib, Sina A
Henry, Amanda
Manichaikul, Ani
Ramasamy, Adaika ...
visa fler...
Loth, Daan W
Imboden, Medea
Koch, Beate
McArdle, Wendy L
Smith, Albert V
Smolonska, Joann ...
Sood, Akshay
Tang, Wenbo
Wilk, Jemma B
Zhai, Guangju
Zhao, Jing Hua
Aschard, Hugues
Burkart, Kristin ...
Curjuric, Ivan
Eijgelsheim, Mar ...
Elliott, Paul
Gu, Xiangjun
Harris, Tamara B
Janson, Christer
Homuth, Georg
Hysi, Pirro G
Liu, Jason Z
Loehr, Laura R
Lohman, Kurt
Loos, Ruth J F
Manning, Alisa K
Marciante, Krist ...
Obeidat, Ma'en
Postma, Dirkje S
Aldrich, Melinda ...
Brusselle, Guy G
Chen, Ting-Hsu
Eiriksdottir, Gu ...
Franceschini, No ...
Heinrich, Joachi ...
Rotter, Jerome I
Wijmenga, Cisca
Williams, O Dale
Bentley, Amy R
Hofman, Albert
Laurie, Cathy C
Lumley, Thomas
Morrison, Alanna ...
Joubert, Bonnie ...
Rivadeneira, Fer ...
Couper, David J
Kritchevsky, Ste ...
Liu, Yongmei
Wjst, Matthias
Wain, Louise V
Vonk, Judith M
Uitterlinden, An ...
Rochat, Thierry
Rich, Stephen S
Psaty, Bruce M
O'Connor, George ...
North, Kari E
Mirel, Daniel B
Meibohm, Bernd
Launer, Lenore J
Khaw, Kay-Tee
Hartikainen, Ann ...
Hammond, Christo ...
Gläser, Sven
Marchini, Jonath ...
Kraft, Peter
Wareham, Nichola ...
Völzke, Henry
Stricker, Bruno ...
Spector, Timothy ...
Probst-Hensch, N ...
Jarvis, Deborah
Jarvelin, Marjo- ...
Heckbert, Susan ...
Gudnason, Vilmun ...
Boezen, H Marike
Barr, R Graham
Cassano, Patrici ...
Strachan, David ...
Fornage, Myriam
Hall, Ian P
Dupuis, Josée
Tobin, Martin D
London, Stephani ...
visa färre...
Artiklar i publikationen
PLoS genetics
Av lärosätet
Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy