SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-223029"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-223029" > Genomic inflation f...

Genomic inflation factors under polygenic inheritance

Yang, Jian (författare)
Weedon, Michael N (författare)
Purcell, Shaun (författare)
visa fler...
Lettre, Guillaume (författare)
Estrada, Karol (författare)
Willer, Cristen J (författare)
Smith, Albert V (författare)
Ingelsson, Erik, 1975- (författare)
Department of Medical Epidemiology and Biostatistics, Karolinska Institutet
O'Connell, Jeffrey R (författare)
Mangino, Massimo (författare)
Mägi, Reedik (författare)
Madden, Pamela A (författare)
Heath, Andrew C (författare)
Nyholt, Dale R (författare)
Martin, Nicholas G (författare)
Montgomery, Grant W (författare)
Frayling, Timothy M (författare)
Hirschhorn, Joel N (författare)
McCarthy, Mark I (författare)
Goddard, Michael E (författare)
Visscher, Peter M (författare)
Frayling, TM (författare)
McCarthy, MI (författare)
Magi, R (författare)
Heath, AC (författare)
Hirschhorn, JN (författare)
Lettre, G (författare)
Martin, NG (författare)
Yang, J (författare)
Mangino, M (författare)
Willer, CJ (författare)
Madden, PA (författare)
Purcell, S (författare)
O'Connell, JR (författare)
Smith, AV (författare)
Estrada, K (författare)
Weedon, MN (författare)
Goddard, ME (författare)
Nyholt, DR (författare)
Visscher, PM (författare)
Ingelsson, E (författare)
Karolinska Institutet
Montgomery, GW (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2011
2011
Engelska.
Ingår i: European Journal of Human Genetics. - 1018-4813 .- 1476-5438. ; 19:7, s. 807-812
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Population structure, including population stratification and cryptic relatedness, can cause spurious associations in genome-wide association studies (GWAS). Usually, the scaled median or mean test statistic for association calculated from multiple single-nucleotide-polymorphisms across the genome is used to assess such effects, and 'genomic control' can be applied subsequently to adjust test statistics at individual loci by a genomic inflation factor. Published GWAS have clearly shown that there are many loci underlying genetic variation for a wide range of complex diseases and traits, implying that a substantial proportion of the genome should show inflation of the test statistic. Here, we show by theory, simulation and analysis of data that in the absence of population structure and other technical artefacts, but in the presence of polygenic inheritance, substantial genomic inflation is expected. Its magnitude depends on sample size, heritability, linkage disequilibrium structure and the number of causal variants. Our predictions are consistent with empirical observations on height in independent samples of ~4000 and ~133,000 individuals.

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy