SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-235066"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-235066" > The genomic substra...

The genomic substrate for adaptive radiation in African cichlid fish

Brawand, David (författare)
Wagner, Catherine E. (författare)
Li, Yang I. (författare)
visa fler...
Malinsky, Milan (författare)
Keller, Irene (författare)
Fan, Shaohua (författare)
Simakov, Oleg (författare)
Ng, Alvin Y. (författare)
Lim, Zhi Wei (författare)
Bezault, Etienne (författare)
Turner-Maier, Jason (författare)
Johnson, Jeremy (författare)
Alcazar, Rosa (författare)
Noh, Hyun Ji (författare)
Russell, Pamela (författare)
Aken, Bronwen (författare)
Alfoeldi, Jessica (författare)
Amemiya, Chris (författare)
Azzouzi, Naoual (författare)
Baroiller, Jean-Francois (författare)
Barloy-Hubler, Frederique (författare)
Berlin, Aaron (författare)
Bloomquist, Ryan (författare)
Carleton, Karen L. (författare)
Conte, Matthew A. (författare)
D'Cotta, Helena (författare)
Eshel, Orly (författare)
Gaffney, Leslie (författare)
Galibert, Francis (författare)
Gante, Hugo F. (författare)
Gnerre, Sante (författare)
Greuter, Lucie (författare)
Guyon, Richard (författare)
Haddad, Natalie S. (författare)
Haerty, Wilfried (författare)
Harris, Rayna M. (författare)
Hofmann, Hans A. (författare)
Hourlier, Thibaut (författare)
Hulata, Gideon (författare)
Jaffe, David B. (författare)
Lara, Marcia (författare)
Lee, Alison P. (författare)
MacCallum, Iain (författare)
Mwaiko, Salome (författare)
Nikaido, Masato (författare)
Nishihara, Hidenori (författare)
Ozouf-Costaz, Catherine (författare)
Penman, David J. (författare)
Przybylski, Dariusz (författare)
Rakotomanga, Michaelle (författare)
Renn, Suzy C. P. (författare)
Ribeiro, Filipe J. (författare)
Ron, Micha (författare)
Salzburger, Walter (författare)
Sanchez-Pulido, Luis (författare)
Santos, M. Emilia (författare)
Searle, Steve (författare)
Sharpe, Ted (författare)
Swofford, Ross (författare)
Tan, Frederick J. (författare)
Williams, Louise (författare)
Young, Sarah (författare)
Yin, Shuangye (författare)
Okada, Norihiro (författare)
Kocher, Thomas D. (författare)
Miska, Eric A. (författare)
Lander, Eric S. (författare)
Venkatesh, Byrappa (författare)
Fernald, Russell D. (författare)
Meyer, Axel (författare)
Ponting, Chris P. (författare)
Streelman, J. Todd (författare)
Lindblad-Toh, Kerstin, (författare)
Uppsala universitet, Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi, Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Seehausen, Ole (författare)
Di Palma, Federica (författare)
visa färre...
2014
Engelska.
Ingår i: Nature. - 0028-0836 .- 1476-4687. ; 513:7518, s. 375-381
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • <p>Cichlid fishes are famous for large, diverse and replicated adaptive radiations in the Great Lakes of East Africa. To understand themolecular mechanisms underlying cichlid phenotypic diversity, we sequenced the genomes and transcriptomes of five lineages of African cichlids: the Nile tilapia (Oreochromis niloticus), an ancestral lineage with low diversity; and four members of the East African lineage: Neolamprologus brichardi/pulcher (older radiation, Lake Tanganyika), Metriaclima zebra (recent radiation, Lake Malawi), Pundamilia nyererei (very recent radiation, Lake Victoria), and Astatotilapia burtoni (riverine species around Lake Tanganyika). We found an excess of gene duplications in the East African lineage compared to tilapia and other teleosts, an abundance of non-coding element divergence, accelerated coding sequence evolution, expression divergence associated with transposable element insertions, and regulation by novel microRNAs. In addition, we analysed sequence data from sixty individuals representing six closely related species from Lake Victoria, and show genome-wide diversifying selection on coding and regulatory variants, some of which were recruited from ancient polymorphisms. We conclude that a number of molecular mechanisms shaped East African cichlid genomes, and that amassing of standing variation during periods of relaxed purifying selection may have been important in facilitating subsequent evolutionary diversification.</p>

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska grundvetenskaper -- Mikrobiologi inom det medicinska området (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Microbiology in the medical area (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologiska vetenskaper -- Evolutionsbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Evolutionary Biology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • Nature (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Brawand, David
Wagner, Catherin ...
Li, Yang I.
Malinsky, Milan
Keller, Irene
Fan, Shaohua
visa fler...
Simakov, Oleg
Ng, Alvin Y.
Lim, Zhi Wei
Bezault, Etienne
Turner-Maier, Ja ...
Johnson, Jeremy
Alcazar, Rosa
Noh, Hyun Ji
Russell, Pamela
Aken, Bronwen
Alfoeldi, Jessic ...
Amemiya, Chris
Azzouzi, Naoual
Baroiller, Jean- ...
Barloy-Hubler, F ...
Berlin, Aaron
Bloomquist, Ryan
Carleton, Karen ...
Conte, Matthew A ...
D'Cotta, Helena
Eshel, Orly
Gaffney, Leslie
Galibert, Franci ...
Gante, Hugo F.
Gnerre, Sante
Greuter, Lucie
Guyon, Richard
Haddad, Natalie ...
Haerty, Wilfried
Harris, Rayna M.
Hofmann, Hans A.
Hourlier, Thibau ...
Hulata, Gideon
Jaffe, David B.
Lara, Marcia
Lee, Alison P.
MacCallum, Iain
Mwaiko, Salome
Nikaido, Masato
Nishihara, Hiden ...
Ozouf-Costaz, Ca ...
Penman, David J.
Przybylski, Dari ...
Rakotomanga, Mic ...
Renn, Suzy C. P.
Ribeiro, Filipe ...
Ron, Micha
Salzburger, Walt ...
Sanchez-Pulido, ...
Santos, M. Emili ...
Searle, Steve
Sharpe, Ted
Swofford, Ross
Tan, Frederick J ...
Williams, Louise
Young, Sarah
Yin, Shuangye
Okada, Norihiro
Kocher, Thomas D ...
Miska, Eric A.
Lander, Eric S.
Venkatesh, Byrap ...
Fernald, Russell ...
Meyer, Axel
Ponting, Chris P ...
Streelman, J. To ...
Lindblad-Toh, Ke ...
Seehausen, Ole
Di Palma, Federi ...
visa färre...
Om ämnet
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Medicinska grund ...
och Mikrobiologi ino ...
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologiska veten ...
och Evolutionsbiolog ...
Artiklar i publikationen
Nature
Av lärosätet
Uppsala universitet

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy