SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-265693"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-265693" > Genetic variance es...

  • Yang, JianUniv Queensland, Queensland Brain Inst, Brisbane, Qld, Australia.;Univ Queensland, Diamantina Inst, Translat Res Inst, Brisbane, Qld, Australia. (författare)

Genetic variance estimation with imputed variants finds negligible missing heritability for human height and body mass index

  • Artikel/kapitelEngelska2015

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • 2015
  • printrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-265693
  • urn:nbn:se:uu:diva-265693urn
  • https://doi.org/10.1038/ng.3390DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:132112957URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • We propose a method (GREML-LDMS) to estimate heritability for human complex traits in unrelated individuals using whole-genome sequencing data. We demonstrate using simulations based on whole-genome sequencing data that similar to 97% and similar to 68% of variation at common and rare variants, respectively, can be captured by imputation. Using the GREML-LDMS method, we estimate from 44,126 unrelated individuals that all similar to 17 million imputed variants explain 56% (standard error (s.e.) = 2.3%) of variance for height and 27% (s.e. = 2.5%) of variance for body mass index (BMI), and we find evidence that height- and BMI-associated variants have been under natural selection. Considering the imperfect tagging of imputation and potential overestimation of heritability from previous family-based studies, heritability is likely to be 60-70% for height and 30-40% for BMI. Therefore, the missing heritability is small for both traits. For further discovery of genes associated with complex traits, a study design with SNP arrays followed by imputation is more cost-effective than whole-genome sequencing at current prices.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Bakshi, AndrewUniv Queensland, Queensland Brain Inst, Brisbane, Qld, Australia. (författare)
  • Zhu, ZhihongUniv Queensland, Queensland Brain Inst, Brisbane, Qld, Australia. (författare)
  • Hemani, GibranUniv Queensland, Queensland Brain Inst, Brisbane, Qld, Australia.;Univ Bristol, Sch Social & Community Med, IEU, MRC, Bristol, Avon, England. (författare)
  • Vinkhuyzen, Anna A. E.Univ Queensland, Queensland Brain Inst, Brisbane, Qld, Australia. (författare)
  • Lee, Sang HongUniv Queensland, Queensland Brain Inst, Brisbane, Qld, Australia.;Univ New England, Sch Environm & Rural Sci, Armidale, NSW, Australia. (författare)
  • Robinson, Matthew R.Univ Queensland, Queensland Brain Inst, Brisbane, Qld, Australia. (författare)
  • Perry, John R. B.Univ Cambridge, Sch Clin Med, MRC Epidemiol Unit, Inst Metab Sci, Cambridge, England. (författare)
  • Nolte, Ilja M.Univ Groningen, Univ Med Ctr Groningen, Dept Epidemiol, Groningen, Netherlands. (författare)
  • van Vliet-Ostaptchouk, Jana V.Univ Groningen, Univ Med Ctr Groningen, Dept Epidemiol, Groningen, Netherlands.;Univ Groningen, Univ Med Ctr Groningen, Dept Endocrinol, Groningen, Netherlands. (författare)
  • Snieder, HaroldUniv Groningen, Univ Med Ctr Groningen, Dept Epidemiol, Groningen, Netherlands. (författare)
  • Esko, TonuUniv Tartu, Estonian Genome Ctr, EE-50090 Tartu, Estonia.;Boston Childrens Hosp, Div Endocrinol, Cambridge, MA USA.;Broad Inst, Program Med & Populat Genet, Cambridge, MA USA.;Harvard Univ, Sch Med, Dept Genet, Boston, MA USA. (författare)
  • Milani, LiliUniv Tartu, Estonian Genome Ctr, EE-50090 Tartu, Estonia. (författare)
  • Maegi, ReedikUniv Tartu, Estonian Genome Ctr, EE-50090 Tartu, Estonia. (författare)
  • Metspalu, AndresUniv Tartu, Estonian Genome Ctr, EE-50090 Tartu, Estonia.;Univ Tartu, Inst Mol & Cell Biol, EE-50090 Tartu, Estonia. (författare)
  • Hamsten, AndersKarolinska Inst, Dept Med Solna, Atherosclerosis Res Unit, Cardiovasc Genet & Genom Grp, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Magnusson, Patrik K. E.Karolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostat, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Pedersen, Nancy L.Karolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostat, Stockholm, Sweden. (författare)
  • Ingelsson, ErikUppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Stanford Univ, Sch Med, Dept Med, Div Cardiovasc Med, Stanford, CA 94305 USA.(Swepub:uu)ering425 (författare)
  • Soranzo, NicoleWellcome Trust Sanger Inst, Dept Human Genet, Hinxton, England.;Univ Cambridge, Dept Haematol, Cambridge, England. (författare)
  • Keller, Matthew C.Univ Colorado, Dept Psychol & Neurosci, Boulder, CO 80309 USA.;Univ Colorado, Inst Behav Genet, Boulder, CO 80309 USA. (författare)
  • Wray, Naomi R.Univ Queensland, Queensland Brain Inst, Brisbane, Qld, Australia. (författare)
  • Goddard, Michael E.Univ Melbourne, Fac Vet & Agr Sci, Parkville, Vic 3052, Australia.;Jobs Transport & Resources, Dept Econ Dev, Biosci Res Div, Bundoora, Vic, Australia. (författare)
  • Visscher, Peter M.Univ Queensland, Queensland Brain Inst, Brisbane, Qld, Australia.;Univ Queensland, Diamantina Inst, Translat Res Inst, Brisbane, Qld, Australia. (författare)
  • Esko, T (författare)
  • Yang, J (författare)
  • Snieder, H (författare)
  • van Vliet-Ostaptchouk, JV (författare)
  • Magi, R (författare)
  • Goddard, ME (författare)
  • Hamsten, AKarolinska Institutet(Swepub:ki)5f90e78f12999e9611c0f5f0bee7265b (författare)
  • Perry, JRB (författare)
  • Bakshi, A (författare)
  • Hemani, G (författare)
  • Milani, L (författare)
  • Keller, MC (författare)
  • Lee, SH (författare)
  • Ingelsson, E (författare)
  • Robinson, MR (författare)
  • Wray, NR (författare)
  • Nolte, IM (författare)
  • Vinkhuyzen, AAE (författare)
  • Metspalu, A (författare)
  • Zhu, Z (författare)
  • Magnusson, PKEKarolinska Institutet(Swepub:ki)1ff4af340d7777f0327d5da0241e23cf (författare)
  • Visscher, PM (författare)
  • Soranzo, N (författare)
  • Pedersen, NLKarolinska Institutet(Swepub:ki)bff332d224642a6990fd8af41144bb54 (författare)
  • Univ Queensland, Queensland Brain Inst, Brisbane, Qld, Australia.;Univ Queensland, Diamantina Inst, Translat Res Inst, Brisbane, Qld, Australia.Univ Queensland, Queensland Brain Inst, Brisbane, Qld, Australia. (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:47:10, s. 1114-1120
  • Ingår i:Nature Genetics47:10, s. 1114-11201061-40361546-1718

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy