SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-293022"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-293022" > The spotted gar gen...

The spotted gar genome illuminates vertebrate evolution and facilitates human-teleost comparisons

Braasch, Ingo, (författare)
Univ Oregon, Inst Neurosci, Eugene, OR 97403 USA.;Michigan State Univ, Dept Integrat Biol, E Lansing, MI 48824 USA.
Gehrke, Andrew R., (författare)
Univ Chicago, Dept Organismal Biol & Anat, 1025 E 57Th St, Chicago, IL 60637 USA.
Smith, Jeramiah J., (författare)
Univ Kentucky, Dept Biol, Lexington, KY USA.
visa fler...
Kawasaki, Kazuhiko, (författare)
Penn State Univ, Dept Anthropol, University Pk, PA 16802 USA.
Manousaki, Tereza, (författare)
Hellen Ctr Marine Res, Inst Marine Biol Biotechnol & Aquaculture, Iraklion, Greece.
Pasquier, Jeremy, (författare)
INRA, LPGP, UR1037, Campus Beaulieu, F-35042 Rennes, France.
Amores, Angel, (författare)
Univ Oregon, Inst Neurosci, Eugene, OR 97403 USA.
Desvignes, Thomas, (författare)
Univ Oregon, Inst Neurosci, Eugene, OR 97403 USA.
Batzel, Peter, (författare)
Univ Oregon, Inst Neurosci, Eugene, OR 97403 USA.
Catchen, Julian, (författare)
Univ Illinois, Dept Anim Biol, Urbana, IL 61801 USA.
Berlin, Aaron M., (författare)
MIT, Broad Inst, 77 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139 USA.;Harvard, Cambridge, MA USA.
Campbell, Michael S., (författare)
Univ Utah, Eccles Inst Human Genet, Salt Lake City, UT USA.;Cold Spring Harbor Lab, POB 100, Cold Spring Harbor, NY 11724 USA.
Barrell, Daniel, (författare)
Wellcome Trust Sanger Inst, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, England.;European Bioinformat Inst, European Mol Biol Lab, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, England.
Martin, Kyle J., (författare)
Univ Oxford, Dept Zool, Oxford, England.;Univ Sheffield, Dept Anim & Plant Sci, Sheffield S10 2TN, S Yorkshire, England.
Mulley, John F., (författare)
Bangor Univ, Sch Biol Sci, Bangor, Gwynedd, Wales.
Ravi, Vydianathan, (författare)
ASTAR, Inst Mol & Cell Biol, Comparat Genom Lab, Singapore, Singapore.
Lee, Alison P., (författare)
ASTAR, Inst Mol & Cell Biol, Comparat Genom Lab, Singapore, Singapore.
Nakamura, Tetsuya, (författare)
Univ Chicago, Dept Organismal Biol & Anat, 1025 E 57Th St, Chicago, IL 60637 USA.
Chalopin, Domitille, (författare)
Ecole Normale Super Lyon, Inst Genom Fonct Lyon, F-69364 Lyon, France.;Univ Georgia, Dept Genet, Athens, GA 30602 USA.
Fan, Shaohua, (författare)
Univ Konstanz, Dept Biol, Constance, Germany.;Univ Penn, Dept Genet, Philadelphia, PA 19104 USA.
Wcisel, Dustin, (författare)
N Carolina State Univ, Dept Mol Biomed Sci, Raleigh, NC 27695 USA.;N Carolina State Univ, Ctr Comparat Med & Translat Res, Raleigh, NC 27695 USA.
Canestro, Cristian, (författare)
Univ Barcelona, Dept Genet, Barcelona, Spain.;Univ Barcelona, Inst Recerca Biodiversitat, Barcelona, Spain.
Sydes, Jason, (författare)
Univ Oregon, Inst Neurosci, Eugene, OR 97403 USA.
Beaudry, Felix E. G., (författare)
Univ Victoria, Dept Biol, POB 1700, Victoria, BC V8W 2Y2, Canada.
Sun, Yi, (författare)
Soochow Univ, Ctr Circadian Clocks, Suzhou, Peoples R China.;Soochow Univ, Coll Med, Sch Biol & Basic Med Sci, Suzhou, Peoples R China.
Hertel, Jana, (författare)
Univ Leipzig, Dept Comp Sci, Bioinformat Grp, D-04109 Leipzig, Germany.;UFZ Helmholtz Ctr Environm Res, Young Investigators Grp Bioinformat & Transcript, Leipzig, Germany.
Beam, Michael J., (författare)
Univ Oregon, Inst Neurosci, Eugene, OR 97403 USA.
Fasold, Mario, (författare)
Univ Leipzig, Dept Comp Sci, Bioinformat Grp, D-04109 Leipzig, Germany.;ecSeq Bioinformat, Leipzig, Germany.
Ishiyama, Mikio, (författare)
Nippon Dent Univ Coll Niigata, Dept Dent Hyg, Niigata, Japan.
Johnson, Jeremy, (författare)
MIT, Broad Inst, 77 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139 USA.;Harvard, Cambridge, MA USA.
Kehr, Steffi, (författare)
Univ Leipzig, Dept Comp Sci, Bioinformat Grp, D-04109 Leipzig, Germany.
Lara, Marcia, (författare)
MIT, Broad Inst, 77 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139 USA.;Harvard, Cambridge, MA USA.
Letaw, John H., (författare)
Univ Oregon, Inst Neurosci, Eugene, OR 97403 USA.
Litman, Gary W., (författare)
Univ S Florida, Morsani Coll Med, Dept Pediat, St Petersburg, FL 33701 USA.
Litman, Ronda T., (författare)
Univ S Florida, Morsani Coll Med, Dept Pediat, St Petersburg, FL 33701 USA.
Mikami, Masato, (författare)
Nippon Dent Univ, Sch Life Dent Niigata, Dept Microbiol, Niigata, Japan.
Ota, Tatsuya, (författare)
SOKENDAI Grad Univ Adv Studies, Dept Evolutionary Studies Biosyst, Hayama, Japan.
Saha, Nil Ratan, (författare)
Benaroya Res Inst, Mol Genet Program, Seattle, WA USA.
Williams, Louise, (författare)
MIT, Broad Inst, 77 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139 USA.;Harvard, Cambridge, MA USA.
Stadler, Peter F., (författare)
Univ Leipzig, Dept Comp Sci, Bioinformat Grp, D-04109 Leipzig, Germany.
Wang, Han, (författare)
Soochow Univ, Ctr Circadian Clocks, Suzhou, Peoples R China.;Soochow Univ, Coll Med, Sch Biol & Basic Med Sci, Suzhou, Peoples R China.
Taylor, John S., (författare)
Univ Victoria, Dept Biol, POB 1700, Victoria, BC V8W 2Y2, Canada.
Fontenot, Quenton, (författare)
Nicholls State Univ, Dept Biol Sci, Thibodaux, LA 70310 USA.
Ferrara, Allyse, (författare)
Nicholls State Univ, Dept Biol Sci, Thibodaux, LA 70310 USA.
Searle, Stephen M. J., (författare)
Wellcome Trust Sanger Inst, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, England.
Aken, Bronwen, (författare)
Wellcome Trust Sanger Inst, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, England.;European Bioinformat Inst, European Mol Biol Lab, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, England.
Yandell, Mark, (författare)
Univ Utah, Eccles Inst Human Genet, Salt Lake City, UT USA.
Schneider, Igor, (författare)
Fed Univ Para, Inst Ciencias Biol, BR-66059 Belem, Para, Brazil.
Yoder, Jeffrey A., (författare)
N Carolina State Univ, Dept Mol Biomed Sci, Raleigh, NC 27695 USA.;N Carolina State Univ, Ctr Comparat Med & Translat Res, Raleigh, NC 27695 USA.
Volff, Jean-Nicolas, (författare)
Ecole Normale Super Lyon, Inst Genom Fonct Lyon, F-69364 Lyon, France.
Meyer, Axel, (författare)
Univ Konstanz, Dept Biol, Constance, Germany.;Univ Konstanz, Int Max Planck Res Sch Organismal Biol, Constance, Germany.
Amemiya, Chris T., (författare)
Benaroya Res Inst, Mol Genet Program, Seattle, WA USA.
Venkatesh, Byrappa, (författare)
ASTAR, Inst Mol & Cell Biol, Comparat Genom Lab, Singapore, Singapore.
Holland, Peter W. H., (författare)
Univ Oxford, Dept Zool, Oxford, England.
Guiguen, Yann, (författare)
INRA, LPGP, UR1037, Campus Beaulieu, F-35042 Rennes, France.
Bobe, Julien, (författare)
INRA, LPGP, UR1037, Campus Beaulieu, F-35042 Rennes, France.
Shubin, Neil H., (författare)
Univ Chicago, Dept Organismal Biol & Anat, 1025 E 57Th St, Chicago, IL 60637 USA.
Di Palma, Federica, (författare)
MIT, Broad Inst, 77 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139 USA.;Harvard, Cambridge, MA USA.;Genome Anal Ctr, Vertebrate & Hlth Genom, Norwich, Norfolk, England.
Alfoeldi, Jessica, (författare)
MIT, Broad Inst, 77 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139 USA.;Harvard, Cambridge, MA USA.
Lindblad-Toh, Kerstin, (författare)
Uppsala universitet, Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi, Uppsala universitet, Science for Life Laboratory, SciLifeLab, MIT, Broad Inst, 77 Massachusetts Ave, Cambridge, MA 02139 USA.;Harvard, Cambridge, MA USA.;Uppsala Univ, Dept Med Biochem & Microbiol, Sci Life Lab, Uppsala, Sweden.
Postlethwait, John H., (författare)
Univ Oregon, Inst Neurosci, Eugene, OR 97403 USA.
visa färre...
2016
Engelska.
Ingår i: Nature Genetics. - 1061-4036 .- 1546-1718. ; 48:4, s. 427-437

  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • <p>To connect human biology to fish biomedical models, we sequenced the genome of spotted gar (Lepisosteus oculatus), whose lineage diverged from teleosts before teleost genome duplication (TGD). The slowly evolving gar genome has conserved in content and size many entire chromosomes from bony vertebrate ancestors. Gar bridges teleosts to tetrapods by illuminating the evolution of immunity, mineralization and development (mediated, for example, by Hox, ParaHox and microRNA genes). Numerous conserved noncoding elements (CNEs; often cis regulatory) undetectable in direct human-teleost comparisons become apparent using gar: functional studies uncovered conserved roles for such cryptic CNEs, facilitating annotation of sequences identified in human genome-wide association studies. Transcriptomic analyses showed that the sums of expression domains and expression levels for duplicated teleost genes often approximate the patterns and levels of expression for gar genes, consistent with subfunctionalization. The gar genome provides a resource for understanding evolution after genome duplication, the origin of vertebrate genomes and the function of human regulatory sequences.</p>

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy