SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-349374"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-349374" > Prediction of indiv...

Prediction of individual genetic risk to prostate cancer using a polygenic score.

Szulkin, Robert (författare)
Whitington, Thomas (författare)
Eklund, Martin (författare)
visa fler...
Aly, Markus (författare)
Eeles, Rosalind A (författare)
Easton, Douglas (författare)
Kote-Jarai, Z Sofia (författare)
Amin Al Olama, Ali (författare)
Benlloch, Sara (författare)
Muir, Kenneth (författare)
Giles, Graham G (författare)
Southey, Melissa C (författare)
Fitzgerald, Liesel M (författare)
Henderson, Brian E (författare)
Schumacher, Fredrick (författare)
Haiman, Christopher A (författare)
Schleutker, Johanna (författare)
Wahlfors, Tiina (författare)
Tammela, Teuvo L J (författare)
Nordestgaard, Børge G (författare)
Key, Tim J (författare)
Travis, Ruth C (författare)
Neal, David E (författare)
Donovan, Jenny L (författare)
Hamdy, Freddie C (författare)
Pharoah, Paul (författare)
Pashayan, Nora (författare)
Khaw, Kay-Tee (författare)
Stanford, Janet L (författare)
Thibodeau, Stephen N (författare)
McDonnell, Shannon K (författare)
Schaid, Daniel J (författare)
Maier, Christiane (författare)
Vogel, Walther (författare)
Luedeke, Manuel (författare)
Herkommer, Kathleen (författare)
Kibel, Adam S (författare)
Cybulski, Cezary (författare)
Lubiński, Jan (författare)
Kluźniak, Wojciech (författare)
Cannon-Albright, Lisa (författare)
Brenner, Hermann (författare)
Butterbach, Katja (författare)
Stegmaier, Christa (författare)
Park, Jong Y (författare)
Sellers, Thomas (författare)
Lin, Hui-Yi (författare)
Lim, Hui-Yi (författare)
Slavov, Chavdar (författare)
Kaneva, Radka (författare)
Mitev, Vanio (författare)
Batra, Jyotsna (författare)
Clements, Judith A (författare)
Spurdle, Amanda (författare)
Teixeira, Manuel R (författare)
Paulo, Paula (författare)
Maia, Sofia (författare)
Pandha, Hardev (författare)
Michael, Agnieszka (författare)
Kierzek, Andrzej (författare)
Gronberg, Henrik (författare)
Wiklund, Fredrik (författare)
Batra, J (författare)
Thibodeau, SN (författare)
Eklund, M (författare)
Karolinska Institutet
Stanford, JL (författare)
Key, TJ (författare)
Herkommer, K (författare)
Kluzniak, W (författare)
Muir, K (författare)
Schleutker, J (författare)
Hamdy, FC (författare)
Henderson, BE (författare)
Aly, M (författare)
Karolinska Institutet
Stegmaier, C (författare)
Szulkin, R (författare)
Karolinska Institutet
Kibel, AS (författare)
Butterbach, K (författare)
Kierzek, A (författare)
Lim, HY (författare)
Clements, JA (författare)
Southey, MC (författare)
Khaw, KT (författare)
Donovan, JL (författare)
Sellers, T (författare)
Giles, GG (författare)
Paulo, P (författare)
Maia, S (författare)
McDonnell, SK (författare)
Eeles, RA (författare)
Neal, DE (författare)
Brenner, H (författare)
Cannon-Albright, L (författare)
Pandha, H (författare)
Pharoah, P (författare)
Teixeira, MR (författare)
Travis, RC (författare)
Vogel, W (författare)
Mitev, V (författare)
Haiman, CA (författare)
Kaneva, R (författare)
Slavov, C (författare)
Michael, A (författare)
Benlloch, S (författare)
Wahlfors, T (författare)
Tammela, TLJ (författare)
Spurdle, A (författare)
Whitington, T (författare)
Karolinska Institutet
Fitzgerald, LM (författare)
Maier, C (författare)
Schumacher, F (författare)
Park, JY (författare)
Pashayan, N (författare)
Luedeke, M (författare)
Al Olama, AA (författare)
Easton, D (författare)
Kote-Jarai, Z (författare)
Wiklund, F (författare)
Karolinska Institutet
Cybulski, C (författare)
Lubinski, J (författare)
Schaid, DJ (författare)
Gronberg, H (författare)
Karolinska Institutet
Nordestgaard, BG (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2015
2015
Engelska.
Ingår i: The Prostate. - 0270-4137 .- 1097-0045. ; 75:13, s. 1467-74
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • BACKGROUND: Polygenic risk scores comprising established susceptibility variants have shown to be informative classifiers for several complex diseases including prostate cancer. For prostate cancer it is unknown if inclusion of genetic markers that have so far not been associated with prostate cancer risk at a genome-wide significant level will improve disease prediction.METHODS: We built polygenic risk scores in a large training set comprising over 25,000 individuals. Initially 65 established prostate cancer susceptibility variants were selected. After LD pruning additional variants were prioritized based on their association with prostate cancer. Six-fold cross validation was performed to assess genetic risk scores and optimize the number of additional variants to be included. The final model was evaluated in an independent study population including 1,370 cases and 1,239 controls.RESULTS: The polygenic risk score with 65 established susceptibility variants provided an area under the curve (AUC) of 0.67. Adding an additional 68 novel variants significantly increased the AUC to 0.68 (P = 0.0012) and the net reclassification index with 0.21 (P = 8.5E-08). All novel variants were located in genomic regions established as associated with prostate cancer risk.CONCLUSIONS: Inclusion of additional genetic variants from established prostate cancer susceptibility regions improves disease prediction.

Nyckelord

polygenic risk score
prostate cancer
risk prediction

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Szulkin, Robert
Whitington, Thom ...
Eklund, Martin
Aly, Markus
Eeles, Rosalind ...
Easton, Douglas
visa fler...
Kote-Jarai, Z So ...
Amin Al Olama, A ...
Benlloch, Sara
Muir, Kenneth
Giles, Graham G
Southey, Melissa ...
Fitzgerald, Lies ...
Henderson, Brian ...
Schumacher, Fred ...
Haiman, Christop ...
Schleutker, Joha ...
Wahlfors, Tiina
Tammela, Teuvo L ...
Nordestgaard, Bø ...
Key, Tim J
Travis, Ruth C
Neal, David E
Donovan, Jenny L
Hamdy, Freddie C
Pharoah, Paul
Pashayan, Nora
Khaw, Kay-Tee
Stanford, Janet ...
Thibodeau, Steph ...
McDonnell, Shann ...
Schaid, Daniel J
Maier, Christian ...
Vogel, Walther
Luedeke, Manuel
Herkommer, Kathl ...
Kibel, Adam S
Cybulski, Cezary
Lubiński, Jan
Kluźniak, Wojcie ...
Cannon-Albright, ...
Brenner, Hermann
Butterbach, Katj ...
Stegmaier, Chris ...
Park, Jong Y
Sellers, Thomas
Lin, Hui-Yi
Lim, Hui-Yi
Slavov, Chavdar
Kaneva, Radka
Mitev, Vanio
Batra, Jyotsna
Clements, Judith ...
Spurdle, Amanda
Teixeira, Manuel ...
Paulo, Paula
Maia, Sofia
Pandha, Hardev
Michael, Agniesz ...
Kierzek, Andrzej
Gronberg, Henrik
Wiklund, Fredrik
Batra, J
Thibodeau, SN
Eklund, M
Stanford, JL
Key, TJ
Herkommer, K
Kluzniak, W
Muir, K
Schleutker, J
Hamdy, FC
Henderson, BE
Aly, M
Stegmaier, C
Szulkin, R
Kibel, AS
Butterbach, K
Kierzek, A
Lim, HY
Clements, JA
Southey, MC
Khaw, KT
Donovan, JL
Sellers, T
Giles, GG
Paulo, P
Maia, S
McDonnell, SK
Eeles, RA
Neal, DE
Brenner, H
Cannon-Albright, ...
Pandha, H
Pharoah, P
Teixeira, MR
Travis, RC
Vogel, W
Mitev, V
Haiman, CA
Kaneva, R
Slavov, C
Michael, A
Benlloch, S
Wahlfors, T
Tammela, TLJ
Spurdle, A
Whitington, T
Fitzgerald, LM
Maier, C
Schumacher, F
Park, JY
Pashayan, N
Luedeke, M
Al Olama, AA
Easton, D
Kote-Jarai, Z
Wiklund, F
Cybulski, C
Lubinski, J
Schaid, DJ
Gronberg, H
Nordestgaard, BG
visa färre...
Artiklar i publikationen
The Prostate
Av lärosätet
Uppsala universitet
Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy