SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-357383"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-357383" > T cells are influen...

T cells are influenced by a long non-coding RNA in the autoimmune associated PTPN2 locus

Houtman, Miranda (författare)
Karolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden
Shchetynsky, Klementy (författare)
Karolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden
Chemin, Karine (författare)
Karolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden
visa fler...
Hensvold, Aase Haj (författare)
Karolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden
Ramsköld, Daniel (författare)
Karolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden
Tandre, Karolina (författare)
Uppsala universitet,Reumatologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Eloranta, Maija-Leena (författare)
Uppsala universitet,Reumatologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Rönnblom, Lars (författare)
Uppsala universitet,Reumatologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Uebe, Steffen (författare)
Univ Erlangen Nurnberg, Inst Human Genet, Erlangen, Germany
Catrina, Anca Irinel (författare)
Karolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden
Malmström, Vivianne (författare)
Karolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden
Padyukov, Leonid (författare)
Karolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden
Chemin, K (författare)
Karolinska Institutet
Catrina, AI (författare)
Karolinska Institutet
Houtman, M (författare)
Karolinska Institutet
Tandre, K (författare)
Shchetynsky, K (författare)
Karolinska Institutet
Padyukov, L (författare)
Karolinska Institutet
Malmstrom, V (författare)
Karolinska Institutet
Hensvold, AH (författare)
Karolinska Institutet
Ronnblom, L (författare)
Uebe, S (författare)
Ramskold, D (författare)
Karolinska Institutet
Eloranta, ML (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
ACADEMIC PRESS LTD- ELSEVIER SCIENCE LTD, 2018
2018
Engelska.
Ingår i: ; 90, s. 28-38
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Non-coding SNPs in the protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 (PTPN2) locus have been linked with several autoimmune diseases, including rheumatoid arthritis, type I diabetes, and inflammatory bowel disease. However, the functional consequences of these SNPs are poorly characterized. Herein, we show in blood cells that SNPs in the PTPN2 locus are highly correlated with DNA methylation levels at four CpG sites downstream of PTPN2 and expression levels of the long non-coding RNA (IncRNA) LINC01882 downstream of these CpG sites. We observed that LINC01882 is mainly expressed in T cells and that anti-CD3/CD28 activated naive CD4(+) T cells downregulate the expression of LINC01882. RNA sequencing analysis of LINC01882 knockdown in Jurkat T cells, using a combination of antisense oligo-nucleotides and RNA interference, revealed the upregulation of the transcription factor ZEB1 and kinase MAP2K4, both involved in IL-2 regulation. Overall, our data suggests the involvement of LINC01882 in T cell activation and hints towards an auxiliary role of these non-coding SNPs in autoimmunity associated with the PTPN2 locus. 

Ämnesord

MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Rheumatology and Autoimmunity (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Reumatologi och inflammation (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine (hsv//eng)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)

Nyckelord

RA
Genome-wide association
methQTL
eQTL
Long non-coding RNA
T cell

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy