SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-357383"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-357383" > T cells are influen...

  • Houtman, MirandaKarolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden (författare)

T cells are influenced by a long non-coding RNA in the autoimmune associated PTPN2 locus

  • Artikel/kapitelEngelska2018

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • ACADEMIC PRESS LTD- ELSEVIER SCIENCE LTD,2018
  • electronicrdacarrier

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:DiVA.org:uu-357383
  • urn:nbn:se:uu:diva-357383urn
  • https://doi.org/10.1016/j.jaut.2018.01.003DOI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:138396170URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • gratis
  • gratis
  • Non-coding SNPs in the protein tyrosine phosphatase non-receptor type 2 (PTPN2) locus have been linked with several autoimmune diseases, including rheumatoid arthritis, type I diabetes, and inflammatory bowel disease. However, the functional consequences of these SNPs are poorly characterized. Herein, we show in blood cells that SNPs in the PTPN2 locus are highly correlated with DNA methylation levels at four CpG sites downstream of PTPN2 and expression levels of the long non-coding RNA (IncRNA) LINC01882 downstream of these CpG sites. We observed that LINC01882 is mainly expressed in T cells and that anti-CD3/CD28 activated naive CD4(+) T cells downregulate the expression of LINC01882. RNA sequencing analysis of LINC01882 knockdown in Jurkat T cells, using a combination of antisense oligo-nucleotides and RNA interference, revealed the upregulation of the transcription factor ZEB1 and kinase MAP2K4, both involved in IL-2 regulation. Overall, our data suggests the involvement of LINC01882 in T cell activation and hints towards an auxiliary role of these non-coding SNPs in autoimmunity associated with the PTPN2 locus. 

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Shchetynsky, KlementyKarolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden (författare)
  • Chemin, KarineKarolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden (författare)
  • Hensvold, Aase HajKarolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden (författare)
  • Ramsköld, DanielKarolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden (författare)
  • Tandre, KarolinaUppsala universitet,Reumatologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)karotand (författare)
  • Eloranta, Maija-LeenaUppsala universitet,Reumatologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)maelo020 (författare)
  • Rönnblom, LarsUppsala universitet,Reumatologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab(Swepub:uu)larsronn (författare)
  • Uebe, SteffenUniv Erlangen Nurnberg, Inst Human Genet, Erlangen, Germany (författare)
  • Catrina, Anca IrinelKarolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden (författare)
  • Malmström, VivianneKarolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden (författare)
  • Padyukov, LeonidKarolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, Sweden (författare)
  • Chemin, KKarolinska Institutet(Swepub:ki)1412e22e469f014b1bd87ffb137dea51 (författare)
  • Catrina, AIKarolinska Institutet(Swepub:ki)adac1cb4ba3b6369adf58f6ec0b0f806 (författare)
  • Houtman, MKarolinska Institutet(Swepub:ki)f64f082f1af680d9c1fc68875b8bd89d (författare)
  • Tandre, K (författare)
  • Shchetynsky, KKarolinska Institutet(Swepub:ki)0d5a1baa975b6d9c035999af4e70cf36 (författare)
  • Padyukov, LKarolinska Institutet(Swepub:ki)bf16a48e59f975542f46e348282ee761 (författare)
  • Malmstrom, VKarolinska Institutet(Swepub:ki)81b644c493de8702f352dee549fb3384 (författare)
  • Hensvold, AHKarolinska Institutet(Swepub:ki)8e3ce8a2cffc34a2edf6bf77354e6339 (författare)
  • Ronnblom, L (författare)
  • Uebe, S (författare)
  • Ramskold, DKarolinska Institutet(Swepub:ki)217fe477f97645a92c6cd4845f015667 (författare)
  • Eloranta, ML (författare)
  • Karolinska Univ Hosp Solna, Karolinska Inst, Dept Med, Rheumatol Unit, Stockholm, SwedenReumatologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:90, s. 28-38
  • Ingår i:90, s. 28-38
  • Ingår i:90, s. 28-38
  • Ingår i:90, s. 28-38
  • Ingår i:Journal of Autoimmunity: ACADEMIC PRESS LTD- ELSEVIER SCIENCE LTD90, s. 28-380896-84111095-9157

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy