SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-368161"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:DiVA.org:uu-368161" > A Transcriptome-Wid...

A Transcriptome-Wide Association Study Among 97,898 Women to Identify Candidate Susceptibility Genes for Epithelial Ovarian Cancer Risk.

Lu, Yingchang, (författare)
Vanderbilt University
Olsson, Håkan, (författare)
Lunds universitet, Lund University, Medicinska fakulteten, Faculty of Medicine, Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund, Department of Clinical Sciences, Lund, Sektion V, Division V, Kirurgi, Lund, Surgery (Lund), Lunds Melanomstudiegrupp, Lund Melanoma Study Group, Strategiska forskningsområden, Strategic Research Areas, BioCARE: Biomarkers in Cancer Medicine improving Health Care, Education and Innovation, BioCARE: Biomarkers in Cancer Medicine improving Health Care, Education and Innovation, EpiHealth: Epidemiology for Health, EpiHealth: Epidemiology for Health
Long, Jirong, (författare)
Vanderbilt University
visa fler...
 (författare)
Beeghly-Fadiel, Alicia (författare)
Wu, Lang (författare)
Guo, Xingyi (författare)
Li, Bingshan (författare)
Schildkraut, Joellen M (författare)
Im, Hae Kyung (författare)
Chen, Yian A (författare)
Permuth, Jennifer B (författare)
Reid, Brett M (författare)
Teer, Jamie K (författare)
Moysich, Kirsten B (författare)
Andrulis, Irene L (författare)
Anton-Culver, Hoda (författare)
Arun, Banu K (författare)
Bandera, Elisa V (författare)
Barkardottir, Rosa B (författare)
Barnes, Daniel R (författare)
Benitez, Javier (författare)
Bjorge, Line (författare)
Brenton, James (författare)
Butzow, Ralf (författare)
Caldes, Trinidad (författare)
Caligo, Maria A (författare)
Campbell, Ian (författare)
Chang-Claude, Jenny (författare)
Claes, Kathleen B M (författare)
Couch, Fergus J (författare)
Cramer, Daniel W (författare)
Daly, Mary B (författare)
deFazio, Anna (författare)
Dennis, Joe (författare)
Diez, Orland (författare)
Domchek, Susan M (författare)
Dörk, Thilo (författare)
Easton, Douglas F (författare)
Eccles, Diana M (författare)
Fasching, Peter A (författare)
Fortner, Renée T (författare)
Fountzilas, George (författare)
Friedman, Eitan (författare)
Ganz, Patricia A (författare)
Garber, Judy (författare)
Giles, Graham G (författare)
Godwin, Andrew K (författare)
Goldgar, David E (författare)
Goodman, Marc T (författare)
Greene, Mark H (författare)
Gronwald, Jacek (författare)
Hamann, Ute (författare)
Heitz, Florian (författare)
Hildebrandt, Michelle A T (författare)
Høgdall, Claus K (författare)
Hollestelle, Antoinette (författare)
Hulick, Peter J (författare)
Huntsman, David G (författare)
Imyanitov, Evgeny N (författare)
Isaacs, Claudine (författare)
Jakubowska, Anna (författare)
James, Paul (författare)
Karlan, Beth Y (författare)
Kelemen, Linda E (författare)
Kiemeney, Lambertus A (författare)
Kjaer, Susanne K (författare)
Kwong, Ava (författare)
Le, Nhu D (författare)
Leslie, Goska (författare)
Lesueur, Fabienne (författare)
Levine, Douglas A (författare)
Mattiello, Amalia (författare)
May, Taymaa (författare)
McGuffog, Lesley (författare)
McNeish, Iain A (författare)
Merritt, Melissa A (författare)
Modugno, Francesmary (författare)
Montagna, Marco (författare)
Neuhausen, Susan L (författare)
Nevanlinna, Heli (författare)
Nielsen, Finn C (författare)
Nikitina-Zake, Liene (författare)
Nussbaum, Robert L (författare)
Offit, Kenneth (författare)
Olah, Edith (författare)
Olopade, Olufunmilayo I (författare)
Olson, Sara H (författare)
Osorio, Ana (författare)
Park, Sue K (författare)
Parsons, Michael T (författare)
Peeters, Petra H M (författare)
Pejovic, Tanja (författare)
Peterlongo, Paolo (författare)
Phelan, Catherine M (författare)
Pujana, Miquel Angel (författare)
Ramus, Susan J (författare)
Rennert, Gad (författare)
Risch, Harvey (författare)
Rodriguez, Gustavo C (författare)
Rodríguez-Antona, Cristina (författare)
Romieu, Isabelle (författare)
Rookus, Matti A (författare)
Rossing, Mary Anne (författare)
Rzepecka, Iwona K (författare)
Sandler, Dale P (författare)
Schmutzler, Rita K (författare)
Setiawan, Veronica W (författare)
Sharma, Priyanka (författare)
Sieh, Weiva (författare)
Simard, Jacques (författare)
Singer, Christian F (författare)
Song, Honglin (författare)
Southey, Melissa C (författare)
Spurdle, Amanda B (författare)
Sutphen, Rebecca (författare)
Swerdlow, Anthony J (författare)
Teixeira, Manuel R (författare)
Teo, Soo H (författare)
Thomassen, Mads (författare)
Tischkowitz, Marc (författare)
Toland, Amanda E (författare)
Trichopoulou, Antonia (författare)
Tung, Nadine (författare)
Tworoger, Shelley S (författare)
van Rensburg, Elizabeth J (författare)
Vanderstichele, Adriaan (författare)
Vega, Ana (författare)
Edwards, Digna Velez (författare)
Webb, Penelope M (författare)
Weitzel, Jeffrey N (författare)
Wentzensen, Nicolas (författare)
White, Emily (författare)
Wolk, Alicja, (författare)
Uppsala universitet, Ortopedi
Wu, Anna H (författare)
Yannoukakos, Drakoulis (författare)
Zorn, Kristin K (författare)
Gayther, Simon A (författare)
Antoniou, Antonis C (författare)
Berchuck, Andrew (författare)
Goode, Ellen L (författare)
Chenevix-Trench, Georgia (författare)
Sellers, Thomas A (författare)
Pharoah, Paul D P (författare)
Zheng, Wei (författare)
Doerk, T (författare)
Hogdall, CK (författare)
Rodriguez-Antona, C (författare)
Rensburg, EJ (författare)
visa färre...
Lunds universitet EpiHealth: Epidemiology for Health. (creator_code:org_t)
Lunds universitet Lunds Melanomstudiegrupp. (creator_code:org_t)
visa fler...
Lunds universitet BioCARE: Biomarkers in Cancer Medicine improving Health Care, Education and Innovation. (creator_code:org_t)
Uppsala universitet Medicinska och farmaceutiska vetenskapsområdet. Medicinska fakulteten. Institutionen för kirurgiska vetenskaper. Ortopedi. (creator_code:org_t)
visa färre...
2018
Engelska.
Ingår i: Cancer Research. - 0008-5472 .- 1538-7445. ; 78:18, s. 5419-5430
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • .<h2>Abstract</h2>Large-scale genome-wide association studies (GWAS) have identified approximately 35 loci associated with epithelial ovarian cancer (EOC) risk. The majority of GWAS-identified disease susceptibility variants are located in noncoding regions, and causal genes underlying these associations remain largely unknown. Here, we performed a transcriptome-wide association study to search for novel genetic loci and plausible causal genes at known GWAS loci. We used RNA sequencing data (68 normal ovarian tissue samples from 68 individuals and 6,124 cross-tissue samples from 369 individuals) and high-density genotyping data from European descendants of the Genotype-Tissue Expression (GTEx V6) project to build ovarian and cross-tissue models of genetically regulated expression using elastic net methods. We evaluated 17,121 genes for their cis-predicted gene expression in relation to EOC risk using summary statistics data from GWAS of 97,898 women, including 29,396 EOC cases. With a Bonferroni-corrected significance level of P &lt; 2.2 × 10−6, we identified 35 genes, including FZD4 at 11q14.2 (Z = 5.08, P = 3.83 × 10−7, the cross-tissue model; 1 Mb away from any GWAS-identified EOC risk variant), a potential novel locus for EOC risk. All other 34 significantly associated genes were located within 1 Mb of known GWAS-identified loci, including 23 genes at 6 loci not previously linked to EOC risk. Upon conditioning on nearby known EOC GWAS-identified variants, the associations for 31 genes disappeared and three genes remained (P &lt; 1.47 × 10−3). These data identify one novel locus (FZD4) and 34 genes at 13 known EOC risk loci associated with EOC risk, providing new insights into EOC carcinogenesis.Significance: Transcriptomic analysis of a large cohort confirms earlier GWAS loci and reveals FZD4 as a novel locus associated with EOC risk. Cancer Res; 78(18); 5419–30. ©2018 AACR.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Kirurgi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Surgery (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Lu, Yingchang
Olsson, Håkan
Long, Jirong
Beeghly-Fadiel, ...
Wu, Lang
visa fler...
Guo, Xingyi
Li, Bingshan
Schildkraut, Joe ...
Im, Hae Kyung
Chen, Yian A
Permuth, Jennife ...
Reid, Brett M
Teer, Jamie K
Moysich, Kirsten ...
Andrulis, Irene ...
Anton-Culver, Ho ...
Arun, Banu K
Bandera, Elisa V
Barkardottir, Ro ...
Barnes, Daniel R
Benitez, Javier
Bjorge, Line
Brenton, James
Butzow, Ralf
Caldes, Trinidad
Caligo, Maria A
Campbell, Ian
Chang-Claude, Je ...
Claes, Kathleen ...
Couch, Fergus J
Cramer, Daniel W
Daly, Mary B
deFazio, Anna
Dennis, Joe
Diez, Orland
Domchek, Susan M
Dörk, Thilo
Easton, Douglas ...
Eccles, Diana M
Fasching, Peter ...
Fortner, Renée T
Fountzilas, Geor ...
Friedman, Eitan
Ganz, Patricia A
Garber, Judy
Giles, Graham G
Godwin, Andrew K
Goldgar, David E
Goodman, Marc T
Greene, Mark H
Gronwald, Jacek
Hamann, Ute
Heitz, Florian
Hildebrandt, Mic ...
Høgdall, Claus K
Hollestelle, Ant ...
Hulick, Peter J
Huntsman, David ...
Imyanitov, Evgen ...
Isaacs, Claudine
Jakubowska, Anna
James, Paul
Karlan, Beth Y
Kelemen, Linda E
Kiemeney, Lamber ...
Kjaer, Susanne K
Kwong, Ava
Le, Nhu D
Leslie, Goska
Lesueur, Fabienn ...
Levine, Douglas ...
Mattiello, Amali ...
May, Taymaa
McGuffog, Lesley
McNeish, Iain A
Merritt, Melissa ...
Modugno, Frances ...
Montagna, Marco
Neuhausen, Susan ...
Nevanlinna, Heli
Nielsen, Finn C
Nikitina-Zake, L ...
Nussbaum, Robert ...
Offit, Kenneth
Olah, Edith
Olopade, Olufunm ...
Olson, Sara H
Osorio, Ana
Park, Sue K
Parsons, Michael ...
Peeters, Petra H ...
Pejovic, Tanja
Peterlongo, Paol ...
Phelan, Catherin ...
Pujana, Miquel A ...
Ramus, Susan J
Rennert, Gad
Risch, Harvey
Rodriguez, Gusta ...
Rodríguez-Antona ...
Romieu, Isabelle
Rookus, Matti A
Rossing, Mary An ...
Rzepecka, Iwona ...
Sandler, Dale P
Schmutzler, Rita ...
Setiawan, Veroni ...
Sharma, Priyanka
Sieh, Weiva
Simard, Jacques
Singer, Christia ...
Song, Honglin
Southey, Melissa ...
Spurdle, Amanda ...
Sutphen, Rebecca
Swerdlow, Anthon ...
Teixeira, Manuel ...
Teo, Soo H
Thomassen, Mads
Tischkowitz, Mar ...
Toland, Amanda E
Trichopoulou, An ...
Tung, Nadine
Tworoger, Shelle ...
van Rensburg, El ...
Vanderstichele, ...
Vega, Ana
Edwards, Digna V ...
Webb, Penelope M
Weitzel, Jeffrey ...
Wentzensen, Nico ...
White, Emily
Wolk, Alicja
Wu, Anna H
Yannoukakos, Dra ...
Zorn, Kristin K
Gayther, Simon A
Antoniou, Antoni ...
Berchuck, Andrew
Goode, Ellen L
Chenevix-Trench, ...
Sellers, Thomas ...
Pharoah, Paul D ...
Zheng, Wei
Doerk, T
Hogdall, CK
Rodriguez-Antona ...
Rensburg, EJ
visa färre...
Om ämnet
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Medicinska grund ...
och Medicinsk geneti ...
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Klinisk medicin
och Cancer och onkol ...
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Klinisk medicin
och Kirurgi
Artiklar i publikationen
Cancer Research
Av lärosätet
Lunds universitet
Uppsala universitet
Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy