Identification of Novel Susceptibility Loci and Genes for Prostate Cancer Risk : A Transcriptome-Wide Association Study in over 140,000 European Descendants
Wu, Lang (författare)
Vanderbilt Univ, Med Ctr, Div Epidemiol, Dept Med,Vanderbilt Epidemiol Ctr,Vanderbilt Ingr, Nashville, TN 37203 USA;Univ Hawaii Manoa, Canc Epidemiol Div, Populat Sci Pacific Program, Univ Hawaii Canc Ctr, Honolulu, HI 96822 USA
Wang, Jifeng (författare)
Vanderbilt Univ, Med Ctr, Div Epidemiol, Dept Med,Vanderbilt Epidemiol Ctr,Vanderbilt Ingr, Nashville, TN 37203 USA;Fifth Peoples Hosp Shanghai, Dept Urol, Shanghai, Peoples R China
Cai, Qiuyin (författare)
Vanderbilt Univ, Med Ctr, Div Epidemiol, Dept Med,Vanderbilt Epidemiol Ctr,Vanderbilt Ingr, Nashville, TN 37203 USA
Vanderbilt Univ, Med Ctr, Div Epidemiol, Dept Med,Vanderbilt Epidemiol Ctr,Vanderbilt Ingr, Nashville, TN 37203 USA
Emami, Nima C. (författare)
Univ Calif San Francisco, Program Biol & Med Informat, San Francisco, CA 94143 USA;Univ Calif San Francisco, Dept Epidemiol & Biostat, San Francisco, CA 94143 USA
Long, Jirong (författare)
Vanderbilt Univ, Med Ctr, Div Epidemiol, Dept Med,Vanderbilt Epidemiol Ctr,Vanderbilt Ingr, Nashville, TN 37203 USA
Shu, Xiao-Ou (författare)
Vanderbilt Univ, Med Ctr, Div Epidemiol, Dept Med,Vanderbilt Epidemiol Ctr,Vanderbilt Ingr, Nashville, TN 37203 USA
Lu, Yingchang (författare)
Vanderbilt Univ, Med Ctr, Div Epidemiol, Dept Med,Vanderbilt Epidemiol Ctr,Vanderbilt Ingr, Nashville, TN 37203 USA
Guo, Xingyi (författare)
Vanderbilt Univ, Med Ctr, Div Epidemiol, Dept Med,Vanderbilt Epidemiol Ctr,Vanderbilt Ingr, Nashville, TN 37203 USA
Univ Calif Los Angeles, David Geffen Sch Med, Dept Pathol & Lab Med, Los Angeles, CA 90095 USA;Univ Calif Los Angeles, David Geffen Sch Med, Dept Human Genet, Los Angeles, CA 90095 USA
Penney, Kathryn L. (författare)
Brigham & Womens Hosp, Dept Med, Channing Div Network Med, 75 Francis St, Boston, MA 02115 USA;Harvard TH Chan Sch Publ Hlth, Dept Epidemiol, Boston, MA USA;Harvard Med Sch, Channing Div Network Med, Dept Med, Brigham & Womens Hosp, Boston, MA 02115 USA
Freedman, Matthew L. (författare)
Dana Farber Canc Inst, Dept Med Oncol, Boston, MA 02115 USA;Broad Inst, Cambridge, MA USA
Kote-Jarai, Zsofia (författare)
Inst Canc Res, Div Genet & Epidemiol, London, England;Royal Marsden NHS Fdn Trust, London, England;Inst Canc Res, London, England
Witte, John S. (författare)
Univ Calif San Francisco, Program Biol & Med Informat, San Francisco, CA 94143 USA;Univ Calif San Francisco, Dept Epidemiol & Biostat, San Francisco, CA 94143 USA
Haiman, Christopher A. (författare)
Univ Southern Calif, Dept Prevent Med, Los Angeles, CA USA;Univ Southern Calif, Dept Prevent Med, Keck Sch Med, Norris Comprehens Canc Ctr, Los Angeles, CA USA
Eeles, Rosalind A. (författare)
Inst Canc Res, Div Genet & Epidemiol, London, England;Royal Marsden NHS Fdn Trust, London, England;Inst Canc Res, London, England
Zheng, Wei (författare)
Vanderbilt Univ, Med Ctr, Div Epidemiol, Dept Med,Vanderbilt Epidemiol Ctr,Vanderbilt Ingr, Nashville, TN 37203 USA
Benlloch, Sara (författare)
Inst Canc Res, London, England;Univ Cambridge, Ctr Canc Genet Epidemiol, Dept Publ Hlth & Primary Care, Strangeways Res Lab, Cambridge, England
Henderson, Brian E. (författare)
Univ Southern Calif, Dept Prevent Med, Keck Sch Med, Norris Comprehens Canc Ctr, Los Angeles, CA USA
Conti, David, V (författare)
Univ Southern Calif, Dept Prevent Med, Keck Sch Med, Norris Comprehens Canc Ctr, Los Angeles, CA USA
Schumacher, Fredrick R. (författare)
Case Western Reserve Univ, Dept Populat & Quantitat Hlth Sci, Cleveland, OH 44106 USA;Univ Hosp Cleveland, Seidman Canc Ctr, Cleveland, OH 44106 USA
Easton, Douglas (författare)
Univ Cambridge, Ctr Canc Genet Epidemiol, Dept Publ Hlth & Primary Care, Strangeways Res Lab, Cambridge, England
Al Olama, Ali Amin (författare)
Univ Cambridge, Ctr Canc Genet Epidemiol, Dept Publ Hlth & Primary Care, Strangeways Res Lab, Cambridge, England;Univ Cambridge, Dept Clin Neurosci, Cambridge, England
Muir, Kenneth (författare)
Univ Manchester, Div Populat Hlth Hlth Serv Res & Primary Care, Oxford Rd, Manchester, Lancs, England;Univ Warwick, Warwick Med Sch, Coventry, W Midlands, England
Berndt, Sonja, I (författare)
NCI, Div Canc Epidemiol & Genet, NIH, Bethesda, MD 20892 USA
Chanock, Stephen (författare)
NCI, Div Canc Epidemiol & Genet, NIH, Bethesda, MD 20892 USA
Albanes, Demetrius (författare)
NCI, Div Canc Epidemiol & Genet, NIH, Bethesda, MD 20892 USA
Weinstein, Stephanie (författare)
NCI, Div Canc Epidemiol & Genet, NIH, Bethesda, MD 20892 USA
Koutros, Stella (författare)
NCI, Div Canc Epidemiol & Genet, NIH, Bethesda, MD 20892 USA
Wildund, Fredrik (författare)
Karolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostat, Stockholm, Sweden
Gronberg, Henrik (författare)
Karolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostat, Stockholm, Sweden
Gapstur, Susan M. (författare)
Amer Canc Soc, Epidemiol Res Program, Atlanta, GA 30329 USA
Stevens, Victoria L. (författare)
Amer Canc Soc, Epidemiol Res Program, Atlanta, GA 30329 USA
Tangen, Catherine M. (författare)
Fred Hutchinson Canc Res Ctr, SWOG Stat Ctr, 1124 Columbia St, Seattle, WA 98104 USA
Univ Cambridge, Dept Oncol, Addenbrookes Hosp, Cambridge, England;Canc Res UK Cambridge Res Inst, Li Ka Shing Ctr, Cambridge, England
Hamdy, Freddie C. (författare)
Univ Oxford, Nuffield Dept Surg Sci, Oxford, England;Univ Oxford, Fac Med Sci, John Radcliffe Hosp, Oxford, England
Donovan, Jenny L. (författare)
Univ Bristol, Sch Social & Community Med, Bristol, Avon, England
Travis, Ruth C. (författare)
Univ Oxford, Canc Epidemiol Unit, Nuffield Dept Populat Hlth, Oxford, England
Hamilton, Robert J. (författare)
Princess Margaret Canc Ctr, Dept Surg Oncol, Toronto, ON, Canada
Rosenstein, Bany S. (författare)
Icahn Sch Med Mt Sinai, Dept Radiat Oncol, New York, NY 10029 USA;Icahn Sch Med Mt Sinai, Dept Genet & Genom Sci, New York, NY 10029 USA
Lu, Yong-Jie (författare)
Queen Mary Univ London, Ctr Mol Oncol, Barts Canc Inst, John Vane Sci Ctr, London, England
Giles, Graham G. (författare)
Canc Council Victoria, Canc Epidemiol & Intelligence Div, Melbourne, Vic, Australia;Univ Melbourne, Ctr Epidemiol & Biostat, Melbourne Sch Populat & Global Hlth, Melbourne, Vic, Australia
Kibel, Adam S. (författare)
Brigham & Womens Hosp, Div Urol Surg, 75 Francis St, Boston, MA 02115 USA
Vega, Ana (författare)
IDIS, Fdn Publ Galega Med Xenom SERGAS, Grp Med Xenom, CIBERER, Santiago De Compostela, Spain
Kogevinas, Manolis (författare)
Barcelona Inst Global Hlth ISGlobal, Ctr Res Environm Epidemiol CREAL, Barcelona, Spain;CIBERESP, Madrid, Spain;IMIM Hosp del Mar Res Inst, Barcelona, Spain;Univ Pompeu Fabra, Barcelona, Spain
Park, Jong Y. (författare)
H Lee Moffitt Canc Ctr & Res Inst, Dept Canc Epidemiol, Tampa, FL USA
Stanford, Janet L. (författare)
Fred Hutchinson Canc Res Ctr, Div Publ Hlth Sci, 1124 Columbia St, Seattle, WA 98104 USA
Newcomb, Lisa F. (författare)
Univ Washington, Dept Epidemiol, Sch Publ Hlth, Seattle, WA 98195 USA;Univ Washington, Dept Urol, Seattle, WA 98195 USA
Cybulski, Cezary (författare)
Pomeranian Med Univ, Int Hereditary Canc Ctr, Dept Genet & Pathol, Szczecin, Poland
Nordestgaard, Borge G. (författare)
Univ Copenhagen, Fac Hlth & Med Sci, Copenhagen, Denmark;Copenhagen Univ Hosp, Dept Clin Biochem, Herlev & Gentofte Hosp, Herlev, Denmark
Brenner, Hermann (författare)
German Canc Res Ctr, Div Clin Epidemiol & Aging Res, Heidelberg, Germany;German Canc Res Ctr, German Canc Consortium DKTZ, Heidelberg, Germany;German Canc Res Ctr, Div Prevent Oncol, Heidelberg, Germany;Natl Ctr Tumor Dis NCT, Heidelberg, Germany
Maier, Christian (författare)
Univ Hosp Ulm, Inst Human Genet, Ulm, Germany
Kim, Jeri (författare)
Univ Texas MD Anderson Canc Ctr, Dept Genitourinary Med Oncol, Houston, TX 77030 USA
John, Esther M. (författare)
Stanford Univ, Dept Med Oncol, Sch Med, Stanford, CA USA;Stanford Univ, Sch Med, Stanford Canc Inst, Stanford, CA 94305 USA
Univ Manchester, Manchester Canc Res Ctr, Hlth Innovat Manchester,Fac Biol Med & Hlth,Div C, Manchester Acad Hlth Sci Ctr,NIHR Manchester Biom, Manchester, Lancs, England
Gago Dominguez, Manuela (författare)
Complejo Hosp Univ Santiago, Genom Med Grp, Serv Galego Saude,Galician Fdn Genom Med,SERGAS, Inst Invest Sanitaria Santiago de Compostela IDIS, Santiago De Compostela, Spain;Univ Calif San Diego, Moores Canc Ctr, La Jolla, CA 92093 USA
Roobol, Monique J. (författare)
Erasmus MC, Dept Urol, Rotterdam, Netherlands
Menegaux, Florence (författare)
Univ Paris Saclay, Univ Paris Sud, Canc & Environm Grp, Ctr Res Epidemiol & Populat Hlth CESP,INSERM, Villejuif, France
Khaw, Kay-Tee (författare)
Univ Cambridge, Clin Gerontol Unit, Cambridge, England
Cannon-Albright, Lisa (författare)
Univ Utah, Sch Med, Dept Med, Div Genet Epidemiol, Salt Lake City, UT USA;Vet Affairs Med Ctr, George E Wahlen Dept, Salt Lake City, UT 84148 USA
Thibodeau, Stephen N. (författare)
Univ Surrey, Guildford, Surrey, England;Mayo Clin, Dept Lab Med & Pathol, Rochester, MN USA
Hunter, David J. (författare)
Harvard TH Chan Sch Publ Hlth, Program Genet Epidemiol & Stat Genet, Dept Epidemiol, Boston, MA USA
Blot, William J. (författare)
Vanderbilt Univ, Med Ctr, Div Epidemiol, Dept Med, Nashville, TN 37203 USA;Int Epidemiol Inst, Rockville, MD USA
Genome-wide association study-identified prostate cancer risk variants explain only a relatively small fraction of its familial relative risk, and the genes responsible for many of these identified associations remain unknown. To discover novel prostate cancer genetic loci and possible causal genes at previously identified risk loci, we performed a transcriptome-wide association study in 79,194 cases and 61,112 controls of European ancestry. Using data from the Genotype-Tissue Expression Project, we established genetic models to predict gene expression across the transcriptome for both prostate models and cross-tissue models and evaluated model performance using two independent datasets. We identified significant associations for 137 genes at P < 2.61 x 10(-6), a Bonferroni-corrected threshold, including nine genes that remained significant at P < 2.61 x 10(-6) after adjusting for all known prostate cancer risk variants in nearby regions. Of the 128 remaining associated genes, 94 have not yet been reported as potential target genes at known loci. We silenced 14 genes and many showed a consistent effect on viability and colony-forming efficiency in three cell lines. Our study provides substantial new information to advance our understanding of prostate cancer genetics and biology. Significance: This study identifies novel prostate cancer genetic loci and possible causal genes, advancing our understanding of the molecular mechanisms that drive prostate cancer.
Ämnesord
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Basic Medicine (hsv//eng)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES -- Clinical Medicine (hsv//eng)