SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/186081"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/186081" > Transcriptome signa...

Transcriptome signatures in Helicobacter pylori-infected mucosa identifies acidic mammalian chitinase loss as a corpus atrophy marker

Nookaew, Intawat, 1977 (författare)
Chalmers University of Technology,Chalmers tekniska högskola
Thorell, Kaisa (författare)
Chalmers University of Technology,University of Gothenburg,Chalmers tekniska högskola,Göteborgs universitet (GU),Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för mikrobiologi och immunologi,Institute of Biomedicine, Department of Microbiology and Immunology
Worah, Kuntal (författare)
University of Gothenburg,Chalmers University of Technology,Göteborgs universitet (GU),Chalmers tekniska högskola,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för mikrobiologi och immunologi,Institute of Biomedicine, Department of Microbiology and Immunology
visa fler...
Wang, Shugui (författare)
Hibberd, Martin Lloyd (författare)
Sjövall, Henrik, 1954 (författare)
University of Gothenburg,Göteborgs universitet (GU),Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för invärtesmedicin och klinisk nutrition,Institute of Medicine, Department of Internal Medicine and Clinical Nutrition
Pettersson, Sven (författare)
Nielsen, Jens B., 1962 (författare)
Lundin, Samuel B, 1970 (författare)
University of Gothenburg,Göteborgs universitet (GU),Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för biomedicin, avdelningen för mikrobiologi och immunologi,Institute of Biomedicine, Department of Microbiology and Immunology
Sjovall, H (författare)
Nookaew, I (författare)
Thorell, K (författare)
Hibberd, ML (författare)
Wang, SG (författare)
Lundin, SB (författare)
Pettersson, S (författare)
Karolinska Institutet
Worah, K (författare)
Nielsen, J (författare)
Nielsen, Jens B, 1962 (författare)
Chalmers University of Technology,Chalmers tekniska högskola
visa färre...
 (creator_code:org_t)
 
visa fler...
 
 
 
visa färre...
2013
2013
Engelska.
Ingår i: BMC Medical Genomics. - 1755-8794. ; 6:41
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The majority of gastric cancer cases are believed to be caused by chronic infection with the bacterium Helicobacter pylori, and atrophic corpus gastritis is a predisposing condition to gastric cancer development. We aimed to increase understanding of the molecular details of atrophy by performing a global transcriptome analysis of stomach tissue. Biopsies from patients with different stages of H. pylori infection were taken from both the antrum and corpus mucosa and analyzed on microarrays. The stages included patients without current H. pylori infection, H. pylori-infected without corpus atrophy and patients with current or past H. pylori-infection with corpus-predominant atrophic gastritis. Using clustering and integrated analysis, we found firm evidence for antralization of the corpus mucosa of atrophy patients. This antralization harbored gain of gastrin expression, as well as loss of expression of corpus-related genes, such as genes associated with acid production, energy metabolism and blood clotting. The analyses provided detailed molecular evidence for simultaneous intestinal metaplasia (IM) and spasmolytic polypeptide expressing metaplasia (SPEM) in atrophic corpus tissue. Finally, acidic mammalian chitinase, a chitin-degrading enzyme produced by chief cells, was shown to be strongly down-regulated in corpus atrophy. Transcriptome analysis revealed several gene groups which are related to development of corpus atrophy, some of which were increased also in H. pylori-infected non-atrophic patients. Furthermore, loss of acidic chitinase expression is a promising marker for corpus atrophy.

Nyckelord

Corpus gastritis
Gastric cancer
Integrated analysis
Acidic mammalian chitinase
Integrated analysis

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy