SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/204289"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/204289" > Altered DNA Methyla...

  • Nilsson, E. (författare)

Altered DNA Methylation and Differential Expression of Genes Influencing Metabolism and Inflammation in Adipose Tissue From Subjects With Type 2 Diabetes

  • Artikel/kapitelEngelska2014

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • American Diabetes Association Inc.2014

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:gup.ub.gu.se/204289
  • https://gup.ub.gu.se/publication/204289URI
  • https://doi.org/10.2337/db13-1459DOI
  • https://lup.lub.lu.se/record/4455578URI
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:129685800URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • gratis
  • Genetics, epigenetics, and environment may together affect the susceptibility for type 2 diabetes (T2D). Our aim was to dissect molecular mechanisms underlying T2D using genome-wide expression and DNA methylation data in adipose tissue from monozygotic twin pairs discordant for T2D and independent case-control cohorts. In adipose tissue from diabetic twins, we found decreased expression of genes involved in oxidative phosphorylation; carbohydrate, amino acid, and lipid metabolism; and increased expression of genes involved in inflammation and glycan degradation. The most differentially expressed genes included ELOVL6, GYS2, FADS1, SPP1 (OPN), CCL18, and IL1RN. We replicated these results in adipose tissue from an independent case-control cohort. Several candidate genes for obesity and T2D (e.g., IRS1 and VEGFA) were differentially expressed in discordant twins. We found a heritable contribution to the genome-wide DNA methylation variability in twins. Differences in methylation between monozygotic twin pairs discordant for T2D were subsequently modest. However, 15,627 sites, representing 7,046 genes including PPARG, KCNQ1, TCF7L2, and IRS1, showed differential DNA methylation in adipose tissue from unrelated subjects with T2D compared with control subjects. A total of 1,410 of these sites also showed differential DNA methylation in the twins discordant for T2D. For the differentially methylated sites, the heritability estimate was 0.28. We also identified copy number variants (CNVs) in monozygotic twin pairs discordant for T2D. Taken together, subjects with T2D exhibit multiple transcriptional and epigenetic changes in adipose tissue relevant to the development of the disease.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Jansson, Per-Anders,1961Gothenburg University,Göteborgs universitet,Wallenberglaboratoriet,Wallenberg Laboratory(Swepub:gu)xjansp (författare)
  • Perfilyev, A. (författare)
  • Volkov, P. (författare)
  • Pedersen, M. (författare)
  • Svensson, Maria KGothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin,Institute of Medicine(Swepub:gu)xsmara (författare)
  • Poulsen, P. (författare)
  • Ribel-Madsen, R. (författare)
  • Pedersen, N. L. (författare)
  • Almgren, P. (författare)
  • Fadista, J. (författare)
  • Ronn, T. (författare)
  • Pedersen, B. K. (författare)
  • Scheele, C. (författare)
  • Vaag, A. (författare)
  • Ling, C. (författare)
  • Poulsen, Pernille (författare)
  • Vaag, AllanLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-ava (författare)
  • Nilsson, Emma ALund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetes - epigenetik,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups,Diabetes - Epigenetics(Swepub:lu)endo-eca (författare)
  • Pedersen, Nancy L (författare)
  • Jansson, Per Anders (författare)
  • Perfilyev, AlexanderLund University,Lunds universitet,Diabetes - epigenetik,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetes - Epigenetics,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-apy (författare)
  • Ribel-Madsen, Rasmus (författare)
  • Pedersen, Maria (författare)
  • Almgren, PeterLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)endo-pal (författare)
  • Rönn, TinaLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetes - epigenetik,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups,Diabetes - Epigenetics(Swepub:lu)med-tar (författare)
  • Klarlund-Pedersen, Bente (författare)
  • Scheele, Camilla (författare)
  • Fadista, JoaoLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-jft (författare)
  • Ling, CharlotteLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetes - epigenetik,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups,Diabetes - Epigenetics(Swepub:lu)endo-cl0 (författare)
  • Volkov, PetrLund University,Lunds universitet,Genomik, diabetes och endokrinologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diabetes - epigenetik,Genomics, Diabetes and Endocrinology,Lund University Research Groups,Diabetes - Epigenetics(Swepub:lu)med-pvo (författare)
  • Ronn, T (författare)
  • Ribel-Madsen, R (författare)
  • Perfilyev, A (författare)
  • Poulsen, P (författare)
  • Pedersen, NLKarolinska Institutet(Swepub:ki)bff332d224642a6990fd8af41144bb54 (författare)
  • Scheele, C (författare)
  • Pedersen, BK (författare)
  • Vaag, A (författare)
  • Jansson, PA (författare)
  • Nilsson, E (författare)
  • Svensson, MK (författare)
  • Fadista, J (författare)
  • Almgren, P (författare)
  • Volkov, P (författare)
  • Ling, C (författare)
  • Pedersen, M (författare)
  • Göteborgs universitetWallenberglaboratoriet (creator_code:org_t)
  • Göteborgs universitet
  • Gothenburg University
  • Göteborgs universitet
  • Gothenburg University

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Diabetes: American Diabetes Association Inc.63:9, s. 2962-29760012-17971939-327X

Internetlänk

Hitta via bibliotek

  • Diabetes (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy