SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/222738"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/222738" > Visualizing the ent...

Visualizing the entire DNA from a chromosome in a single frame

Freitag, Camilla (författare)
University of Gothenburg,Göteborgs universitet (GU),Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)
Noble, C. (författare)
Lund University,Lunds universitet
Fritzsche, Joachim, 1977 (författare)
Chalmers University of Technology,University of Gothenburg,Chalmers tekniska högskola,Göteborgs universitet (GU),Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)
visa fler...
Persson, Fredrik, 1979 (författare)
University of Gothenburg,Göteborgs universitet (GU),Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)
Reiter-Schad, M. (författare)
Lund University,Lunds universitet
Nilsson, A. N. (författare)
Graneli, Annette, 1973 (författare)
University of Gothenburg,Göteborgs universitet (GU),Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)
Ambjornsson, T. (författare)
Lund University,Lunds universitet
Mir, K. U. (författare)
Harvard University, USA
Tegenfeldt, Jonas O. (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för fysik (GU),Department of Physics (GU)
Reiter-Schad, Michaela (författare)
Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics,Department of Astronomy and Theoretical Physics,Faculty of Science
Graneli, A. (författare)
University of Gothenburg
Noble, Charleston (författare)
Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics,Department of Astronomy and Theoretical Physics,Faculty of Science
Tegenfeldt, Jonas (författare)
University of Gothenburg,Lund University,Lunds universitet,Fasta tillståndets fysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Solid State Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
Persson, F. (författare)
Uppsala University,University of Gothenburg
Fritzsche, J. (författare)
University of Gothenburg,Chalmers University of Technology
Nilsson, Adam (författare)
Lund University,Lunds universitet,Atomfysik,Fysiska institutionen,Institutioner vid LTH,Lunds Tekniska Högskola,Atomic Physics,Department of Physics,Departments at LTH,Faculty of Engineering, LTH
Freitag, C. (författare)
University of Gothenburg,Lund University
Ambjörnsson, Tobias (författare)
Lund University,Lunds universitet,Beräkningsbiologi och biologisk fysik,Institutionen för astronomi och teoretisk fysik,Naturvetenskapliga fakulteten,Computational Biology and Biological Physics,Department of Astronomy and Theoretical Physics,Faculty of Science
Tegenfeldt, J. O. (författare)
University of Gothenburg,Göteborgs universitet (GU)
Ambjoernsson, T. (författare)
Persson, F (författare)
Uppsala universitet,Beräknings- och systembiologi
Nilsson, A. (författare)
Lund University,Lunds universitet
visa färre...
 (creator_code:org_t)
 
visa fler...
 
visa färre...
American Institute of Physics (AIP), 2015
2015
Engelska.
Ingår i: Biomicrofluidics. - : American Institute of Physics (AIP). - 1932-1058. ; 9:4
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The contiguity and phase of sequence information are intrinsic to obtain complete understanding of the genome and its relationship to phenotype. We report the fabrication and application of a novel nanochannel design that folds megabase lengths of genomic DNA into a systematic back-and-forth meandering path. Such meandering nanochannels enabled us to visualize the complete 5.7 Mbp (1mm) stained DNA length of a Schizosaccharomyces pombe chromosome in a single frame of a CCD. We were able to hold the DNA in situ while implementing partial denaturation to obtain a barcode pattern that we could match to a reference map using the Poland-Scheraga model for DNA melting. The facility to compose such long linear lengths of genomic DNA in one field of view enabled us to directly visualize a repeat motif, count the repeat unit number, and chart its location in the genome by reference to unique barcode motifs found at measurable distances from the repeat. Meandering nanochannel dimensions can easily be tailored to human chromosome scales, which would enable the whole genome to be visualized in seconds.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)
ENGINEERING AND TECHNOLOGY  -- Medical Engineering -- Medical Image Processing (hsv//eng)
TEKNIK OCH TEKNOLOGIER  -- Medicinteknik -- Medicinsk bildbehandling (hsv//swe)
TEKNIK OCH TEKNOLOGIER  -- Medicinteknik (hsv//swe)
ENGINEERING AND TECHNOLOGY  -- Medical Engineering (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy