SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/267992"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:gup.ub.gu.se/267992" > A genome-wide assoc...

A genome-wide association study of IgM antibody against phosphorylcholine: shared genetics and phenotypic relationship to chronic lymphocytic leukemia

Chen, X. (författare)
Gustafsson, S. (författare)
Whitington, T. (författare)
visa fler...
Borne, Y. (författare)
Lorentzen, Erik, 1974 (författare)
University of Gothenburg,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Core Facilities, Bioinformatics,Core Facilities, Bioinformatics,Gothenburg Univ, Dept Bioinformat, Gothenburg, Sweden
Sun, J. (författare)
Almgren, P. (författare)
Su, J. (författare)
Karlsson, R. (författare)
Song, J. (författare)
Lu, Y. (författare)
Zhan, Y. (författare)
Hagg, S. (författare)
Svensson, P. (författare)
Smedby, K. E. (författare)
Slager, S. L. (författare)
Ingelsson, E. (författare)
Lindgren, C. M. (författare)
Morris, A. P. (författare)
Melander, O. (författare)
Karlsson, Thomas, 1956 (författare)
Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för samhällsmedicin och folkhälsa, enheten för hälsometri,Institute of Medicine, Department of Public Health and Community Medicine, Health Metrics,Gothenburg Univ, Sahlgrenska Acad, Inst Med, Hlth Metr, Gothenburg, Sweden,Sahlgrenska Academy
de Faire, U. (författare)
Caidahl, Kenneth, 1949 (författare)
Karolinska Institutet,Gothenburg University,Göteborgs universitet,Institutionen för medicin, avdelningen för molekylär och klinisk medicin,Institute of Medicine, Department of Molecular and Clinical Medicine,Gothenburg Univ, Sahlgrenska Acad, Inst Med, Dept Mol & Clin Med, Gothenburg, Sweden;Karolinska Inst, Dept Mol Med & Surg, Stockholm, Sweden,Sahlgrenska Academy
Engstrom, G. (författare)
Lind, L. (författare)
Karlsson, M. C. I. (författare)
Pedersen, N. L. (författare)
Frostegard, J. (författare)
Magnusson, P. K. E. (författare)
Sun, Jitong (författare)
Karolinska Institutet
Chen, Xu (författare)
Karolinska Institutet
Smedby, Karin E. (författare)
Karolinska Institutet
de Faire, Ulf (författare)
Karolinska Institutet
Frostegard, Johan (författare)
Karolinska Inst, Inst Environm Med, Stockholm, Sweden;Karolinska Univ Hosp, Dept Emergency Med, Stockholm, Sweden
Morris, Andrew P. (författare)
Univ Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England;Univ Liverpool, Dept Biostat, Liverpool, Merseyside, England,University of Liverpool,Wellcome Trust Centre for Human Genetics
Engstrom, Gunnar (författare)
Lund Univ, Dept Clin Sci, Malmo, Sweden
Gustafsson, Stefan (författare)
Uppsala University,Uppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab
Pedersen, Nancy L. (författare)
Karolinska Institutet
Borne, Yan (författare)
Lund Univ, Dept Clin Sci, Malmo, Sweden
Lind, Lars (författare)
Uppsala University,Uppsala universitet,Kardiovaskulär epidemiologi
Karlsson, Mikael C. I. (författare)
Karolinska Inst, Dept Microbiol Tumor & Cell Biol, Stockholm, Sweden
Su, Jun (författare)
Karolinska Institutet
Hagg, Sara (författare)
Karolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostat, Nobels Vag 12A,POB 281, SE-17177 Stockholm, Sweden
Zhan, Yiqiang (författare)
Karolinska Institutet
Slager, Susan L. (författare)
Mayo Clin, Dept Hlth Sci Res, Rochester, MN USA,Mayo Clinic Minnesota
Magnusson, Patrik K. E. (författare)
Karolinska Inst, Dept Med Epidemiol & Biostat, Nobels Vag 12A,POB 281, SE-17177 Stockholm, Sweden
Almgren, Peter (författare)
Lund University,Lunds universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Ingelsson, Erik, 1975- (författare)
Uppsala University,Uppsala universitet,Molekylär epidemiologi,Science for Life Laboratory, SciLifeLab,Stanford Univ, Dept Med, Sch Med, Div Cardiovasc Med,Cardiovasc Inst, Stanford, CA 94305 USA,Stanford University
Lu, Yi (författare)
Karolinska Institutet,QIMR Berghofer Medical Research Institute
Melander, Olle (författare)
Lund University,Lunds universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Song, Jie (författare)
Karolinska Institutet
Karlsson, Robert (författare)
Karolinska Institutet
Svensson, Per (författare)
Karolinska Institutet,Södersjukhuset
Whitington, Thomas (författare)
Karolinska Institutet
Lindgren, Cecilia M. (författare)
Univ Oxford, Wellcome Trust Ctr Human Genet, Oxford, England;Broad Inst MIT & Harvard Univ, Cambridge, MA USA,Broad Institute,Wellcome Trust Centre for Human Genetics
Engstrom, G (författare)
Song, J (författare)
Lind, L (författare)
Zhan, YQ (författare)
Karolinska Institutet
Hagg, S (författare)
Karolinska Institutet
Su, J (författare)
Pedersen, NL (författare)
Karolinska Institutet
Gustafsson, S (författare)
de Faire, U (författare)
Karolinska Institutet
Karlsson, MCI (författare)
Karolinska Institutet
Slager, SL (författare)
Whitington, T (författare)
Borne, Y (författare)
Karlsson, R (författare)
Karolinska Institutet
Magnusson, PKE (författare)
Karolinska Institutet
Karlsson, T (författare)
Lu, Y (författare)
Karolinska Institutet
Chen, X (författare)
Karolinska Institutet
Melander, O (författare)
Svensson, P (författare)
Karolinska Institutet
Morris, AP (författare)
Almgren, P (författare)
Lorentzen, E (författare)
Caidahl, K (författare)
Karolinska Institutet
Lindgren, CM (författare)
Frostegard, J (författare)
Karolinska Institutet
Ingelsson, E (författare)
Sun, JT (författare)
Smedby, KE (författare)
Karolinska Institutet
Engström, Gunnar (författare)
Lund University,Lunds universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Karlsson, Mikael C.I. (författare)
Karolinska Institutet
Magnusson, Patrik K.E. (författare)
Karolinska Institutet
Borné, Yan (författare)
Lund University,Lunds universitet,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Frostegård, Johan (författare)
Karolinska Institutet,Karolinska University Hospital
Hägg, Sara (författare)
Karolinska Institutet
visa färre...
 (creator_code:org_t)
 
visa fler...
 
 
 
 
 
visa färre...
Oxford University Press, 2018
2018
Engelska.
Ingår i: Human Molecular Genetics. - : Oxford University Press. - 0964-6906 .- 1460-2083. ; 27:10, s. 1809-1818
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Phosphorylcholine (PC) is an epitope on oxidized low-density lipoprotein (oxLDL), apoptotic cells and several pathogens like Streptococcus pneumoniae. Immunoglobulin M against PC (IgM anti-PC) has the ability to inhibit uptake of oxLDL by macrophages and increase clearance of apoptotic cells. From our genome-wide association studies (GWASs) in four European-ancestry cohorts, six single nucleotide polymorphisms (SNPs) in 11q24.1 were discovered (in 3002 individuals) and replicated (in 646 individuals) to be associated with serum level of IgM anti-PC (the leading SNP rs35923643-G, combined beta = 0.19, 95% confidence interval 0.13-0.24, P = 4.3 x 10-11). The haplotype tagged by rs35923643-G (or its proxy SNP rs735665-A) is also known as the top risk allele for chronic lymphocytic leukemia (CLL), and a main increasing allele for general IgM. By using summary GWAS results of IgM anti-PC and CLL in the polygenic risk score (PRS) analysis, PRS on the basis of IgM anti-PC risk alleles positively associated with CLL risk (explained 0.6% of CLL variance, P = 1.2 x 10-15). Functional prediction suggested that rs35923643-G might impede the binding of Runt-related transcription factor 3, a tumor suppressor playing a central role in the immune regulation of cancers. Contrary to the expectations from the shared genetics between IgM anti-PC and CLL, an inverse relationship at the phenotypic level was found in a nested case-control study (30 CLL cases with 90 age- and sex-matched controls), potentially reflecting reverse causation. The suggested function of the top variant as well as the phenotypic association between IgM anti-PC and CLL risk needs replication and motivates further studies.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy