SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:0556d83f-bf45-49c1-83e5-8fad1dc68f4f"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:0556d83f-bf45-49c1-83e5-8fad1dc68f4f" > Fine mapping and co...

  • Delgado-Vega, Angelica M. (författare)

Fine mapping and conditional analysis identify a new mutation in the autoimmunity susceptibility gene BLK that leads to reduced half-life of the BLK protein

  • Artikel/kapitelEngelska2012

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • BMJ Publishing Group,2012

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:0556d83f-bf45-49c1-83e5-8fad1dc68f4f
  • https://lup.lub.lu.se/record/2891038URI
  • https://doi.org/10.1136/annrheumdis-2011-200987DOI
  • urn:nbn:se:uu:diva-178536urn
  • http://kipublications.ki.se/Default.aspx?queryparsed=id:124749367URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • gratis
  • Objectives To perform fine mapping of the autoimmunity susceptibility gene BLK and identify functional variants involved in systemic lupus erythematosus (SLE). Methods Genotyping of 1163 European SLE patients and 1482 controls and imputation were performed covering the BLK gene with 158 single-nucleotide polymorphisms. Logistic regression analysis was done using PLINK and conditional analyses using GENABEL's test score. Transfections of BLK constructs on HEK293 cells containing the novel mutation or the wild type form were analysed for their effect on protein half-life using a protein stability assay, cycloheximide and western blot. CHiP-qPCR for detection of nuclear factor. B (NFkB) binding. Results Fine mapping of BLK identified two independent genetic effects with functional consequences: one represented by two tightly linked associated haplotype blocks significantly enriched for NF kappa B-binding sites and numerous putative regulatory variants whose risk alleles correlated with low BLK mRNA levels. Binding of NFkBp50 and p65 to an associated 1.2 Kb haplotype segment was confirmed. A second independent genetic effect was represented by an Ala71Thr, low-frequency missense substitution with an OR = 2.31 (95% CI 1.38 to 3.86). The 71Thr decreased BLK protein half-life. Conclusions These results show that rare and common regulatory variants in BLK are involved in disease susceptibility and both, albeit independently, lead to reduced levels of BLK protein.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Dozmorov, Mikhail G. (författare)
  • Bernal Quiros, Manuel (författare)
  • Wu, Ying-Yu (författare)
  • Martinez-Garcia, Belen (författare)
  • Kozyrev, Sergey V.Uppsala universitet,Institutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (författare)
  • Frostegard, Johan (författare)
  • Truedsson, LennartLund University,Lunds universitet,Avdelningen för mikrobiologi, immunologi och glykobiologi - MIG,Institutionen för laboratoriemedicin,Medicinska fakulteten,Division of Microbiology, Immunology and Glycobiology - MIG,Department of Laboratory Medicine,Faculty of Medicine(Swepub:lu)mmb-ltr (författare)
  • de Ramon, Enrique (författare)
  • Gonzalez-Escribano, Maria F. (författare)
  • Ortego-Centeno, Norberto (författare)
  • Pons-Estel, Bernardo A. (författare)
  • D'Alfonso, Sandra (författare)
  • Sebastiani, Gian Domenico (författare)
  • Witte, Torsten (författare)
  • Lauwerys, Bernard R. (författare)
  • Endreffy, Emoke (författare)
  • Kovacs, Laszlo (författare)
  • Vasconcelos, Carlos (författare)
  • da Silva, Berta Martins (författare)
  • Wren, Jonathan D. (författare)
  • Martin, Javier (författare)
  • Castillejo-Lopez, Casimiro (författare)
  • Alarcon-Riquelme, Marta E. (författare)
  • Delgado-Vega, Angélica M.Uppsala universitet,Genomik(Swepub:uu)angde679 (författare)
  • Frostegård, Johan (författare)
  • Wu, YY (författare)
  • Kozyrev, SV (författare)
  • Endreffy, E (författare)
  • D'Alfonso, S (författare)
  • Martin, J (författare)
  • Delgado-Vega, AM (författare)
  • Lauwerys, BR (författare)
  • Dozmorov, MG (författare)
  • Sebastiani, GD (författare)
  • Gonzalez-Escribano, MF (författare)
  • de Ramon, E (författare)
  • da Silva, BM (författare)
  • Ortego-Centeno, N (författare)
  • Pons-Estel, BA (författare)
  • Martinez-Garcia, B (författare)
  • Vasconcelos, C (författare)
  • Castillejo-Lopez, C (författare)
  • Alarcon-Riquelme, ME (författare)
  • Kovacs, L (författare)
  • Wren, JD (författare)
  • Quiros, MB (författare)
  • Witte, T (författare)
  • Frostegard, JKarolinska Institutet (författare)
  • Truedsson, L (författare)
  • Uppsala universitetInstitutionen för medicinsk biokemi och mikrobiologi (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:Annals of the Rheumatic Diseases: BMJ Publishing Group71:7, s. 1219-12261468-20600003-4967

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy