SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:1e3ef670-2f3e-4934-8ff8-dcb76fb717aa"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:1e3ef670-2f3e-4934-8ff8-dcb76fb717aa" > Metabolic Character...

Metabolic Characteristics of Invasive Plant Ipomoea cairica in South China by de novo Transcriptomics

Geng, Yan (författare)
South China Normal University
Chen, Ling-ling (författare)
South China Normal University
Lu, Huan (författare)
South China Normal University
visa fler...
Ning, Chan-juan (författare)
South China Normal University
Björn, Lars Olof (författare)
Lund University,Lunds universitet,Molekylär cellbiologi,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Molecular Cell Biology,Department of Biology,Faculty of Science
Li, Shao-shan (författare)
South China Normal University
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2016
2016
Engelska 15 s.
Ingår i: Journal of Tropical and Subtropical Botany. - 1005-3395. ; 24:2, s. 128-142
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • To explore the molecular mechanisms of Ipomoea cairica invasiveness insouth China, the de novo transcriptomes from I. cairica and two related species, I. digitata and I. nil,were sequenced and assembled.There were5 6551 all-unigenes obtained by assembling the reads, among them 56522 all-unigenes were annotated, including 7815, 15615, and 180201 all-unigenes in GO, COG and KEGG databases, respectively. Moreover, the activities of NR and GS in I.cairica, keyenzyme in metabolic pathway for nitrogen, were greater than those in related species. In addition, the transcriptome data showed that the genes of key enzymes in secondary metabolism, such aspal, 4cl, cad, chs, and chi, had synergic differential expressionin I. cairica, I. digitata and I. nil. The production synthesis from metabolic pathway could play a key role in stress-resistant, growth and allelopathy of I. cairica. The RT-qPCR verification results of key genes were similar to those from transcriptome.Therefore, the result of the present research might explain partly the successful invasiveness of I. cairicain South China at the level of molecular biology.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Botanik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Botany (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)

Nyckelord

Transcriptome
RNA-seq
Ipomoea cairica
Biological invasion
Metabolism

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Geng, Yan
Chen, Ling-ling
Lu, Huan
Ning, Chan-juan
Björn, Lars Olof
Li, Shao-shan
Om ämnet
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
och Biokemi och mole ...
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
och Botanik
NATURVETENSKAP
NATURVETENSKAP
och Biologi
Artiklar i publikationen
Journal of Tropi ...
Av lärosätet
Lunds universitet

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy