SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:1e68e776-2781-4967-815a-5ebe07d9c643"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:1e68e776-2781-4967-815a-5ebe07d9c643" > Fine-Scale Mapping ...

Fine-Scale Mapping of the FGFR2 Breast Cancer Risk Locus: Putative Functional Variants Differentially Bind FOXA1 and E2F1

Meyer, Kerstin B. (författare)
O'Reilly, Martin (författare)
Michailidou, Kyriaki (författare)
visa fler...
Carlebur, Saskia (författare)
Edwards, Stacey L. (författare)
French, Juliet D. (författare)
Prathalingham, Radhika (författare)
Dennis, Joe (författare)
Bolla, Manjeet K. (författare)
Wang, Qin (författare)
de Santiago, Ines (författare)
Hopper, John L. (författare)
Tsimiklis, Helen (författare)
Apicella, Carmel (författare)
Southey, Melissa C. (författare)
Schmidt, Marjanka K. (författare)
Broeks, Annegien (författare)
Van't Veer, Laura J. (författare)
Hogervorst, Frans B. (författare)
Muir, Kenneth (författare)
Lophatananon, Artitaya (författare)
Stewart-Brown, Sarah (författare)
Siriwanarangsan, Pornthep (författare)
Fasching, Peter A. (författare)
Lux, Michael P. (författare)
Ekici, Arif B. (författare)
Beckmann, Matthias W. (författare)
Peto, Julian (författare)
Silva, Isabel dos Santos (författare)
Fletcher, Olivia (författare)
Johnson, Nichola (författare)
Sawyer, Elinor J. (författare)
Tomlinson, Ian (författare)
Kerin, Michael J. (författare)
Miller, Nicola (författare)
Marme, Federick (författare)
Schneeweiss, Andreas (författare)
Sohn, Christof (författare)
Burwinkel, Barbara (författare)
Guenel, Pascal (författare)
Truong, Therese (författare)
Laurent-Puig, Pierre (författare)
Menegaux, Florence (författare)
Bojesen, Stig E. (författare)
Nordestgaard, Borge G. (författare)
Nielsen, Sune F. (författare)
Flyger, Henrik (författare)
Milne, Roger L. (författare)
Pilar Zamora, M. (författare)
Arias, Jose I. (författare)
Benitez, Javier (författare)
Neuhausen, Susan (författare)
Anton-Culver, Hoda (författare)
Ziogas, Argyrios (författare)
Dur, Christina C. (författare)
Brenner, Hermann (författare)
Mueller, Heiko (författare)
Arndt, Volker (författare)
Stegmaier, Christa (författare)
Meindl, Alfons (författare)
Schmutzler, Rita K. (författare)
Engel, Christoph (författare)
Ditsch, Nina (författare)
Brauch, Hiltrud (författare)
Bruening, Thomas (författare)
Ko, Yon-Dschun (författare)
Nevanlinna, Heli (författare)
Muranen, Taru A. (författare)
Aittomaeki, Kristiina (författare)
Blomqvist, Carl (författare)
Matsuo, Keitaro (författare)
Ito, Hidemi (författare)
Iwata, Hiroji (författare)
Yatabe, Yasushi (författare)
Doerk, Thilo (författare)
Helbig, Sonja (författare)
Bogdanova, Natalia V. (författare)
Lindblom, Annika (författare)
Margolin, Sara (författare)
Mannermaa, Arto (författare)
Kataja, Vesa (författare)
Kosma, Veli-Matti (författare)
Hartikainen, Jaana M. (författare)
Chenevix-Trench, Georgia (författare)
Wu, Anna H. (författare)
Tseng, Chiu-chen (författare)
Van Den Berg, David (författare)
Stram, Daniel O. (författare)
Lambrechts, Diether (författare)
Thienpont, Bernard (författare)
Christiaens, Marie-Rose (författare)
Smeets, Ann (författare)
Chang-Claude, Jenny (författare)
Rudolph, Anja (författare)
Seibold, Petra (författare)
Flesch-Janys, Dieter (författare)
Radice, Paolo (författare)
Peterlongo, Paolo (författare)
Bonanni, Bernardo (författare)
Bernard, Loris (författare)
Couch, Fergus J. (författare)
Olson, Janet E. (författare)
Wang, Xianshu (författare)
Purrington, Kristen (författare)
Giles, Graham G. (författare)
Severi, Gianluca (författare)
Baglietto, Laura (författare)
McLean, Catriona (författare)
Haiman, Christopher A. (författare)
Henderson, Brian E. (författare)
Schumacher, Fredrick (författare)
Le Marchand, Loic (författare)
Simard, Jacques (författare)
Goldberg, Mark S. (författare)
Labreche, France (författare)
Dumont, Martine (författare)
Teo, Soo-Hwang (författare)
Yip, Cheng-Har (författare)
Phuah, Sze-Yee (författare)
Kristensen, Vessela (författare)
Alnaes, Grethe Grenaker (författare)
Borresen-Dale, Anne-Lise (författare)
Zheng, Wei (författare)
Deming-Halverson, Sandra (författare)
Shrubsole, Martha (författare)
Long, Jirong (författare)
Winqvist, Robert (författare)
Pylkaes, Katri (författare)
Jukkola-Vuorinen, Arja (författare)
Kauppila, Saila (författare)
Andrulis, Irene L. (författare)
Knight, Julia A. (författare)
Glendon, Gord (författare)
Tchatchou, Sandrine (författare)
Devilee, Peter (författare)
Tollenaar, Robert A. E. M. (författare)
Seynaeve, Caroline M. (författare)
Garcia-Closas, Montserrat (författare)
Figueroa, Jonine (författare)
Chanock, Stephen J. (författare)
Lissowska, Jolanta (författare)
Czene, Kamila (författare)
Darabi, Hartef (författare)
Eriksson, Kimael (författare)
Hooning, Maartje J. (författare)
Martens, John W. M. (författare)
van den Ouweland, Ans M. W. (författare)
van Deurzen, Carolien H. M. (författare)
Hall, Per (författare)
Li, Jingmei (författare)
Liu, Jianjun (författare)
Humphreys, Keith (författare)
Shu, Xiao-Ou (författare)
Lu, Wei (författare)
Gao, Yu-Tang (författare)
Cai, Hui (författare)
Cox, Angela (författare)
Reed, Malcolm W. R. (författare)
Blot, William (författare)
Signorello, Lisa B. (författare)
Cai, Qiuyin (författare)
Pharoah, Paul D. P. (författare)
Ghoussaini, Maya (författare)
Harrington, Patricia (författare)
Tyrer, Jonathan (författare)
Kang, Daehee (författare)
Choi, Ji-Yeob (författare)
Park, Sue K. (författare)
Noh, Dong-Young (författare)
Hartman, Mikael (författare)
Hui, Miao (författare)
Lim, Wei-Yen (författare)
Buhari, Shaik A. (författare)
Hamann, Ute (författare)
Försti, Asta, (författare)
Lunds universitet, Lund University, Medicinska fakulteten, Faculty of Medicine, Institutionen för kliniska vetenskaper, Malmö, Department of Clinical Sciences, Malmö, Allmänmedicin, psykiatrisk epidemiologi och migration, Family Medicine, Psychiatric Epidemiology and Migration
Ruediger, Thomas (författare)
Ulmer, Hans-Ulrich (författare)
Jakubowska, Anna (författare)
Lubinski, Jan (författare)
Jaworska, Katarzyna (författare)
Durda, Katarzyna (författare)
Sangrajrang, Suleeporn (författare)
Gaborieau, Valerie (författare)
Brennan, Paul (författare)
Mckay, James (författare)
Vachon, Celine (författare)
Slager, Susan (författare)
Fostira, Florentia (författare)
Pilarski, Robert (författare)
Shen, Chen-Yang (författare)
Hsiung, Chia-Ni (författare)
Wu, Pei-Ei (författare)
Hou, Ming-Feng (författare)
Swerdlow, Anthony (författare)
Ashworth, Alan (författare)
Orr, Nick (författare)
Schoemaker, Minouk J. (författare)
Ponder, Bruce A. J. (författare)
Dunning, Alison M. (författare)
Easton, Douglas F. (författare)
Zamora, MP (författare)
Muller, H (författare)
Bruning, T (författare)
Aittomaki, K (författare)
Dork, T (författare)
Pylkas, K (författare)
Forsti, A (författare)
Rudiger, T (författare)
visa färre...
Lunds universitet Allmänmedicin, psykiatrisk epidemiologi och migration. (creator_code:org_t)
Lunds universitet EpiHealth: Epidemiology for Health. (creator_code:org_t)
2013
Engelska.
Ingår i: American Journal of Human Genetics. - Cell Press. - 0002-9297. ; 93:6, s. 1046-1060
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • The 10q26 locus in the second intron of FGFR2 is the locus most strongly associated with estrogen-receptor-positive breast cancer in genome-wide association studies. We conducted fine-scale mapping in case-control studies genotyped with a custom chip (iCOGS), comprising 41 studies (n = 89,050) of European ancestry, 9 Asian ancestry studies (n = 13,983), and 2 African ancestry studies (n = 2,028) from the Breast Cancer Association Consortium. We identified three statistically independent risk signals within the locus. Within risk signals 1 and 3, genetic analysis identified five and two variants, respectively, highly correlated with the most strongly associated SNPs. By using a combination of genetic fine mapping, data on DNase hypersensitivity, and electrophoretic mobility shift assays to study protein-DNA binding, we identified rs35054928, rs2981578, and rs45631563 as putative functional SNPs. Chromatin immunoprecipitation showed that FOXA1 preferentially bound to the risk-associated allele (C) of rs2981578 and was able to recruit ER alpha to this site in an allele-specific manner, whereas E2F1 preferentially bound the risk variant of rs35054928. The risk alleles were preferentially found in open chromatin and bound by Ser5 phosphorylated RNA polymerase II, suggesting that the risk alleles are associated with changes in transcription. Chromatin conformation capture demonstrated that the risk region was able to interact with the promoter of FGFR2, the likely target gene of this risk region. A role for FOXA1 in mediating breast cancer susceptibility at this locus is consistent with the finding that the FGFR2 risk locus primarily predisposes to estrogen-receptor-positive disease.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Meyer, Kerstin B ...
O'Reilly, Martin
Michailidou, Kyr ...
Carlebur, Saskia
Edwards, Stacey ...
French, Juliet D ...
visa fler...
Prathalingham, R ...
Dennis, Joe
Bolla, Manjeet K ...
Wang, Qin
de Santiago, Ine ...
Hopper, John L.
Tsimiklis, Helen
Apicella, Carmel
Southey, Melissa ...
Schmidt, Marjank ...
Broeks, Annegien
Van't Veer, Laur ...
Hogervorst, Fran ...
Muir, Kenneth
Lophatananon, Ar ...
Stewart-Brown, S ...
Siriwanarangsan, ...
Fasching, Peter ...
Lux, Michael P.
Ekici, Arif B.
Beckmann, Matthi ...
Peto, Julian
Silva, Isabel do ...
Fletcher, Olivia
Johnson, Nichola
Sawyer, Elinor J ...
Tomlinson, Ian
Kerin, Michael J ...
Miller, Nicola
Marme, Federick
Schneeweiss, And ...
Sohn, Christof
Burwinkel, Barba ...
Guenel, Pascal
Truong, Therese
Laurent-Puig, Pi ...
Menegaux, Floren ...
Bojesen, Stig E.
Nordestgaard, Bo ...
Nielsen, Sune F.
Flyger, Henrik
Milne, Roger L.
Pilar Zamora, M.
Arias, Jose I.
Benitez, Javier
Neuhausen, Susan
Anton-Culver, Ho ...
Ziogas, Argyrios
Dur, Christina C ...
Brenner, Hermann
Mueller, Heiko
Arndt, Volker
Stegmaier, Chris ...
Meindl, Alfons
Schmutzler, Rita ...
Engel, Christoph
Ditsch, Nina
Brauch, Hiltrud
Bruening, Thomas
Ko, Yon-Dschun
Nevanlinna, Heli
Muranen, Taru A.
Aittomaeki, Kris ...
Blomqvist, Carl
Matsuo, Keitaro
Ito, Hidemi
Iwata, Hiroji
Yatabe, Yasushi
Doerk, Thilo
Helbig, Sonja
Bogdanova, Natal ...
Lindblom, Annika
Margolin, Sara
Mannermaa, Arto
Kataja, Vesa
Kosma, Veli-Matt ...
Hartikainen, Jaa ...
Chenevix-Trench, ...
Wu, Anna H.
Tseng, Chiu-chen
Van Den Berg, Da ...
Stram, Daniel O.
Lambrechts, Diet ...
Thienpont, Berna ...
Christiaens, Mar ...
Smeets, Ann
Chang-Claude, Je ...
Rudolph, Anja
Seibold, Petra
Flesch-Janys, Di ...
Radice, Paolo
Peterlongo, Paol ...
Bonanni, Bernard ...
Bernard, Loris
Couch, Fergus J.
Olson, Janet E.
Wang, Xianshu
Purrington, Kris ...
Giles, Graham G.
Severi, Gianluca
Baglietto, Laura
McLean, Catriona
Haiman, Christop ...
Henderson, Brian ...
Schumacher, Fred ...
Le Marchand, Loi ...
Simard, Jacques
Goldberg, Mark S ...
Labreche, France
Dumont, Martine
Teo, Soo-Hwang
Yip, Cheng-Har
Phuah, Sze-Yee
Kristensen, Vess ...
Alnaes, Grethe G ...
Borresen-Dale, A ...
Zheng, Wei
Deming-Halverson ...
Shrubsole, Marth ...
Long, Jirong
Winqvist, Robert
Pylkaes, Katri
Jukkola-Vuorinen ...
Kauppila, Saila
Andrulis, Irene ...
Knight, Julia A.
Glendon, Gord
Tchatchou, Sandr ...
Devilee, Peter
Tollenaar, Rober ...
Seynaeve, Caroli ...
Garcia-Closas, M ...
Figueroa, Jonine
Chanock, Stephen ...
Lissowska, Jolan ...
Czene, Kamila
Darabi, Hartef
Eriksson, Kimael
Hooning, Maartje ...
Martens, John W. ...
van den Ouweland ...
van Deurzen, Car ...
Hall, Per
Li, Jingmei
Liu, Jianjun
Humphreys, Keith
Shu, Xiao-Ou
Lu, Wei
Gao, Yu-Tang
Cai, Hui
Cox, Angela
Reed, Malcolm W. ...
Blot, William
Signorello, Lisa ...
Cai, Qiuyin
Pharoah, Paul D. ...
Ghoussaini, Maya
Harrington, Patr ...
Tyrer, Jonathan
Kang, Daehee
Choi, Ji-Yeob
Park, Sue K.
Noh, Dong-Young
Hartman, Mikael
Hui, Miao
Lim, Wei-Yen
Buhari, Shaik A.
Hamann, Ute
Försti, Asta
Ruediger, Thomas
Ulmer, Hans-Ulri ...
Jakubowska, Anna
Lubinski, Jan
Jaworska, Katarz ...
Durda, Katarzyna
Sangrajrang, Sul ...
Gaborieau, Valer ...
Brennan, Paul
Mckay, James
Vachon, Celine
Slager, Susan
Fostira, Florent ...
Pilarski, Robert
Shen, Chen-Yang
Hsiung, Chia-Ni
Wu, Pei-Ei
Hou, Ming-Feng
Swerdlow, Anthon ...
Ashworth, Alan
Orr, Nick
Schoemaker, Mino ...
Ponder, Bruce A. ...
Dunning, Alison ...
Easton, Douglas ...
Zamora, MP
Muller, H
Bruning, T
Aittomaki, K
Dork, T
Pylkas, K
Forsti, A
Rudiger, T
visa färre...
Om ämnet
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Medicinska grund ...
och Medicinsk geneti ...
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Klinisk medicin
och Cancer och onkol ...
Artiklar i publikationen
American Journal ...
Av lärosätet
Lunds universitet
Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy