SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:47fc4f1e-2c18-4477-8507-2504703b8b7e"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:47fc4f1e-2c18-4477-8507-2504703b8b7e" > A multicentric stud...

A multicentric study to evaluate the use of relative retention times in targeted proteomics

Vialas, Vital, (författare)
Complutense University of Madrid
Colomé-Calls, Núria, (författare)
Vall d'Hebron University Hospital
Abian, Joaquín, (författare)
CSIC Institute of Biomedical Research of Barcelona (IIBB)
visa fler...
Aloria, Kerman, (författare)
University of the Basque Country
Alvarez-Llamas, Gloria, (författare)
Hospital Fundación Jiménez Díaz
Antúnez, Oreto, (författare)
University of Valencia
Arizmendi, Jesus M., (författare)
University of the Basque Country
Azkargorta, Mikel, (författare)
Center For Cooperative Research In Biosciences (CIC bioGUNE)
Barceló-Batllori, Silvia, (författare)
Bellvitge Biomedical Research Institute
Barderas, María G., (författare)
Hospital Nacional de Parapléjicos
Blanco, Francisco J, (författare)
Institute of Biomedical Research of A Coruña, INIBIC
Casal, J. Ignacio, (författare)
Institute of Biomedical Research of A Coruña, INIBIC
Casas, Vanessa, (författare)
Institute of Biomedical Research of A Coruña, INIBIC
de la Torre, Carolina, (författare)
Bellvitge Biomedical Research Institute
Chicano-Gálvez, Eduardo, (författare)
University of Córdoba, Spain, Maimonides Biomedical Research Institute of Cordoba
Elortza, Felix, (författare)
Center For Cooperative Research In Biosciences (CIC bioGUNE)
Espadas, Guadalupe, (författare)
Pompeu Fabra University
Estanyol, Josep M., (författare)
University of Barcelona
Fernandez-Irigoyen, Joaquín, (författare)
Navarrabiomed
Fernandez-Puente, Patricia, (författare)
Institute of Biomedical Research of A Coruña, INIBIC
Fidalgo, María José, (författare)
University of Barcelona
Fuentes, Manuel, (författare)
University of Salamanca
Gay, Marina, (författare)
Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona)
Gil, Concha, (författare)
Complutense University of Madrid
Hainard, Alexandre, (författare)
University of Geneva
Hernaez, Maria Luisa, (författare)
Complutense University of Madrid
Ibarrola, Nieves, (författare)
University of Salamanca
Kopylov, Arthur T., (författare)
VN Orekhovich Scientific Research Institute of Biomedical Chemistry, Russian Academy Of Medical Science
Lario, Antonio, (författare)
CSIC Institute of Parasitology and Biomedicine Lopez-Neyra (IPBLN)
Lopez, Juan Antonio, (författare)
Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares Carlos III
López-Lucendo, María, (författare)
Biological Research Center (CIB), Madrid
Marcilla, Miguel, (författare)
CSIC National Center for Biotechnology (CNB)
Marina-Ramírez, Anabel, (författare)
CSIC Center of Molecular Biology Severo Ochoa (CBMSO)
Marko-Varga, Gyorgy, (författare)
Lunds universitet, Lund University, Lunds Tekniska Högskola, Faculty of Engineering, LTH, Institutioner vid LTH, Departments at LTH, Institutionen för Biomedicinsk teknik, Department of Biomedical Engineering, Avdelningen för Biomedicinsk teknik, Department of Biomedical Engineering
Martín, Luna, (författare)
Vall d'Hebron University Hospital
Mora, Maria I., (författare)
University of Navarra
Morato-López, Esperanza, (författare)
CSIC Center of Molecular Biology Severo Ochoa (CBMSO)
Muñoz, Javier, (författare)
Spanish National Cancer Research Center (CNIO)
Odena, Maria Antonia, (författare)
University of Barcelona
de Oliveira, Eliandre, (författare)
University of Barcelona
Orera, Irene, (författare)
Aragon Health Sciences Institute
Ortea, Ignacio, (författare)
University of Córdoba, Spain
Pasquarello, Carla, (författare)
University of Geneva
Ray, Kevin B., (författare)
MilliporeSigma
Rezeli, Melinda, (författare)
Lunds universitet, Lund University, Lunds Tekniska Högskola, Faculty of Engineering, LTH, Institutioner vid LTH, Departments at LTH, Institutionen för Biomedicinsk teknik, Department of Biomedical Engineering, Avdelningen för Biomedicinsk teknik, Department of Biomedical Engineering
Ruppen, Isabel, (författare)
Spanish National Cancer Research Center (CNIO)
Sabidó, Eduard, (författare)
Pompeu Fabra University
del Pino, Manuel M Sanchez, (författare)
University of Valencia
Sancho, Jaime, (författare)
CSIC Institute of Parasitology and Biomedicine Lopez-Neyra (IPBLN)
Santamaría, Enrique, (författare)
Navarrabiomed
Vazquez, Jesus, (författare)
Centro Nacional de Investigaciones Cardiovasculares Carlos III
Vilaseca, Marta, (författare)
Institute for Research in Biomedicine (IRB Barcelona)
Vivanco, Fernando, (författare)
Hospital Fundación Jiménez Díaz
Walters, James J., (författare)
MilliporeSigma
Zgoda, Victor G., (författare)
VN Orekhovich Scientific Research Institute of Biomedical Chemistry, Russian Academy Of Medical Science
Corrales, Fernando J., (författare)
University of Navarra
Canals, Francesc, (författare)
Vall d'Hebron University Hospital
Paradela, Alberto, (författare)
CSIC National Center for Biotechnology (CNB)
visa färre...
2017
Engelska 12 s.
Ingår i: Journal of Proteomics. - Elsevier. - 1874-3919. ; 152, s. 138-149
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Despite the maturity reached by targeted proteomic strategies, reliable and standardized protocols are urgently needed to enhance reproducibility among different laboratories and analytical platforms, facilitating a more widespread use in biomedical research. To achieve this goal, the use of dimensionless relative retention times (iRT), defined on the basis of peptide standard retention times (RT), has lately emerged as a powerful tool. The robustness, reproducibility and utility of this strategy were examined for the first time in a multicentric setting, involving 28 laboratories that included 24 of the Spanish network of proteomics laboratories (ProteoRed-ISCIII). According to the results obtained in this study, dimensionless retention time values (iRTs) demonstrated to be a useful tool for transferring and sharing peptide retention times across different chromatographic set-ups both intra- and inter-laboratories. iRT values also showed very low variability over long time periods. Furthermore, parallel quantitative analyses showed a high reproducibility despite the variety of experimental strategies used, either MRM (multiple reaction monitoring) or pseudoMRM, and the diversity of analytical platforms employed. Biological significance From the very beginning of proteomics as an analytical science there has been a growing interest in developing standardized methods and experimental procedures in order to ensure the highest quality and reproducibility of the results. In this regard, the recent (2012) introduction of the dimensionless retention time concept has been a significant advance. In our multicentric (28 laboratories) study we explore the usefulness of this concept in the context of a targeted proteomics experiment, demonstrating that dimensionless retention time values is a useful tool for transferring and sharing peptide retention times across different chromatographic set-ups.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)

Nyckelord

Inter-laboratory validation
Liquid chromatography
Multiple reaction monitoring
Proteomics
Reproducibility
Standardization
Targeted proteomics

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy