SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:5e2e5e2e-fe18-48e5-a4f0-c42df9f905b6"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:5e2e5e2e-fe18-48e5-a4f0-c42df9f905b6" > Diffusion MRI micro...

  • Ferizi, UranUniversity College London (författare)

Diffusion MRI microstructure models with in vivo human brain Connectome data : Results from a multi-group comparison

  • Artikel/kapitelEngelska2017

Förlag, utgivningsår, omfång ...

  • John Wiley and Sons,2017

Nummerbeteckningar

  • LIBRIS-ID:oai:lup.lub.lu.se:5e2e5e2e-fe18-48e5-a4f0-c42df9f905b6
  • https://lup.lub.lu.se/record/5e2e5e2e-fe18-48e5-a4f0-c42df9f905b6URI
  • https://doi.org/10.1002/nbm.3734DOI
  • https://research.chalmers.se/publication/251861URI

Kompletterande språkuppgifter

  • Språk:engelska
  • Sammanfattning på:engelska

Ingår i deldatabas

Klassifikation

  • Ämneskategori:ref swepub-contenttype
  • Ämneskategori:art swepub-publicationtype

Anmärkningar

  • A large number of mathematical models have been proposed to describe the measured signal in diffusion-weighted (DW) magnetic resonance imaging (MRI). However, model comparison to date focuses only on specific subclasses, e.g. compartment models or signal models, and little or no information is available in the literature on how performance varies among the different types of models. To address this deficiency, we organized the 'White Matter Modeling Challenge' during the International Symposium on Biomedical Imaging (ISBI) 2015 conference. This competition aimed to compare a range of different kinds of models in their ability to explain a large range of measurable in vivo DW human brain data. Specifically, we assessed the ability of models to predict the DW signal accurately for new diffusion gradients and b values. We did not evaluate the accuracy of estimated model parameters, as a ground truth is hard to obtain. We used the Connectome scanner at the Massachusetts General Hospital, using gradient strengths of up to 300mT/m and a broad set of diffusion times. We focused on assessing the DW signal prediction in two regions: the genu in the corpus callosum, where the fibres are relatively straight and parallel, and the fornix, where the configuration of fibres is more complex. The challenge participants had access to three-quarters of the dataset and their models were ranked on their ability to predict the remaining unseen quarter of the data. The challenge provided a unique opportunity for a quantitative comparison of diverse methods from multiple groups worldwide. The comparison of the challenge entries reveals interesting trends that could potentially influence the next generation of diffusion-based quantitative MRI techniques. The first is that signal models do not necessarily outperform tissue models; in fact, of those tested, tissue models rank highest on average. The second is that assuming a non-Gaussian (rather than purely Gaussian) noise model provides little improvement in prediction of unseen data, although it is possible that this may still have a beneficial effect on estimated parameter values. The third is that preprocessing the training data, here by omitting signal outliers, and using signal-predicting strategies, such as bootstrapping or cross-validation, could benefit the model fitting. The analysis in this study provides a benchmark for other models and the data remain available to build up a more complete comparison in the future.

Ämnesord och genrebeteckningar

Biuppslag (personer, institutioner, konferenser, titlar ...)

  • Scherrer, BenoitHarvard University (författare)
  • Schneider, TorbenUniversity College London (författare)
  • Alipoor, MohammadChalmers tekniska högskola,Chalmers University of Technology (författare)
  • Eufracio, OdinMathematics Research Center (författare)
  • Fick, Rutger H.J.National Institute for Research in Computer Science and Control (INIRA) (författare)
  • Deriche, RachidNational Institute for Research in Computer Science and Control (INIRA) (författare)
  • Nilsson, MarkusLund University,Lunds universitet,Diagnostisk radiologi, Lund,Sektion V,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Lund University Bioimaging Center,MR Physics,Forskargrupper vid Lunds universitet,Diagnostic Radiology, (Lund),Section V,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Lund University Research Groups(Swepub:lu)med-mun (författare)
  • Loya-Olivas, Ana K.Mathematics Research Center (författare)
  • Rivera, MarianoMathematics Research Center (författare)
  • Poot, Dirk H.J.Delft University of Technology (författare)
  • Ramirez-Manzanares, Alonso (författare)
  • Marroquin, Jose L. (författare)
  • Rokem, Ariel (författare)
  • Pötter, Christian (författare)
  • Dougherty, Robert F. (författare)
  • Sakaie, Ken (författare)
  • Wheeler-Kingshott, Claudia (författare)
  • Warfield, Simon K. (författare)
  • Witzel, Thomas (författare)
  • Wald, Lawrence L. (författare)
  • Raya, José G. (författare)
  • Alexander, Daniel CUniversity College London (författare)
  • Wald, L. L.Harvard University, USA (författare)
  • Rivera, M. (författare)
  • Raya, J. G. (författare)
  • Deriche, R. (författare)
  • Poot, D. H. J.Delft University of Technology (TU Delft), Netherlands (författare)
  • Marroquin, J. L. (författare)
  • Ferizi, U.University College London (UCL), United Kingdom,University College London (UCL), United Kingdom (författare)
  • Loya-Olivas, A. K. (författare)
  • Scherrer, B.Harvard University, USA (författare)
  • Fick, R. H. J. (författare)
  • Rokem, A.Stanford University, USA,University of Washington, USA (författare)
  • Schneider, T.University College London (UCL), United Kingdom (författare)
  • Ramirez-Manzanares, A. (författare)
  • Potter, C.Stanford University, USA (författare)
  • Dougherty, R. F.Stanford University, USA (författare)
  • Warfield, S. K.Harvard University, USA (författare)
  • Alexander, D. C.University College London (UCL), United Kingdom (författare)
  • Eufracio, O. (författare)
  • Witzel, T.Harvard University, USA (författare)
  • Sakaie, K. (författare)
  • Nilsson, M.Lund University,Lunds universitet (författare)
  • Wheeler-Kingshott, C.University College London (UCL), United Kingdom (författare)
  • University College LondonHarvard University (creator_code:org_t)

Sammanhörande titlar

  • Ingår i:NMR in Biomedicine: John Wiley and Sons30:90952-34801099-1492

Internetlänk

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy