Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning


Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:937e4590-5e12-4fe2-8209-04f3ab1bbb27" > The extent of linka...

The extent of linkage disequilibrium in Arabidopsis thaliana

Nordborg, M (författare)
Borevitz, JO (författare)
Bergelson, J (författare)
visa fler...
Berry, CC (författare)
Chory, J (författare)
Hagenblad, Jenny (författare)
Lund University,Lunds universitet,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Department of Biology,Faculty of Science,Lund University, Sweden
Kreitman, M (författare)
Maloof, JN (författare)
Noyes, T (författare)
Oefner, PJ (författare)
Stahl, EA (författare)
Weigel, D (författare)
Berry, Charles C. (författare)
University of California, San Diego, La Jolla, USA
Nordborg, Magnus (författare)
University of Southern California, Los Angeles, USA
Maloo, Julin N (författare)
Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, California, USA
Weigel, Detlef (författare)
Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, California, USA
Stahl, Eli A. (författare)
University of Chicago, Illinois, USA
Kreitman, Martin (författare)
University of Chicago, Illinois, USA
Borevitz, Justin O. (författare)
Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, California, USA
Bergelson, Joy (författare)
University of Chicago, Illinois, USA
Oefner, Peter J. (författare)
Stanford University School of Medicine, California, USA
Chory, Joanne (författare)
Salk Institute for Biological Studies, La Jolla, California, USA
Noyes, Tina (författare)
Stanford University School of Medicine, California, USA
visa färre...
Nature Publishing Group, 2002
Ingår i: Nature Genetics. - : Nature Publishing Group. - 1546-1718 .- 1061-4036. ; 30:2, s. 190-193
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
  • Linkage disequilibrium (LD), the nonrandom occurrence of alleles in haplotypes, has long been of interest to population geneticists. Recently, the rapidly increasing availability of genomic polymorphism data has fueled interest in LD as a tool for fine-scale mapping, in particular for human disease loci(1). The chromosomal extent of LD is crucial in this context, because it determines how dense a map must be for associations to be detected and, conversely, limits how finely loci may be mapped(2). Arabidopsis thaliana is expected to harbor unusually extensive LD because of its high degree of selfing(3). Several polymorphism studies have found very strong LD within individual loci, but also evidence of some recombination(4-6). Here we investigate the pattern of LD on a genomic scale and show that in global samples, LD decays within approximately 1 cM, or 250 kb. We also show that LD in local populations may be much stronger than that of global populations, presumably as a result of founder events. The combination of a relatively high level of polymorphism and extensive haplotype structure bodes well for developing a genome-wide LD map in A. thaliana.


NATURVETENSKAP  -- Biologi -- Genetik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Genetics (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy