SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:941ca49e-9b75-4f4b-b2af-64aa170d33be"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:941ca49e-9b75-4f4b-b2af-64aa170d33be" > Breast cancer genom...

Breast cancer genome and transcriptome integration implicates specific mutational signatures with immune cell infiltration

Smid, Marcel (författare)
Erasmus University Rotterdam
Rodríguez-González, F Germán (författare)
Erasmus University Rotterdam
Sieuwerts, Anieta M (författare)
Erasmus University Rotterdam
visa fler...
Salgado, Roberto (författare)
Free University of Brussels (ULB)
Prager-Van der Smissen, Wendy J C (författare)
Erasmus University Rotterdam
Vlugt-Daane, Michelle van der (författare)
Erasmus University Rotterdam
van Galen, Anne (författare)
Erasmus University Rotterdam
Nik-Zainal, Serena (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Staaf, Johan (författare)
Lund University,Lunds universitet,Bröstca-genetik,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Breastca-genetics,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Brinkman, Arie B (författare)
Radboud University Nijmegen
van de Vijver, Marc J (författare)
Academic Medical Center of University of Amsterdam (AMC)
Richardson, Andrea L (författare)
Brigham and Women's Hospital / Harvard Medical School
Fatima, Aquila (författare)
Erasmus University Rotterdam
Berentsen, Kim (författare)
Radboud University Nijmegen
Butler, Adam (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Martin, Sancha (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Davies, Helen R (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Debets, Reno (författare)
Erasmus University Rotterdam
Gelder, Marion E Meijer-Van (författare)
Erasmus University Rotterdam
van Deurzen, Carolien H M (författare)
Erasmus University Rotterdam
MacGrogan, Gaëtan (författare)
Institut Bergoníe
Van den Eynden, Gert G G M (författare)
University of Antwerp
Purdie, Colin (författare)
Ninewells Hospital and Medical School
Thompson, Alastair M (författare)
Ninewells Hospital and Medical School
Caldas, Carlos (författare)
University of Cambridge
Span, Paul N (författare)
Radboud University Nijmegen
Simpson, Peter T (författare)
University of Queensland
Lakhani, Sunil R (författare)
University of Queensland
Van Laere, Steven (författare)
University of Antwerp
Desmedt, Christine (författare)
Free University of Brussels (ULB)
Ringnér, Markus (författare)
Lund University,Lunds universitet,MEMEG,Biologiska institutionen,Naturvetenskapliga fakulteten,Department of Biology,Faculty of Science
Tommasi, Stefania (författare)
Istituto Tumori 'Giovanni Paolo II'
Eyford, Jorunn (författare)
University of Iceland
Broeks, Annegien (författare)
Netherlands Cancer Institute
Vincent-Salomon, Anne (författare)
Curie Institute, Paris
Futreal, P Andrew (författare)
University of Texas
Knappskog, Stian (författare)
University of Bergen
King, Tari (författare)
Memorial Sloan-Kettering Cancer Center
Thomas, Gilles (författare)
Centre Léon Bérard
Viari, Alain (författare)
Centre Léon Bérard
Langerød, Anita (författare)
Oslo university hospital
Børresen-Dale, Anne-Lise (författare)
Oslo university hospital
Birney, Ewan (författare)
European Bioinformatics Institute
Stunnenberg, Hendrik G (författare)
Radboud University Nijmegen
Stratton, Mike (författare)
Wellcome Trust Sanger Institute
Foekens, John A (författare)
Erasmus University Rotterdam
Martens, John W M (författare)
Erasmus University Rotterdam
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Nature Publishing Group, 2016-09-27
Engelska.
Ingår i: Nature Communications. - : Nature Publishing Group. - 2041-1723. ; 7
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • A recent comprehensive whole genome analysis of a large breast cancer cohort was used to link known and novel drivers and substitution signatures to the transcriptome of 266 cases. Here, we validate that subtype-specific aberrations show concordant expression changes for, for example, TP53, PIK3CA, PTEN, CCND1 and CDH1. We find that CCND3 expression levels do not correlate with amplification, while increased GATA3 expression in mutant GATA3 cancers suggests GATA3 is an oncogene. In luminal cases the total number of substitutions, irrespective of type, associates with cell cycle gene expression and adverse outcome, whereas the number of mutations of signatures 3 and 13 associates with immune-response specific gene expression, increased numbers of tumour-infiltrating lymphocytes and better outcome. Thus, while earlier reports imply that the sheer number of somatic aberrations could trigger an immune-response, our data suggests that substitutions of a particular type are more effective in doing so than others.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper -- Cell- och molekylärbiologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Cell and Molecular Biology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper (hsv//swe)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine (hsv//eng)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy