SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:ab111aca-769a-4d9f-92c5-9231ec557d24"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:ab111aca-769a-4d9f-92c5-9231ec557d24" > Leveraging cross-sp...

Leveraging cross-species transcription factor binding site patterns: from diabetes risk Loci to disease mechanisms.

Claussnitzer, Melina (författare)
Dankel, Simon N (författare)
Klocke, Bernward (författare)
visa fler...
Grallert, Harald (författare)
Glunk, Viktoria (författare)
Berulava, Tea (författare)
Lee, Heekyoung (författare)
Oskolkov, Nikolay, (författare)
Forskargrupper vid Lunds universitet, Lund University Research Groups, Lunds universitet, Lund University, Genomik, diabetes och endokrinologi, Genomics, Diabetes and Endocrinology
Fadista, Joao, (författare)
Forskargrupper vid Lunds universitet, Lund University Research Groups, Lunds universitet, Lund University, Genomik, diabetes och endokrinologi, Genomics, Diabetes and Endocrinology
Ehlers, Kerstin (författare)
Wahl, Simone (författare)
Hoffmann, Christoph (författare)
Qian, Kun (författare)
Rönn, Tina, (författare)
Forskargrupper vid Lunds universitet, Lund University Research Groups, Lunds universitet, Lund University, Genomik, diabetes och endokrinologi, Genomics, Diabetes and Endocrinology, Diabetes - epigenetik, Diabetes - Epigenetics
Riess, Helene (författare)
Müller-Nurasyid, Martina (författare)
Bretschneider, Nancy (författare)
Schroeder, Timm (författare)
Skurk, Thomas (författare)
Horsthemke, Bernhard (författare)
Spieler, Derek (författare)
Klingenspor, Martin (författare)
Seifert, Martin (författare)
Kern, Michael J (författare)
Mejhert, Niklas (författare)
Dahlman, Ingrid (författare)
Hansson, Ola, (författare)
Forskargrupper vid Lunds universitet, Lund University Research Groups, Lunds universitet, Lund University, Genomik, diabetes och endokrinologi, Genomics, Diabetes and Endocrinology
Hauck, Stefanie M (författare)
Blüher, Matthias (författare)
Arner, Peter (författare)
Groop, Leif, (författare)
Forskargrupper vid Lunds universitet, Lund University Research Groups, Lunds universitet, Lund University, Genomik, diabetes och endokrinologi, Genomics, Diabetes and Endocrinology
Illig, Thomas (författare)
Suhre, Karsten (författare)
Hsu, Yi-Hsiang (författare)
Mellgren, Gunnar (författare)
Hauner, Hans (författare)
Laumen, Helmut (författare)
Claussnitzer, M (författare)
Dankel, SN (författare)
Klocke, B (författare)
Grallert, H (författare)
Glunk, V (författare)
Berulava, T (författare)
Lee, H (författare)
Oskolkov, N (författare)
Fadista, J (författare)
Ehlers, K (författare)
Wahl, S (författare)
Hoffmann, C (författare)
Qian, K (författare)
Ronn, T (författare)
Riess, H (författare)
Muller-Nurasyid, M (författare)
Bretschneider, N (författare)
Schroeder, T (författare)
Skurk, T (författare)
Horsthemke, B (författare)
Spieler, D (författare)
Klingenspor, M (författare)
Seifert, M (författare)
Kern, MJ (författare)
Mejhert, N, (författare)
Karolinska Institutet
Dahlman, I, (författare)
Karolinska Institutet
Hansson, O (författare)
Hauck, SM (författare)
Bluher, M (författare)
Arner, P, (författare)
Karolinska Institutet
Groop, L (författare)
Illig, T (författare)
Suhre, K (författare)
Hsu, YH (författare)
Mellgren, G (författare)
Hauner, H (författare)
Laumen, H (författare)
visa färre...
2014
Engelska.
Ingår i: Cell. - Cell Press. - 1097-4172. ; 156:1-2, s. 343-358
Läs hela texten (fulltext)
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Genome-wide association studies have revealed numerous risk loci associated with diverse diseases. However, identification of disease-causing variants within association loci remains a major challenge. Divergence in gene expression due to cis-regulatory variants in noncoding regions is central to disease susceptibility. We show that integrative computational analysis of phylogenetic conservation with a complexity assessment of co-occurring transcription factor binding sites (TFBS) can identify cis-regulatory variants and elucidate their mechanistic role in disease. Analysis of established type 2 diabetes risk loci revealed a striking clustering of distinct homeobox TFBS. We identified the PRRX1 homeobox factor as a repressor of PPARG2 expression in adipose cells and demonstrate its adverse effect on lipid metabolism and systemic insulin sensitivity, dependent on the rs4684847 risk allele that triggers PRRX1 binding. Thus, cross-species conservation analysis at the level of co-occurring TFBS provides a valuable contribution to the translation of genetic association signals to disease-related molecular mechanisms.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Endokrinologi och diabetes (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Endocrinology and Diabetes (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • Cell (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy