SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:af0be4d1-9fc7-4a87-b5f6-0307ec8103f5"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:af0be4d1-9fc7-4a87-b5f6-0307ec8103f5" > Visualization and a...

Visualization and analysis of gene expression in tissue sections by spatial transcriptomics

Ståhl, Patrik L., (författare)
Karolinska Institutet, KTH Royal Institute of Technology
Salmén, Fredrik, (författare)
KTH Royal Institute of Technology
Vickovic, Sanja, (författare)
KTH Royal Institute of Technology
visa fler...
Lundmark, Anna, (författare)
Karolinska Institutet, KTH Royal Institute of Technology
Navarro, José Fernández, (författare)
Karolinska Institutet, KTH Royal Institute of Technology
Magnusson, Jens, (författare)
Karolinska Institutet
Giacomello, Stefania, (författare)
KTH Royal Institute of Technology
Asp, Michaela, (författare)
Karolinska Institutet
Westholm, Jakub O. (författare)
Huss, Mikael, (författare)
Stockholm University
Mollbrink, Annelie, (författare)
KTH Royal Institute of Technology
Linnarsson, Sten, (författare)
Karolinska Institutet
Codeluppi, Simone, (författare)
Karolinska Institutet
Borg, Åke, (författare)
Lunds universitet, Lund University, Medicinska fakulteten, Faculty of Medicine, Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund, Department of Clinical Sciences, Lund, Sektion V, Section V, Onkologi och Patologi, MV, Oncology and Pathology, MV
Pontén, Fredrik, (författare)
Uppsala University
Costea, Paul Igor, (författare)
KTH Royal Institute of Technology
Sahlén, Pelin, (författare)
KTH Royal Institute of Technology
Mulder, Jan, (författare)
Karolinska Institutet
Bergmann, Olaf, (författare)
Karolinska Institutet
Lundeberg, Joakim, (författare)
KTH Royal Institute of Technology
Frisén, Jonas, (författare)
Karolinska Institutet
visa färre...
2016
Engelska 5 s.
Ingår i: Science. - American Association for the Advancement of Science. - 0036-8075. ; 353:6294, s. 78-82
  • Forskningsöversikt (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Analysis of the pattern of proteins or messenger RNAs (mRNAs) in histological tissue sections is a cornerstone in biomedical research and diagnostics.This typically involves the visualization of a few proteins or expressed genes at a time. We have devised a strategy, which we call "spatial transcriptomics," that allows visualization and quantitative analysis of the transcriptome with spatial resolution in individual tissue sections. By positioning histological sections on arrayed reverse transcription primers with unique positional barcodes, we demonstrate high-quality RNA-sequencing data with maintained two-dimensional positional information from the mouse brain and human breast cancer. Spatial transcriptomics provides quantitative gene expression data and visualization of the distribution of mRNAs within tissue sections and enables novel types of bioinformatics analyses, valuable in research and diagnostics.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Medicinska grundvetenskaper -- Medicinsk genetik (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Basic Medicine -- Medical Genetics (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

for (ämneskategori)
ref (ämneskategori)
for (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

  • Science (Sök värdpublikationen i LIBRIS)

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy