SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:c402e24f-dc8c-4070-a274-6a05903ca9b6"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:c402e24f-dc8c-4070-a274-6a05903ca9b6" > Genome-wide associa...

Genome-wide association study for colorectal cancer identifies risk polymorphisms in German familial cases and implicates MAPK signalling pathways in disease susceptibility

Lascorz, Jesus (författare)
Försti, Asta, (författare)
Forskargrupper vid Lunds universitet, Lund University Research Groups, Lunds universitet, Lund University, Allmänmedicin och klinisk epidemiologi, Family Medicine and Clinical Epidemiology
Chen, Bowang (författare)
visa fler...
Buch, Stephan (författare)
Steinke, Verena (författare)
Rahner, Nils (författare)
Holinski-Feder, Elke (författare)
Morak, Monika (författare)
Schackert, Hans K. (författare)
Goergens, Heike (författare)
Schulmann, Karsten (författare)
Goecke, Timm (författare)
Kloor, Matthias (författare)
Engel, Cristoph (författare)
Buettner, Reinhard (författare)
Kunkel, Nelli (författare)
Weires, Marianne (författare)
Hoffmeister, Michael (författare)
Pardini, Barbara (författare)
Naccarati, Alessio (författare)
Vodickova, Ludmila (författare)
Novotny, Jan (författare)
Schreiber, Stefan (författare)
Krawczak, Michael (författare)
Broering, Clemens D. (författare)
Voelzke, Henry (författare)
Schafmayer, Clemens (författare)
Vodicka, Pavel (författare)
Chang-Claude, Jenny (författare)
Brenner, Hermann (författare)
Burwinkel, Barbara (författare)
Propping, Peter (författare)
Hampe, Jochen (författare)
Hemminki, Kari, (författare)
Forskargrupper vid Lunds universitet, Lund University Research Groups, Lunds universitet, Lund University, Allmänmedicin och klinisk epidemiologi, Family Medicine and Clinical Epidemiology
visa färre...
2010
Engelska.
Ingår i: Carcinogenesis. - Oxford University Press. - 0143-3334. ; 31:9, s. 1612-1619
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Genetic susceptibility accounts for similar to 35% of all colorectal cancer (CRC). Ten common low-risk variants contributing to CRC risk have been identified through genome-wide association studies (GWASs). In our GWAS, 610 664 genotyped single-nucleotide polymorphisms (SNPs) passed the quality control filtering in 371 German familial CRC patients and 1263 controls, and replication studies were conducted in four additional case-control sets (4915 cases and 5607 controls). Known risk loci at 8q24.21 and 11q23 were confirmed, and a previously unreported association, rs12701937, located between the genes GLI3 (GLI family zinc finger 3) and INHBA (inhibin, beta A) [P = 1.1 x 10(-3), odds ratio (OR) 1.14, 95% confidence interval (CI) 1.05-1.23, dominant model in the combined cohort], was identified. The association was stronger in familial cases compared with unselected cases (P = 2.0 x 10(-4), OR 1.36, 95% CI 1.16-1.60, dominant model). Two other unreported SNPs, rs6038071, 40 kb upstream of CSNK2A1 (casein kinase 2, alpha 1 polypeptide) and an intronic marker in MYO3A (myosin IIIA), rs11014993, associated with CRC only in the familial CRC cases (P = 2.5 x 10(-3), recessive model, and P = 2.7 x 10(-4), dominant model). Three software tools successfully pointed to the overrepresentation of genes related to the mitogen-activated protein kinase (MAPK) signalling pathways among the 1340 most strongly associated markers from the GWAS (allelic P value < 10(-3)). The risk of CRC increased significantly with an increasing number of risk alleles in seven genes involved in MAPK signalling events (P-trend = 2.2 x 10(-16), ORper allele = 1.34, 95% CI 1.11-1.61).

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy