SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:d6ac0de9-9a6d-4ee7-a247-6ffd7e3c829a"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:d6ac0de9-9a6d-4ee7-a247-6ffd7e3c829a" > Genome-wide associa...

Genome-wide association study of INDELs identified four novel susceptibility loci associated with lung cancer risk

Dai, Juncheng (författare)
Nanjing Medical University
Huang, Mingtao (författare)
Nanjing Medical University
Amos, Christopher I. (författare)
Baylor College of Medicine
visa fler...
Hung, Rayjean J. (författare)
Sinai Health System
Tardon, Adonina (författare)
University of Oviedo
Andrew, Angeline (författare)
Dartmouth-Hitchcock Medical Center
Chen, Chu (författare)
Fred Hutchinson Cancer Research Center
Christiani, David C. (författare)
Harvard University
Albanes, Demetrius (författare)
National Cancer Institute, NCI
Rennert, Gadi (författare)
Technion - Israel Institute of Technology
Fan, Jingyi (författare)
Nanjing Medical University
Goodman, Gary (författare)
Swedish Medical Center
Liu, Geoffrey (författare)
Princess Margaret Hospital University of Toronto
Field, John K. (författare)
University of Liverpool
Grankvist, Kjell (författare)
Umeå universitet,Umeå University,Klinisk kemi
Kiemeney, Lambertus A. (författare)
Radboud University Medical Center
Le Marchand, Loic (författare)
University of Hawaii Cancer Center
Schabath, Matthew B. (författare)
H. Lee Moffitt Cancer Center & Research Institute
Johansson, Mattias (författare)
International Agency for Research on Cancer, World Health Organization
Aldrich, Melinda C. (författare)
Vanderbilt University Medical Center
Johansson, Mikael (författare)
Umeå universitet,Umeå University,Institutionen för strålningsvetenskaper
Caporaso, Neil (författare)
National Cancer Institute, NCI
Lazarus, Philip (författare)
Washington State University College of Pharmacy
Lam, Stephan (författare)
British Columbia Cancer Agency
Bojesen, Stig E. (författare)
University of Copenhagen,Copenhagen University Hospital
Arnold, Susanne (författare)
University of Kentucky
Landi, Maria Teresa (författare)
National Cancer Institute, NCI
Risch, Angela (författare)
University of Salzburg
Wichmann, H. Erich (författare)
Ludwig-Maximilian University of Munich
Bickeboller, Heike (författare)
University Medical Center Göttingen
Brennan, Paul (författare)
International Agency for Research on Cancer, World Health Organization
Shete, Sanjay (författare)
University of Texas
Melander, Olle (författare)
Lund University,Lunds universitet,Kardiovaskulär forskning - hypertoni,Forskargrupper vid Lunds universitet,Cardiovascular Research - Hypertension,Lund University Research Groups
Brunnstrom, Hans (författare)
Lund University,Lunds universitet,Förbättrad diagnostik och prognostik vid lungcancer och metastaser till lunga,Forskargrupper vid Lunds universitet,Improved diagnostics and prognostics of lung cancer and metastases to the lungs,Lund University Research Groups
Zienolddiny, Shan (författare)
National Institute of Occupational Health, Norway
Woll, Penella (författare)
University of Sheffield
Stevens, Victoria (författare)
American Cancer Society
Hu, Zhibin (författare)
Nanjing Medical University
Shen, Hongbing (författare)
Nanjing Medical University
Wichmann, H-Erich (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
John Wiley and Sons Inc. 2020
2020
Engelska.
Ingår i: International Journal of Cancer. - : John Wiley and Sons Inc.. - 0020-7136 .- 1097-0215.
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Genome-wide association studies (GWAS) have identified 45 susceptibility loci associated with lung cancer. Only less than SNPs, small insertions and deletions (INDELs) are the second most abundant genetic polymorphisms in the human genome. INDELs are highly associated with multiple human diseases, including lung cancer. However, limited studies with large-scale samples have been available to systematically evaluate the effects of INDELs on lung cancer risk. Here, we performed a large-scale meta-analysis to evaluate INDELs and their risk for lung cancer in 23,202 cases and 19,048 controls. Functional annotations were performed to further explore the potential function of lung cancer risk INDELs. Conditional analysis was used to clarify the relationship between INDELs and SNPs. Four new risk loci were identified in genome-wide INDEL analysis (1p13.2: rs5777156, Insertion, OR = 0.92, p = 9.10 × 10−8; 4q28.2: rs58404727, Deletion, OR = 1.19, p = 5.25 × 10−7; 12p13.31: rs71450133, Deletion, OR = 1.09, p = 8.83 × 10−7; and 14q22.3: rs34057993, Deletion, OR = 0.90, p = 7.64 × 10−8). The eQTL analysis and functional annotation suggested that INDELs might affect lung cancer susceptibility by regulating the expression of target genes. After conducting conditional analysis on potential causal SNPs, the INDELs in the new loci were still nominally significant. Our findings indicate that INDELs could be potentially functional genetic variants for lung cancer risk. Further functional experiments are needed to better understand INDEL mechanisms in carcinogenesis.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)

Nyckelord

genome-wide association studies
INDELs
lung cancer
INDELs

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy