SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:db2fe302-8311-496f-a632-5baaca4e9ce4"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:db2fe302-8311-496f-a632-5baaca4e9ce4" > Ancestry-Shift Refi...

Ancestry-Shift Refinement Mapping of the C6orf97-ESR1 Breast Cancer Susceptibility Locus

Stacey, Simon N. (författare)
Sulem, Patrick (författare)
Zanon, Carlo (författare)
visa fler...
Gudjonsson, Sigurjon A. (författare)
Thorleifsson, Gudmar (författare)
Helgason, Agnar (författare)
Jonasdottir, Aslaug (författare)
Besenbacher, Soren (författare)
Kostic, Jelena P. (författare)
Fackenthal, James D. (författare)
Huo, Dezheng (författare)
Adebamowo, Clement (författare)
Ogundiran, Temidayo (författare)
Olson, Janet E. (författare)
Fredericksen, Zachary S. (författare)
Wang, Xianshu (författare)
Look, Maxime P. (författare)
Sieuwerts, Anieta M. (författare)
Martens, John W. M. (författare)
Pajares, Isabel (författare)
Garcia-Prats, Maria D. (författare)
Ramon-Cajal, Jose M. (författare)
de Juan, Ana (författare)
Panadero, Angeles (författare)
Ortega, Eugenia (författare)
Aben, Katja K. H. (författare)
Vermeulen, Sita H. (författare)
Asadzadeh, Fatemeh (författare)
van Engelenburg, K. C. Anton (författare)
Margolin, Sara (författare)
Shen, Chen-Yang (författare)
Wu, Pei-Ei (författare)
Försti, Asta (författare)
Lund University,Lunds universitet,Allmänmedicin och klinisk epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Family Medicine and Clinical Epidemiology,Lund University Research Groups
Lenner, Per (författare)
Umeå universitet,Onkologi
Henriksson, Roger (författare)
Umeå universitet,Onkologi
Johansson, Robert (författare)
Umeå universitet,Onkologi
Enquist, Kerstin (författare)
Umeå universitet,Näringsforskning
Hallmans, Goran (författare)
Jonsson, Thorvaldur (författare)
Sigurdsson, Helgi (författare)
Alexiusdottir, Kristin (författare)
Gudmundsson, Julius (författare)
Sigurdsson, Asgeir (författare)
Frigge, Michael L. (författare)
Gudmundsson, Larus (författare)
Kristjansson, Kristleifur (författare)
Halldorsson, Bjarni V. (författare)
Styrkarsdottir, Unnur (författare)
Gulcher, Jeffrey R. (författare)
Hemminki, Kari (författare)
Lund University,Lunds universitet,Allmänmedicin och klinisk epidemiologi,Forskargrupper vid Lunds universitet,Family Medicine and Clinical Epidemiology,Lund University Research Groups
Lindblom, Annika (författare)
Kiemeney, Lambertus A. (författare)
Mayordomo, Jose I. (författare)
Foekens, John A. (författare)
Couch, Fergus J. (författare)
Olopade, Olufunmilayo I. (författare)
Gudbjartsson, Daniel F. (författare)
Thorsteinsdottir, Unnur (författare)
Rafnar, Thorunn (författare)
Johannsson, Oskar T. (författare)
Stefansson, Kari (författare)
Halldorsson, Bjarni V (författare)
Couch, Fergus J (författare)
Mayordomo, Jose I (författare)
Vermeulen, Sita H (författare)
Gulcher, Jeffrey R (författare)
Stacey, Simon N (författare)
Gudjonsson, Sigurjon A (författare)
Ramon-Cajal, Jose M (författare)
Foekens, John A (författare)
Fackenthal, James D (författare)
Olson, Janet E (författare)
van Engelenburg, K C Anton (författare)
Sieuwerts, Anieta M (författare)
Kiemeney, Lambertus A (författare)
Aben, Katja K H (författare)
Look, Maxime P (författare)
Gudbjartsson, Daniel F (författare)
Hallmans, Göran (författare)
Umeå universitet,Näringsforskning
Johannsson, Oskar T (författare)
Fredericksen, Zachary S (författare)
Frigge, Michael L (författare)
Kostic, Jelena P (författare)
Garcia-Prats, Maria D (författare)
Olopade, Olufunmilayo I (författare)
Martens, John W M (författare)
Styrkarsdottir, U (författare)
Stacey, SN (författare)
Thorsteinsdottir, U (författare)
Gudjonsson, SA (författare)
Pajares, I (författare)
Martens, JWM (författare)
Sieuwerts, AM (författare)
Hallmans, G (författare)
Huo, D (författare)
de Juan, A (författare)
Gudbjartsson, DF (författare)
Forsti, A (författare)
Fackenthal, JD (författare)
Enquist, K (författare)
Ogundiran, T (författare)
Halldorsson, BV (författare)
Frigge, ML (författare)
Foekens, JA (författare)
Ortega, E (författare)
Alexiusdottir, K (författare)
Sigurdsson, A (författare)
Thorleifsson, G (författare)
Look, MP (författare)
Jonasdottir, A (författare)
Gulcher, JR (författare)
Helgason, A (författare)
Mayordomo, JI (författare)
Aben, KKH (författare)
Olson, JE (författare)
Kristjansson, K (författare)
Kiemeney, LA (författare)
Couch, FJ (författare)
van Engelenburg, KCA (författare)
Besenbacher, S (författare)
Hemminki, K (författare)
Johansson, R (författare)
Sigurdsson, H (författare)
Wang, XS (författare)
Adebamowo, C (författare)
Jonsson, T (författare)
Gudmundsson, J (författare)
Shen, CY (författare)
Wu, PE (författare)
Lenner, P (författare)
Ramon-Cajal, JM (författare)
Henriksson, R (författare)
Stefansson, K (författare)
Asadzadeh, F (författare)
Margolin, S (författare)
Karolinska Institutet
Olopade, OI (författare)
Zanon, C (författare)
Fredericksen, ZS (författare)
Garcia-Prats, MD (författare)
Panadero, A (författare)
Rafnar, T (författare)
Vermeulen, SH (författare)
Lindblom, A (författare)
Karolinska Institutet
Kostic, JP (författare)
Gudmundsson, L (författare)
Sulem, P (författare)
Johannsson, OT (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
Public Library of Science, 2010
2010
Engelska.
Ingår i: PLoS Genetics. - : Public Library of Science. - 1553-7404. ; 6:7
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • We used an approach that we term ancestry-shift refinement mapping to investigate an association, originally discovered in a GWAS of a Chinese population, between rs2046210[T] and breast cancer susceptibility. The locus is on 6q25.1 in proximity to the C6orf97 and estrogen receptor alpha (ESR1) genes. We identified a panel of SNPs that are correlated with rs2046210 in Chinese, but not necessarily so in other ancestral populations, and genotyped them in breast cancer case: control samples of Asian, European, and African origin, a total of 10,176 cases and 13,286 controls. We found that rs2046210[T] does not confer substantial risk of breast cancer in Europeans and Africans (OR = 1.04, P = 0.099, and OR = 0.98, P = 0.77, respectively). Rather, in those ancestries, an association signal arises from a group of less common SNPs typified by rs9397435. The rs9397435[G] allele was found to confer risk of breast cancer in European (OR = 1.15, P = 1.2x10(-3)), African (OR = 1.35, P = 0.014), and Asian (OR = 1.23, P = 2.9x10(-4)) population samples. Combined over all ancestries, the OR was 1.19 (P = 3.9x10(-7)), was without significant heterogeneity between ancestries (P-het = 0.36) and the SNP fully accounted for the association signal in each ancestry. Haplotypes bearing rs9397435[G] are well tagged by rs2046210[ T] only in Asians. The rs9397435[G] allele showed associations with both estrogen receptor positive and estrogen receptor negative breast cancer. Using early-draft data from the 1,000 Genomes project, we found that the risk allele of a novel SNP (rs77275268), which is closely correlated with rs9397435, disrupts a partially methylated CpG sequence within a known CTCF binding site. These studies demonstrate that shifting the analysis among ancestral populations can provide valuable resolution in association mapping.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Hälsovetenskap -- Folkhälsovetenskap, global hälsa, socialmedicin och epidemiologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Health Sciences -- Public Health, Global Health, Social Medicine and Epidemiology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Hälsovetenskaper (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Health Sciences (hsv//eng)

Nyckelord

MEDICINE
MEDICIN

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Stacey, Simon N.
Sulem, Patrick
Zanon, Carlo
Gudjonsson, Sigu ...
Thorleifsson, Gu ...
Helgason, Agnar
visa fler...
Jonasdottir, Asl ...
Besenbacher, Sor ...
Kostic, Jelena P ...
Fackenthal, Jame ...
Huo, Dezheng
Adebamowo, Cleme ...
Ogundiran, Temid ...
Olson, Janet E.
Fredericksen, Za ...
Wang, Xianshu
Look, Maxime P.
Sieuwerts, Aniet ...
Martens, John W. ...
Pajares, Isabel
Garcia-Prats, Ma ...
Ramon-Cajal, Jos ...
de Juan, Ana
Panadero, Angele ...
Ortega, Eugenia
Aben, Katja K. H ...
Vermeulen, Sita ...
Asadzadeh, Fatem ...
van Engelenburg, ...
Margolin, Sara
Shen, Chen-Yang
Wu, Pei-Ei
Försti, Asta
Lenner, Per
Henriksson, Roge ...
Johansson, Rober ...
Enquist, Kerstin
Hallmans, Goran
Jonsson, Thorval ...
Sigurdsson, Helg ...
Alexiusdottir, K ...
Gudmundsson, Jul ...
Sigurdsson, Asge ...
Frigge, Michael ...
Gudmundsson, Lar ...
Kristjansson, Kr ...
Halldorsson, Bja ...
Styrkarsdottir, ...
Gulcher, Jeffrey ...
Hemminki, Kari
Lindblom, Annika
Kiemeney, Lamber ...
Mayordomo, Jose ...
Foekens, John A.
Couch, Fergus J.
Olopade, Olufunm ...
Gudbjartsson, Da ...
Thorsteinsdottir ...
Rafnar, Thorunn
Johannsson, Oska ...
Stefansson, Kari
Halldorsson, Bja ...
Couch, Fergus J
Mayordomo, Jose ...
Vermeulen, Sita ...
Gulcher, Jeffrey ...
Stacey, Simon N
Gudjonsson, Sigu ...
Ramon-Cajal, Jos ...
Foekens, John A
Fackenthal, Jame ...
Olson, Janet E
van Engelenburg, ...
Sieuwerts, Aniet ...
Kiemeney, Lamber ...
Aben, Katja K H
Look, Maxime P
Gudbjartsson, Da ...
Hallmans, Göran
Johannsson, Oska ...
Fredericksen, Za ...
Frigge, Michael ...
Kostic, Jelena P
Garcia-Prats, Ma ...
Olopade, Olufunm ...
Martens, John W ...
Styrkarsdottir, ...
Stacey, SN
Thorsteinsdottir ...
Gudjonsson, SA
Pajares, I
Martens, JWM
Sieuwerts, AM
Hallmans, G
Huo, D
de Juan, A
Gudbjartsson, DF
Forsti, A
Fackenthal, JD
Enquist, K
Ogundiran, T
Halldorsson, BV
Frigge, ML
Foekens, JA
Ortega, E
Alexiusdottir, K
Sigurdsson, A
Thorleifsson, G
Look, MP
Jonasdottir, A
Gulcher, JR
Helgason, A
Mayordomo, JI
Aben, KKH
Olson, JE
Kristjansson, K
Kiemeney, LA
Couch, FJ
van Engelenburg, ...
Besenbacher, S
Hemminki, K
Johansson, R
Sigurdsson, H
Wang, XS
Adebamowo, C
Jonsson, T
Gudmundsson, J
Shen, CY
Wu, PE
Lenner, P
Ramon-Cajal, JM
Henriksson, R
Stefansson, K
Asadzadeh, F
Margolin, S
Olopade, OI
Zanon, C
Fredericksen, ZS
Garcia-Prats, MD
Panadero, A
Rafnar, T
Vermeulen, SH
Lindblom, A
Kostic, JP
Gudmundsson, L
Sulem, P
Johannsson, OT
visa färre...
Om ämnet
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Hälsovetenskap
och Folkhälsovetensk ...
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Hälsovetenskaper
Artiklar i publikationen
PLoS Genetics
Av lärosätet
Lunds universitet
Umeå universitet

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy