SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:e0098cef-d82f-4420-8d2f-7ab4ed444bcb"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:e0098cef-d82f-4420-8d2f-7ab4ed444bcb" > Fine mapping of gen...

Fine mapping of genetic susceptibility loci for melanoma reveals a mixture of single variant and multiple variant regions

Barrett, Jennifer H. (författare)
Taylor, John C. (författare)
Bright, Chloe (författare)
visa fler...
Harland, Mark (författare)
Dunning, Alison M. (författare)
Akslen, Lars A. (författare)
Andresen, Per A. (författare)
Avril, Marie-Francoise (författare)
Azizi, Esther (författare)
Scarra, Giovanna Bianchi (författare)
Brossard, Myriam (författare)
Brown, Kevin M. (författare)
Debniak, Tadeusz (författare)
Elder, David E. (författare)
Friedman, Eitan (författare)
Ghiorzo, Paola (författare)
Gillanders, Elizabeth M. (författare)
Gruis, Nelleke A. (författare)
Hansson, Johan (författare)
Helsing, Per (författare)
Hocevar, Marko (författare)
Hoiom, Veronica (författare)
Ingvar, Christian (författare)
Lund University,Lunds universitet,Kirurgi, Lund,Sektion V,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Surgery (Lund),Section V,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine
Landi, Maria Teresa (författare)
Lang, Julie (författare)
Lathrop, G. Mark (författare)
Lubinski, Jan (författare)
Mackie, Rona M. (författare)
Molven, Anders (författare)
Novakovic, Srdjan (författare)
Olsson, Håkan (författare)
Lund University,Lunds universitet,Medicinsk onkologi,Sektion I,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medicinska fakulteten,Tumörmikromiljö,Institutionen för kliniska vetenskaper, Lund,Medical oncology,Section I,Department of Clinical Sciences, Lund,Faculty of Medicine,Tumor microenvironment,Department of Clinical Sciences, Lund
Puig, Susana (författare)
Anton Puig-Butille, Joan (författare)
van der Stoep, Nienke (författare)
van Doorn, Remco (författare)
van Workum, Wilbert (författare)
Goldstein, Alisa M. (författare)
Kanetsky, Peter A. (författare)
Pharoah, Paul D. P. (författare)
Demenais, Florence (författare)
Hayward, Nicholas K. (författare)
Newton Bishop, Julia A. (författare)
Bishop, D. Timothy (författare)
Iles, Mark M. (författare)
Gillanders, EM (författare)
Novakovic, S (författare)
Harland, M (författare)
Hansson, J (författare)
Karolinska Institutet
Brown, KM (författare)
Ghiorzo, P (författare)
Bright, C (författare)
Mackie, RM (författare)
Hocevar, M (författare)
Taylor, JC (författare)
Landi, MT (författare)
Lathrop, GM (författare)
Hoiom, V (författare)
Karolinska Institutet
Molven, A (författare)
van Doorn, R (författare)
Scarra, GB (författare)
Lang, J (författare)
Pharoah, PDP (författare)
Olsson, H (författare)
Friedman, E (författare)
Elder, DE (författare)
Gruis, NA (författare)
van Workum, W (författare)
van der Stoep, N (författare)
Hayward, NK (författare)
Andresen, PA (författare)
Puig-Butille, JA (författare)
Bishop, DT (författare)
Demenais, F (författare)
Goldstein, AM (författare)
Puig, S (författare)
Kanetsky, PA (författare)
Debniak, T (författare)
Akslen, LA (författare)
Barrett, JH (författare)
Ingvar, C (författare)
Brossard, M (författare)
Lubinski, J (författare)
Helsing, P (författare)
Newton Bishop, JA (författare)
Iles, MM (författare)
Dunning, AM (författare)
Avril, MF (författare)
Azizi, E (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
John Wiley and Sons, 2015
2015
Engelska.
Ingår i: International Journal of Cancer. - : John Wiley and Sons. - 0020-7136 .- 1097-0215. ; 136:6, s. 1351-1360
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • At least 17 genomic regions are established as harboring melanoma susceptibility variants, in most instances with genome-wide levels of significance and replication in independent samples. Based on genome-wide single nucleotide polymorphism (SNP) data augmented by imputation to the 1,000 Genomes reference panel, we have fine mapped these regions in over 5,000 individuals with melanoma (mainly from the GenoMEL consortium) and over 7,000 ethnically matched controls. A penalized regression approach was used to discover those SNP markers that most parsimoniously explain the observed association in each genomic region. For the majority of the regions, the signal is best explained by a single SNP, which sometimes, as in the tyrosinase region, is a known functional variant. However in five regions the explanation is more complex. At the CDKN2A locus, for example, there is strong evidence that not only multiple SNPs but also multiple genes are involved. Our results illustrate the variability in the biology underlying genome-wide susceptibility loci and make steps toward accounting for some of the missing heritability. What's new? In genome-wide association studies, researchers identify genetic variants that frequently associate with a particular disease, though the variants identified may not contribute to the molecular cause of the disease. This study took a closer look at 17 regions associated with melanoma, fine mapping the regions both in people with melanoma and in healthy controls. Though single SNPs account for the association in some regions, they found that in a few regions, several SNPs - and possibly multiple genes - contributed to the association signal. These findings illustrate the importance of not overlooking the interaction between multiple genetic markers when conducting such studies.

Ämnesord

MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin -- Cancer och onkologi (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine -- Cancer and Oncology (hsv//eng)
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP  -- Klinisk medicin (hsv//swe)
MEDICAL AND HEALTH SCIENCES  -- Clinical Medicine (hsv//eng)

Nyckelord

melanoma
fine mapping
penalized regression
heritability
genome-wide
signal

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Hitta mer i SwePub

Av författaren/redakt...
Barrett, Jennife ...
Taylor, John C.
Bright, Chloe
Harland, Mark
Dunning, Alison ...
Akslen, Lars A.
visa fler...
Andresen, Per A.
Avril, Marie-Fra ...
Azizi, Esther
Scarra, Giovanna ...
Brossard, Myriam
Brown, Kevin M.
Debniak, Tadeusz
Elder, David E.
Friedman, Eitan
Ghiorzo, Paola
Gillanders, Eliz ...
Gruis, Nelleke A ...
Hansson, Johan
Helsing, Per
Hocevar, Marko
Hoiom, Veronica
Ingvar, Christia ...
Landi, Maria Ter ...
Lang, Julie
Lathrop, G. Mark
Lubinski, Jan
Mackie, Rona M.
Molven, Anders
Novakovic, Srdja ...
Olsson, Håkan
Puig, Susana
Anton Puig-Butil ...
van der Stoep, N ...
van Doorn, Remco
van Workum, Wilb ...
Goldstein, Alisa ...
Kanetsky, Peter ...
Pharoah, Paul D. ...
Demenais, Floren ...
Hayward, Nichola ...
Newton Bishop, J ...
Bishop, D. Timot ...
Iles, Mark M.
Gillanders, EM
Novakovic, S
Harland, M
Hansson, J
Brown, KM
Ghiorzo, P
Bright, C
Mackie, RM
Hocevar, M
Taylor, JC
Landi, MT
Lathrop, GM
Hoiom, V
Molven, A
van Doorn, R
Scarra, GB
Lang, J
Pharoah, PDP
Olsson, H
Friedman, E
Elder, DE
Gruis, NA
van Workum, W
van der Stoep, N
Hayward, NK
Andresen, PA
Puig-Butille, JA
Bishop, DT
Demenais, F
Goldstein, AM
Puig, S
Kanetsky, PA
Debniak, T
Akslen, LA
Barrett, JH
Ingvar, C
Brossard, M
Lubinski, J
Helsing, P
Newton Bishop, J ...
Iles, MM
Dunning, AM
Avril, MF
Azizi, E
visa färre...
Om ämnet
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Klinisk medicin
och Cancer och onkol ...
MEDICIN OCH HÄLSOVETENSKAP
MEDICIN OCH HÄLS ...
och Klinisk medicin
Artiklar i publikationen
International Jo ...
Av lärosätet
Lunds universitet
Karolinska Institutet

Sök utanför SwePub

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy