SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:e20a5103-01ae-48a3-bf5d-93f79b9ea1b7"
 

Sökning: onr:"swepub:oai:lup.lub.lu.se:e20a5103-01ae-48a3-bf5d-93f79b9ea1b7" > Nanoconfined Circul...

Nanoconfined Circular and Linear DNA: Equilibrium Conformations and Unfolding Kinetics

Alizadehheidari, Mohammadreza (författare)
Werner, Erik (författare)
Noble, Charleston (författare)
visa fler...
Reiter-Schad, Michaela (författare)
Nyberg, Lena K. (författare)
Fritzsche, Joachim (författare)
Mehlig, Bernhard (författare)
Tegenfeldt, Jonas O. (författare)
Ambjornsson, Tobias (författare)
Persson, Fredrik, (författare)
Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi
Westerlund, Fredrik (författare)
Ambjörnsson, Tobias, (författare)
Lunds universitet, Lund University, Naturvetenskapliga fakulteten, Faculty of Science, Institutionen för astronomi och teoretisk fysik, Department of Astronomy and Theoretical Physics, Beräkningsbiologi och biologisk fysik, Computational Biology and Biological Physics
visa färre...
Uppsala universitet Teknisk-naturvetenskapliga vetenskapsområdet. Biologiska sektionen. Institutionen för cell- och molekylärbiologi. (creator_code:org_t)
Lunds universitet Beräkningsbiologi och biologisk fysik. (creator_code:org_t)
visa fler...
Lunds universitet Fasta tillståndets fysik. (creator_code:org_t)
Lunds universitet NanoLund. (creator_code:org_t)
Göteborgs universitet Naturvetenskapliga fakulteten. Institutionen för fysik (GU). 
visa färre...
2015
Engelska.
Ingår i: Macromolecules. - The American Chemical Society (ACS). - 0024-9297. ; 48:3, s. 871-878
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • Studies of circular DNA confined to nanofluidic channels are relevant both from a fundamental polymer-physics perspective and due to the importance of circular DNA molecules in vivo. We here observe the unfolding of confined DNA from the circular to linear configuration as a light-induced double-strand break occurs, characterize the dynamics, and compare the equilibrium conformational statistics of linear and circular configurations. This is important because it allows us to determine to what extent existing statistical theories describe the extension of confined circular DNA. We find that the ratio of the extensions of confined linear and circular DNA configurations increases as the buffer concentration decreases. The experimental results fall between theoretical predictions for the extended de Gennes regime at weaker confinement and the Odijk regime at stronger confinement. We show that it is possible to directly distinguish between circular and linear DNA molecules by measuring the emission intensity from the DNA. Finally, we determine the rate of unfolding and show that this rate is larger for more confined DNA, possibly reflecting the corresponding larger difference in entropy between the circular and linear configurations.

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologiska vetenskaper -- Cellbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Cell Biology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologiska vetenskaper -- Biokemi och molekylärbiologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Biochemistry and Molecular Biology (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Fysik -- Den kondenserade materiens fysik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Physical Sciences -- Condensed Matter Physics (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Biologiska vetenskaper -- Biofysik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences -- Biophysics (hsv//eng)
NATURVETENSKAP  -- Fysik (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Physical Sciences (hsv//eng)

Publikations- och innehållstyp

art (ämneskategori)
ref (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy