| 82351. |
- Kokkinakis, Dimitrios, 1965
(author)
-
Insights on a Swedish Covid-19 corpus
- 2021
-
In: CLARIN Annual Conference (Virtual Event). 27 – 29 September 2021. Monica Monachini, Maria Eskevich (red.). s. 31-34.
-
Conference paper (peer-reviewed)abstract
- The COVID-19 pandemic has had a serious impact on people all over the world, from mental and physical health to economic downturn to education and social relationships, while political decisions in many countries have had a profound impact on the lives of all people regardless of age. Many of these effects can be studied with statistical and qualitative data such as collected questionnaires and sickness absence rates. But large-scale studies require expertise in multiple domains and from many points of view. SpråkbankenText continuously collects text from various sources. In order to fill the gap in the lack of an available Swedish COVID-19-related dataset, we started to build a Swedish COVID-19 corpus (sv-COVID-19). Various tools for e.g. lexical, semantic or pragmatic/discourse analyses can be then applied in order to answer relevant questions on e.g. how people, on a larger scale than what can be obtained through qualitative studies, experienced their everyday life through the different phases of COVID-19 crisis, or how political decisions and their consequences are described and discussed.
|
|
| 82352. |
|
|
| 82353. |
- Kokkinakis, Dimitrios, 1965, et al.
(author)
-
Investigating the Effects of MWE Identification in Structural Topic Modelling
- 2023
-
In: 19th Workshop on Multiword Expressions, MWE 2023 - Proceedings. - : ACL. ; , s. 36-44
-
Conference paper (peer-reviewed)abstract
- Multiword expressions (MWEs) are common word combinations which exhibit idiosyncrasies in various linguistic levels. For various downstream natural language processing applications and tasks, the identification and discovery of MWEs has been proven to be potentially practical and useful, but still challenging to codify. In this paper we investigate various, relevant to MWE, resources and tools for Swedish, and, within a specific application scenario, we apply structural topic modelling to investigate whether there are any interpretative advantages of identifying MWEs.
|
|
| 82354. |
- Kokkinakis, Dimitrios, 1965
(author)
-
Is data scrubbing useful for anonymizing sensitive data?.
- 2010
-
In: the Third Swedish Language Technology Conference.
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- The release of individual data for research, public health planning, health care statistics, monitoring of diagnostic tests, automated data collection for health care registries and tracking disease outbreaks are some of the areas in which the protection of Personal Health Information (PHI) has become an important concern. The purpose of this study is to adapt and apply synergetic methods to document de-identification, particularly in the clinical setting. The main challenge is to retain important concepts and PHI in the documents in a standardized and neutral manner as means of encryption without violating the integrity of the PHI and without sacrificing the quality and intended meaning of the authors.
|
|
| 82355. |
- Kokkinakis, Dimitrios, 1965, et al.
(author)
-
Issues on Quality Assessment of SNOMED CT® Subsets - Term Validation and Term Extraction
- 2009
-
In: Proceedings of RANLP-2009 Workshop: Biomedical Information Extraction..
-
Journal article (peer-reviewed)abstract
- The aim of this paper is to apply and develop methods based on Natural Language Processing for automatically testing the validity, reliability and coverage of various Swedish SNOMED-CT subsets, the Systematized NOmenclature of MEDicine - Clinical Terms a multiaxial, hierarchical classification system which is currently being translated from English to Swedish. Our work has been developed across two dimensions. Initially a Swedish electronic text collection of scientific medical documents has been collected and processed to a uniform format. Secondly, a term processing activity has been taken place. In the first phase of this activity, various SNOMED CT subsets have been mapped to the text collection for evaluating the validity and reliability of the translated terms. In parallel, a large number of term candidates have been extracted from the corpus in order to examine the coverage of SNOMED CT. Term candidates that are currently not included in the Swedish SNOMED CT can be either parts of compounds, parts of potential multiword terms, terms that are not yet been translated or potentially new candidates. In order to achieve these goals a number of automatic term recognition algorithms have been applied to the corpus. The results of the later process is to be reviewed by domain experts (relevant to the subsets extracted) through a relevant interface who can decide whether a new set of terms can be incorporated in the Swedish translation of SNOMED CT or not.
|
|
| 82356. |
- Kokkinakis, Dimitrios, 1965, et al.
(author)
-
Kan textforskning bidra till tidigare och säkrare demensdiagnostik?
- 2018
-
In: Forum för textforskning 13 , Lund 7 – 8 juni 2018.
-
Conference paper (other academic/artistic)abstract
- Tidigare forskning har visat att subtila språkstörningar kan finnas vid de tidigaste förstadierna till demens, flera år innan en klinisk diagnos kan ställas. Inom ramen för projektet ”Språkliga och extra-lingvistiska parametrar för tidig upptäckt av kognitiv svikt” (finansierat av Riksbankens Jubileumsutlysning, 2016-19) undersöker vi med hjälp av språkteknologi och språkanalysstudier hur dessa språkstörningar yttrar sig. Kan språkteknologi användas för att upptäcka dessa tidiga språkrelaterade symtom och därmed bidra med nyanserad, komplementär och användbar kunskap? Kan användning av språkteknologi särskilja personer med de allra tidigaste kognitiva avvikelserna från personer med mer godartad, åldersrelaterad kognitiv svikt? Vilka språkliga förmågor drabbas? Hur yttrar sig dessa förändringar och vilka slags empiriska material finns att tillgå? Dessa är några av de frågor vi söker svar på. Vi gör inspelningar som vi analyserar för att kunna ta fram ny kunskap om subtila språkliga kännetecken som kan föregå demensutveckling. Denna kunskap kan användas för att eventuellt kunna förutsäga vilka individer som befinner sig i riskzonen för att utveckla demens, och kan vara användbar som komplementerande beslutsunderlag till domänexperter. Vi utvinner, analyserar och undersöker om det finns samband mellan olika språkrelaterade parametrar från spontan talinteraktion, transkriptioner men även ögonrörelser och neuropsykologiska tester från personer med subjektiv eller lindrig kognitiv nedsättning och friska kontrollpersoner. Många gånger är det svårt att avgöra huruvida lindriga kognitiva symtom är en del av det normala åldrandet eller början på en neurodegenerativ process. Vi förväntar oss inte heller att varje enskild person med kognitiv nedsättning kommer att uttrycka sig eller läsa på samma sätt utan snarare att dessa personer tidigt i sjukdomsförloppet kommer att börja uppvisa olika slags avvikande läsmönster, eller göra fonologiska, lexikala, syntaktiska eller semantiska fel. I studien utvecklar vi verktyg för att automatiskt hitta dessa avvikelser, och målet är att detta sedan ska kunna användas som komplement till tidig diagnostik samt som prognostiskt eller screeningverktyg. Deltagarna i vår studie har rekryterats från en pågående longitudinell studie, ”Demens i Tidigt Skede”, (eng. ”The Gothenburg MCI study”) på Minnesmottagningen i Göteborg, och vårt projekt har godkänts av den lokala etiknämnden. Alla deltagare i studien (kontrollgruppen [HC], personer med subjektiv kognitiv nedsättning [SCI] och personer med mild kognitiv nedsättning [MCI]) har genomgått baslinjeundersökning och gett informerat skriftligt samtycke (demografisk information finns i tabell 1). Vårt projekt är f.n. pågående och vi kommer presentera resultat baserade på inspelningstillfälle nr ett (aug. 2016-mars 2017). En ny inspelningsomgång, med samma deltagare, började i februari 2018 och förväntas vara avslutat i december 2018. Under presentationen kommer vi ge exempel på olika tal-, text- och ögonrörelseanalyser vi har genomfört och diskutera metodval och resultat baserade på studiens första fas. Vi kommer vidare ge en kort inblick i den nya, pågående inspelningsomgången och de nya testmoment vi använder. Vi vill med vårt arbete visa hur språkteknologisk analys kan bidra till att utöka vår kunskap inom området så att den kan vara användbar för tidig diagnostik och optimal omvårdnad. Enligt Socialstyrelsen (2017) finns det i Sverige över 160 000 personer med någon demenssjukdom. Våra resultat kan ha en betydelse för vårdpersonal som snabbare vill diagnostisera och identifiera individer med olika former av kognitiv funktionsnedsättning innan allvarliga symtom blir påtagliga. Utvecklingsmöjligheterna är många: nya eller förbättrade kognitiva screeningtester som skulle kunna användas inom primär- och specialistvården, samt utveckling och tillämpning av insatser som kan påverka beteendemönster och träna upp individens kommunikativa förmåga, kan på sikt leda till positiva konsekvenser som minskade vårdköer samt effektivare behandling avseende kostnader och behandlingsutfall.
|
|
| 82357. |
- Kokkinakis, Dimitrios, 1965
(author)
-
Korpus för vårdens och omsorgens fackspråk.
- 2010
-
In: Humanistdagen 2010 - humaniora i dagens samhälle..
-
Conference paper (other academic/artistic)abstract
- Inom ramen för regeringens satsning ”Nationell IT-strategi för vård och omsorg” har Socialstyrelsen fått i uppdrag att översätta och anpassa begreppssystemet ’the Systematized Nomenclature of Medicine, Clinical Terms’ till svenska. Med hjälp av Läkartidningens digitala arkiv har vi utvecklat metoder för att effektivisera kvalitetssäkringen av terminnehållet.
|
|
| 82358. |
- Kokkinakis, Dimitrios, 1965, et al.
(author)
-
Kvalitetssäkring av SNOMED CT med hjälp av Läkartidningens arkiv.
- 2009
-
In: Svenska Läkaresällskapets Riksstämman.
-
Conference paper (other academic/artistic)abstract
- Inom ramen för regeringens satsning ”Nationell IT-strategi för vård och omsorg” har Socialstyrelsen fått i uppdrag att översätta och anpassa begreppssystemet ’the Systematized Nomenclature of Medicine, Clinical Terms’ (SNOMED CT) till svenska. Arbetet är både omfattande och tidskrävande samtidigt som uppdragstagaren har krav om kvalitetssäkring av översättningen. Hur kan Läkartidningens arkiv bidra till kvalitetssäkringen? Med hjälp av Läkartidningens digitala arkiv, LDA, (årgångarna 1996-2009) har vi utvecklat metoder för att effektivisera kvalitetssäkringen av olika SNOMED CT-urval (t.ex. diabetestermer). Det innebär att vi underlättar för utförandet av empiriska, SNOMED CT-relaterade studier, som t.ex. framtagning av underlag om termernas användning, variation och frekvensdistribution över tid. Arkivets förädling: LDA:t omvandlades till ett enhetligt textbaserat format och textinnehållet normaliserades med avseenden på dokumentformat och teckenkodning för att kunna skapa ett bra underlag för den efterföljande språkteknologiska analysen. Alla artiklar i varje publicerad årgång extraherades och märktes upp dels med olika slags metainformation (t.ex. genretillhörighet) dels med lingvistisk och semantisk information, sammanlagt 27 000 artiklar. Den språkteknologiska bearbetningen innefattade automatiskt tillägg av lingvistisk information som t.ex. ordklasstillhörighet för varje ord i korpusen och automatiskt, semantisk mappning dels till den svenska MeSH-tesaurusen och dels till delar av den svensköversatta SNOMED-hierarkin. LDA i en ny skepnad: LDA utgör sedan länge en värdefull svensk medicinsk resurs för alla som yrkesmässigt jobbar med termer och språk. Vi har dock bidragit med att göra textmaterialet ännu mer välstrukturerat och förädlat, som kan vara till hjälp för explorativa studier där sökningar kan förfinas på ett flertal sätt och därmed ge forskare möjligheter att göra djupare innehållsanalyser av texterna och samla grundläggande kunskaper inom olika ämnesområden. Kombinationen av enstaka termer och ord med lingvistisk och semantisk information ger unika möjligheter till att skaffa information och generera fakta som kan leda till nya hypoteser och eventuellt ny kunskap om olika aspekter som gäller termanvändning och variation och vi kommer att redovisa exempel på sådana analyser.
|
|
| 82359. |
- Kokkinakis, Dimitrios, 1965, et al.
(author)
-
Lay Language versus Professional Language within the Cardiovascular Subdomain - a Contrastive Study
- 2006
-
In: Proceedings of the 2006 WSEAS Int. Conf. on Cellular & Molecular Biology, Biophysics & Bioengineering.
-
Conference paper (peer-reviewed)abstract
- This paper reports on a corpus-based, contrastive study of Swedish medical language. It is focused on the vocabulary used in two types of medical textual material: professional portals and web-based consumer sites within the domain of cardiovascular disorders. Linguistic, statistical and quantitatively based readability studies are considered in order to find the typical language-dependent and, possibly, language independent characteristics of the material examined and suggest concrete measures that might bridge the gap in medical vocabulary as used by laypersons/consumers and professionals.
|
|
| 82360. |
- Kokkinakis, Dimitrios, 1965
(author)
-
Lexical granularity for automatic indexing and means to achieve it - the case of Swedish MeSH®
- 2009
-
In: Information Retrieval in Biomedicine : Natural Language Processing for Knowledge Integration. - Hershey, Pennsylvania : IGI Global.
-
Book chapter (other academic/artistic)abstract
- The identification and mapping of terminology from large repositories of life science data onto concept hierarchies constitute an important initial step for a deeper semantic exploration of unstructured textual content. Accurate and efficient mapping of this kind is likely to provide better means of enhancing indexing and retrieval of text, uncovering subtle differences, similarities and useful patterns, and hopefully new knowledge, among complex surface realisations, overlooked by shallow techniques based on various forms of lexicon look-up approaches. However, a finer-grained level of mapping between terms as they occur in natural language and domain concepts is a cumbersome enterprise that requires various levels of processing in order to make explicit relevant linguistic structures. This chapter highlights some of the challenges encountered in the process of bridging free to controlled vocabularies and thesauri and vice versa. We investigate how the extensive variability of lexical terms in authentic data can be efficiently projected to hierarchically structured codes, while means to increase the coverage of the underlying lexical resources are also investigated.
|
|
