SwePub
Sök i SwePub databas

  Utökad sökning

Träfflista för sökning "WFRF:(Bakker Stephan J. L.) "

Sökning: WFRF:(Bakker Stephan J. L.)

  • Resultat 21-21 av 21
Sortera/gruppera träfflistan
   
NumreringReferensOmslagsbildHitta
21.
  • Sánchez Brotons, Alejandro, et al. (författare)
  • Pipelines and Systems for Threshold-Avoiding Quantification of LC-MS/MS Data
  • 2021
  • Ingår i: Analytical Chemistry. - : American Chemical Society (ACS). - 0003-2700 .- 1520-6882. ; 93:32, s. 11215-11224
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)abstract
    • The accurate processing of complex liquid chromatography coupled to tandem mass spectrometry (LC-MS/MS) data from biological samples is a major challenge for metabolomics, proteomics, and related approaches. Here, we present the pipelines and systems for threshold-avoiding quantification (PASTAQ) LC-MS/MS preprocessing toolset, which allows highly accurate quantification of data-dependent acquisition LC-MS/MS datasets. PASTAQ performs compound quantification using single-stage (MS1) data and implements novel algorithms for high-performance and accurate quantification, retention time alignment, feature detection, and linking annotations from multiple identification engines. PASTAQ offers straightforward parameterization and automatic generation of quality control plots for data and preprocessing assessment. This design results in smaller variance when analyzing replicates of proteomes mixed with known ratios and allows the detection of peptides over a larger dynamic concentration range compared to widely used proteomics preprocessing tools. The performance of the pipeline is also demonstrated in a biological human serum dataset for the identification of gender-related proteins.
  •  
Skapa referenser, mejla, bekava och länka
  • Resultat 21-21 av 21
Typ av publikation
tidskriftsartikel (19)
forskningsöversikt (2)
Typ av innehåll
refereegranskat (21)
Författare/redaktör
Bakker, Stephan J. L ... (17)
van der Harst, Pim (13)
Wareham, Nicholas J. (12)
Loos, Ruth J F (12)
Psaty, Bruce M (11)
Gudnason, Vilmundur (11)
visa fler...
Prokopenko, Inga (10)
Teumer, Alexander (10)
Salomaa, Veikko (9)
Campbell, Harry (9)
Rudan, Igor (9)
van Duijn, Cornelia ... (9)
Verweij, Niek (9)
Gieger, Christian (9)
Strauch, Konstantin (9)
Harris, Tamara B (9)
Hayward, Caroline (9)
Boerwinkle, Eric (9)
Ferrucci, Luigi (9)
Vollenweider, Peter (9)
Nolte, Ilja M. (9)
Snieder, Harold (9)
Zhang, Weihua (9)
Kooner, Jaspal S. (9)
Stefansson, Kari (8)
Shuldiner, Alan R. (8)
Luan, Jian'an (8)
Wilson, James F. (8)
Hofman, Albert (8)
Uitterlinden, André ... (8)
Tanaka, Toshiko (8)
Feitosa, Mary F. (8)
Perola, Markus (7)
Raitakari, Olli T (7)
Kuusisto, Johanna (7)
Laakso, Markku (7)
McCarthy, Mark I (7)
Thorsteinsdottir, Un ... (7)
Mangino, Massimo (7)
Peters, Annette (7)
Samani, Nilesh J. (7)
Metspalu, Andres (7)
Munroe, Patricia B. (7)
Hicks, Andrew A. (7)
Pramstaller, Peter P ... (7)
Polasek, Ozren (7)
Esko, Tõnu (7)
Sanna, Serena (7)
Stumvoll, Michael (7)
Morris, Andrew P. (7)
visa färre...
Lärosäte
Uppsala universitet (14)
Lunds universitet (11)
Karolinska Institutet (10)
Göteborgs universitet (7)
Umeå universitet (5)
Högskolan Dalarna (4)
visa fler...
Stockholms universitet (1)
Handelshögskolan i Stockholm (1)
Chalmers tekniska högskola (1)
Karlstads universitet (1)
Sveriges Lantbruksuniversitet (1)
visa färre...
Språk
Engelska (21)
Forskningsämne (UKÄ/SCB)
Medicin och hälsovetenskap (16)
Naturvetenskap (4)
Lantbruksvetenskap (1)

År

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy