Sökning: L773:2047 217X OR L773:2047 217X
> Brakefield Paul M. >
A high-coverage dra...
A high-coverage draft genome of the mycalesine butterfly Bicyclus anynana
-
Nowell, Reuben W. (författare)
-
Elsworth, Ben (författare)
-
Oostra, Vicencio (författare)
-
visa fler...
-
Zwaan, Bas J. (författare)
-
- Wheat, Christopher W. (författare)
- Stockholms universitet,Zoologiska institutionen
-
Saastamoinen, Marjo (författare)
-
Saccheri, Ilik J. (författare)
-
Van't Hof, Arjen E. (författare)
-
Wasik, Bethany R. (författare)
-
Connahs, Heidi (författare)
-
Aslam, Muhammad L. (författare)
-
Kumar, Sujai (författare)
-
Challis, Richard J. (författare)
-
Monteiro, Antonia (författare)
-
Brakefield, Paul M. (författare)
-
Blaxter, Mark (författare)
-
visa färre...
-
(creator_code:org_t)
- 2017-05-09
- 2017
- Engelska.
-
Ingår i: GigaScience. - : Oxford University Press (OUP). - 2047-217X. ; 6:7
- Relaterad länk:
-
https://doi.org/10.1...
-
visa fler...
-
https://academic.oup...
-
https://urn.kb.se/re...
-
https://doi.org/10.1...
-
visa färre...
Abstract
Ämnesord
Stäng
- The mycalesine butterfly Bicyclus anynana, the Squinting bush brown, is a model organism in the study of lepidopteran ecology, development, and evolution. Here, we present a draft genome sequence for B. anynana to serve as a genomics resource for current and future studies of this important model species. Seven libraries with insert sizes ranging from 350 bp to 20 kb were constructed using DNA from an inbred female and sequenced using both Illumina and PacBio technology; 128 Gb of raw Illumina data was filtered to 124 Gb and assembled to a final size of 475 Mb (similar to x260 assembly coverage). Contigs were scaffolded using mate-pair, transcriptome, and PacBio data into 10 800 sequences with an N50 of 638 kb (longest scaffold 5 Mb). The genome is comprised of 26% repetitive elements and encodes a total of 22 642 predicted protein-coding genes. Recovery of a BUSCO set of core metazoan genes was almost complete (98%). Overall, these metrics compare well with other recently published lepidopteran genomes. We report a high-quality draft genome sequence for Bicyclus anynana. The genome assembly and annotated gene models are available at LepBase (http://ensembl.lepbase.org/index.html).
Ämnesord
- NATURVETENSKAP -- Biologi (hsv//swe)
- NATURAL SCIENCES -- Biological Sciences (hsv//eng)
Nyckelord
- bicyclus anynana
- squinting bush brown
- nymphalidae
- nymphalid
- satyrid
- lepidopteran genome
Publikations- och innehållstyp
- ref (ämneskategori)
- art (ämneskategori)
Hitta via bibliotek
Till lärosätets databas
- Av författaren/redakt...
-
Nowell, Reuben W ...
-
Elsworth, Ben
-
Oostra, Vicencio
-
Zwaan, Bas J.
-
Wheat, Christoph ...
-
Saastamoinen, Ma ...
-
visa fler...
-
Saccheri, Ilik J ...
-
Van't Hof, Arjen ...
-
Wasik, Bethany R ...
-
Connahs, Heidi
-
Aslam, Muhammad ...
-
Kumar, Sujai
-
Challis, Richard ...
-
Monteiro, Antoni ...
-
Brakefield, Paul ...
-
Blaxter, Mark
-
visa färre...
- Om ämnet
-
- NATURVETENSKAP
-
NATURVETENSKAP
-
och Biologi
- Artiklar i publikationen
-
GigaScience
- Av lärosätet
-
Stockholms universitet