SwePub
Sök i LIBRIS databas

  Utökad sökning

WFRF:(Cloarec Olivier)
 

Sökning: WFRF:(Cloarec Olivier) > Jackson David > Statistically Integ...

Statistically Integrated Metabonomic-Proteomic Studies on a Human Prostate Cancer Xenograft Model in Mice

Rantalainen, Mattias (författare)
Cloarec, Olivier (författare)
Beckonert, Olaf (författare)
visa fler...
Wilson, I. D. (författare)
Jackson, David (författare)
Tonge, Robert (författare)
Rowlinson, Rachel (författare)
Rayner, Steve (författare)
Nickson, Janice (författare)
Wilkinson, Robert W. (författare)
Mills, Jonathan D. (författare)
Trygg, Johan (författare)
Umeå universitet,Kemiska institutionen,Computational Life Science Cluster (CLiC)
Nicholson, Jeremy K. (författare)
Holmes, Elaine (författare)
visa färre...
 (creator_code:org_t)
2006-09-16
2006
Engelska.
Ingår i: Journal of Proteome Research. - : American Chemical Society (ACS). - 1535-3893 .- 1535-3907. ; 10, s. 2642-55
  • Tidskriftsartikel (refereegranskat)
Abstract Ämnesord
Stäng  
  • A novel statistically integrated proteometabonomic method has been developed and applied to a human tumor xenograft mouse model of prostate cancer. Parallel 2D-DIGE proteomic and 1H NMR metabolic profile data were collected on blood plasma from mice implanted with a prostate cancer (PC-3) xenograft and from matched control animals. To interpret the xenograft-induced differences in plasma profiles, multivariate statistical algorithms including orthogonal projection to latent structure (OPLS) were applied to generate models characterizing the disease profile. Two approaches to integrating metabonomic data matrices are presented based on OPLS algorithms to provide a framework for generating models relating to the specific and common sources of variation in the metabolite concentrations and protein abundances that can be directly related to the disease model. Multiple correlations between metabolites and proteins were found, including associations between serotransferrin precursor and both tyrosine and 3-D-hydroxybutyrate. Additionally, a correlation between decreased concentration of tyrosine and increased presence of gelsolin was also observed. This approach can provide enhanced recovery of combination candidate biomarkers across multi-omic platforms, thus, enhancing understanding of in vivo model systems studied by multiple omic technologies

Ämnesord

NATURVETENSKAP  -- Biologi (hsv//swe)
NATURAL SCIENCES  -- Biological Sciences (hsv//eng)

Nyckelord

NMR
2D DIGE
OPLS
prostate tumor
integration
multivariate

Publikations- och innehållstyp

ref (ämneskategori)
art (ämneskategori)

Hitta via bibliotek

Till lärosätets databas

Kungliga biblioteket hanterar dina personuppgifter i enlighet med EU:s dataskyddsförordning (2018), GDPR. Läs mer om hur det funkar här.
Så här hanterar KB dina uppgifter vid användning av denna tjänst.

 
pil uppåt Stäng

Kopiera och spara länken för att återkomma till aktuell vy